RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494985.5

CUL4A-210, Transcript of cullin 4A, humanhuman

TSL 5

Gene CUL4A, Length 292 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4A-210ENST00000494985 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.25■■■■■ 6.6
CUL4A-210ENST00000494985 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.01■■■■■ 5.6
CUL4A-210ENST00000494985 ABCC9O60706 1549 aa49.11■■■■■ 5.45
CUL4A-210ENST00000494985 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.09■■■■■ 5.13
CUL4A-210ENST00000494985 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.06■■■■■ 5.12
CUL4A-210ENST00000494985 NACADO15069 1562 aa46.99■■■■■ 5.11
CUL4A-210ENST00000494985 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.86■■■■■ 5.09
CUL4A-210ENST00000494985 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.62■■■■■ 5.05
CUL4A-210ENST00000494985 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.44■■■■■ 5.03
CUL4A-210ENST00000494985 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.2■■■■■ 4.99
CUL4A-210ENST00000494985 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.88■■■■■ 4.94
CUL4A-210ENST00000494985 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.79■■■■■ 4.92
CUL4A-210ENST00000494985 SCRIBQ14160 1630 aa45.77■■■■■ 4.92
CUL4A-210ENST00000494985 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.17■■■■■ 4.82
CUL4A-210ENST00000494985 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.06■■■■■ 4.8
CUL4A-210ENST00000494985 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.54■■■■■ 4.72
CUL4A-210ENST00000494985 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.4■■■■■ 4.7
CUL4A-210ENST00000494985 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.06■■■■■ 4.64
CUL4A-210ENST00000494985 SMARCA4P51532 1647 aa43.7■■■■■ 4.59
CUL4A-210ENST00000494985 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.57■■■■■ 4.57
CUL4A-210ENST00000494985 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.45■■■■■ 4.55
CUL4A-210ENST00000494985 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.43■■■■■ 4.54
CUL4A-210ENST00000494985 NCAPD3P42695 1498 aa43.37■■■■■ 4.53
CUL4A-210ENST00000494985 SMARCA2P51531 1590 aa43.33■■■■■ 4.53
CUL4A-210ENST00000494985 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.2■■■■■ 4.51
CUL4A-210ENST00000494985 HMGXB3Q12766 1538 aa43.17■■■■■ 4.5
CUL4A-210ENST00000494985 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.07■■■■■ 4.49
CUL4A-210ENST00000494985 WIZO95785 1651 aa42.99■■■■■ 4.47
CUL4A-210ENST00000494985 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.85■■■■■ 4.45
CUL4A-210ENST00000494985 NESP48681 1621 aa42.53■■■■■ 4.4
CUL4A-210ENST00000494985 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.44■■■■■ 4.38
CUL4A-210ENST00000494985 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.25■■■■■ 4.35
CUL4A-210ENST00000494985 ERCC6Q03468 1493 aa42.24■■■■■ 4.35
CUL4A-210ENST00000494985 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.11■■■■■ 4.33
CUL4A-210ENST00000494985 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.02■■■■■ 4.32
CUL4A-210ENST00000494985 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.96■■■■■ 4.31
CUL4A-210ENST00000494985 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.92■■■■■ 4.3
CUL4A-210ENST00000494985 CFTRP13569 1480 aa41.86■■■■■ 4.29
CUL4A-210ENST00000494985 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.85■■■■■ 4.29
CUL4A-210ENST00000494985 CUX2O14529 1486 aa41.77■■■■■ 4.28
CUL4A-210ENST00000494985 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.76■■■■■ 4.28
CUL4A-210ENST00000494985 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.68■■■■■ 4.26
CUL4A-210ENST00000494985 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.62■■■■■ 4.25
CUL4A-210ENST00000494985 PRDM2Q13029 1718 aa41.61■■■■■ 4.25
CUL4A-210ENST00000494985 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.58■■■■■ 4.25
CUL4A-210ENST00000494985 WDR62O43379 1518 aa41.45■■■■■ 4.23
CUL4A-210ENST00000494985 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
CUL4A-210ENST00000494985 TOPBP1Q92547 1522 aa41.03■■■■■ 4.16
CUL4A-210ENST00000494985 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.95■■■■■ 4.15
CUL4A-210ENST00000494985 ABCC8Q09428 1581 aa40.86■■■■■ 4.13
CUL4A-210ENST00000494985 CUX1P39880 1505 aa40.73■■■■■ 4.11
CUL4A-210ENST00000494985 IFT140Q96RY7 1462 aa40.72■■■■■ 4.11
CUL4A-210ENST00000494985 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.68■■■■■ 4.1
CUL4A-210ENST00000494985 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
CUL4A-210ENST00000494985 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.61■■■■■ 4.09
CUL4A-210ENST00000494985 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.58■■■■■ 4.09
CUL4A-210ENST00000494985 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.58■■■■■ 4.09
CUL4A-210ENST00000494985 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.56■■■■■ 4.08
CUL4A-210ENST00000494985 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.48■■■■■ 4.07
CUL4A-210ENST00000494985 SOGA1O94964 1423 aa40.46■■■■■ 4.07
CUL4A-210ENST00000494985 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.4■■■■■ 4.065e-8■■■□□ 17.4
CUL4A-210ENST00000494985 SYNJ1O43426 1573 aa40.39■■■■■ 4.06
CUL4A-210ENST00000494985 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.38■■■■■ 4.05
CUL4A-210ENST00000494985 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.34■■■■■ 4.05
CUL4A-210ENST00000494985 TOP2BQ02880 1626 aa40.32■■■■■ 4.05
CUL4A-210ENST00000494985 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.3■■■■■ 4.04
CUL4A-210ENST00000494985 WDR97A6NE52 1622 aa40.3■■■■■ 4.04
CUL4A-210ENST00000494985 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.12■■■■■ 4.01
CUL4A-210ENST00000494985 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.04■■■■■ 4
CUL4A-210ENST00000494985 CHD1O14646 1710 aa40.03■■■■■ 4
CUL4A-210ENST00000494985 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.02■■■■■ 4
CUL4A-210ENST00000494985 PBRM1Q86U86 1689 aa40.02■■■■■ 4
CUL4A-210ENST00000494985 OSCARQ8IYS5 282 aa40.01■■■■■ 4
CUL4A-210ENST00000494985 GAPVD1Q14C86 1478 aa40■■■■□ 3.99
CUL4A-210ENST00000494985 GRIN2BQ13224 1484 aa39.99■■■■□ 3.99
CUL4A-210ENST00000494985 FBLN2P98095 1184 aa39.89■■■■□ 3.98
CUL4A-210ENST00000494985 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.87■■■■□ 3.97
CUL4A-210ENST00000494985 SYNJ2O15056 1496 aa39.74■■■■□ 3.95
CUL4A-210ENST00000494985 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.7■■■■□ 3.95
CUL4A-210ENST00000494985 ADAMTS12P58397 1594 aa39.67■■■■□ 3.94
CUL4A-210ENST00000494985 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.62■■■■□ 3.93
CUL4A-210ENST00000494985 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.53■■■■□ 3.92
CUL4A-210ENST00000494985 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.53■■■■□ 3.92
CUL4A-210ENST00000494985 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.53■■■■□ 3.92
CUL4A-210ENST00000494985 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.53■■■■□ 3.92
CUL4A-210ENST00000494985 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.51■■■■□ 3.92
CUL4A-210ENST00000494985 GRIN2AQ12879 1464 aa39.5■■■■□ 3.91
CUL4A-210ENST00000494985 KIF27Q86VH2 1401 aa39.48■■■■□ 3.91
CUL4A-210ENST00000494985 ARHGEF11O15085 1522 aa39.47■■■■□ 3.91
CUL4A-210ENST00000494985 CEP170Q5SW79 1584 aa39.39■■■■□ 3.9
CUL4A-210ENST00000494985 IGF1RP08069 1367 aa39.38■■■■□ 3.89
CUL4A-210ENST00000494985 TRIM41Q8WV44 630 aa39.34■■■■□ 3.89
CUL4A-210ENST00000494985 NUP160Q12769 1436 aa39.31■■■■□ 3.88
CUL4A-210ENST00000494985 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.31■■■■□ 3.88
CUL4A-210ENST00000494985 CUL7Q14999 1698 aa39.28■■■■□ 3.88
CUL4A-210ENST00000494985 ARAP1Q96P48 1450 aa39.18■■■■□ 3.86
CUL4A-210ENST00000494985 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.13■■■■□ 3.85
CUL4A-210ENST00000494985 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.09■■■■□ 3.85
CUL4A-210ENST00000494985 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.09■■■■□ 3.85
CUL4A-210ENST00000494985 SHROOM2Q13796 1616 aa39.07■■■■□ 3.84
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