Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZB2

FAM120A, Constitutive coactivator of PPAR-gamma-like protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM120AQ9NZB2 UPF2-202ENST00000357604 5193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.862e-10■■■■□ 20
FAM120AQ9NZB2 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.22e-10■■■■□ 20
FAM120AQ9NZB2 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.292e-6■■■■□ 20
FAM120AQ9NZB2 NEU4-213ENST00000435934 451 ntTSL 418.41■□□□□ 0.542e-8■■■■□ 20
FAM120AQ9NZB2 EIF4A1-206ENST00000577929 696 ntTSL 220.82■□□□□ 0.926e-20■■■■□ 20
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FAM120AQ9NZB2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.934e-8■■■■□ 20
FAM120AQ9NZB2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.774e-8■■■■□ 20
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FAM120AQ9NZB2 DNAJC11-204ENST00000451196 1357 ntTSL 1 (best)20.98■□□□□ 0.952e-7■■■■□ 20
FAM120AQ9NZB2 DNAJC11-206ENST00000465508 3014 ntTSL 215.41■□□□□ 0.062e-7■■■■□ 20
FAM120AQ9NZB2 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.262e-7■■■■□ 20
FAM120AQ9NZB2 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.121e-6■■■■□ 20
FAM120AQ9NZB2 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.111e-6■■■■□ 20
FAM120AQ9NZB2 RPTOR-211ENST00000577161 3633 ntTSL 211.95□□□□□ -0.51e-6■■■■□ 20
FAM120AQ9NZB2 PRKCZ-204ENST00000461106 1916 ntTSL 217.61■□□□□ 0.411e-6■■■■□ 20
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FAM120AQ9NZB2 PRR11-209ENST00000614081 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.694e-7■■■■□ 20
FAM120AQ9NZB2 PRR11-205ENST00000580177 1641 ntTSL 1 (best)9.7□□□□□ -0.864e-7■■■■□ 20
FAM120AQ9NZB2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.442e-6■■■■□ 20
FAM120AQ9NZB2 AL355312.2-202ENST00000628047 876 ntTSL 54.32□□□□□ -1.722e-6■■■■□ 20
FAM120AQ9NZB2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.187e-9■■■■□ 19.9
FAM120AQ9NZB2 BX322557.1-201ENST00000454115 389 ntTSL 1 (best)21.24■□□□□ 0.997e-9■■■■□ 19.9
FAM120AQ9NZB2 FAM19A5-201ENST00000336769 546 ntTSL 413.13□□□□□ -0.314e-6■■■■□ 19.9
FAM120AQ9NZB2 SEPT9-222ENST00000589070 582 ntTSL 320.19■□□□□ 0.824e-7■■■■□ 19.9
FAM120AQ9NZB2 SEPT9-240ENST00000591833 576 ntTSL 415.69■□□□□ 0.14e-7■■■■□ 19.9
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FAM120AQ9NZB2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.451e-7■■■■□ 19.9
FAM120AQ9NZB2 SDF4-205ENST00000465727 2095 ntTSL 221.51■■□□□ 1.031e-7■■■■□ 19.9
FAM120AQ9NZB2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.681e-7■■■■□ 19.9
FAM120AQ9NZB2 SDF4-203ENST00000403997 728 ntTSL 314.47□□□□□ -0.091e-7■■■■□ 19.9
FAM120AQ9NZB2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.226e-7■■■■□ 19.9
FAM120AQ9NZB2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.176e-7■■■■□ 19.9
FAM120AQ9NZB2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.498e-7■■■■□ 19.9
FAM120AQ9NZB2 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.416e-12■■■■□ 19.9
FAM120AQ9NZB2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.313e-10■■■■□ 19.9
FAM120AQ9NZB2 PIAS3-207ENST00000475261 2679 ntTSL 1 (best)16.18■□□□□ 0.188e-7■■■■□ 19.9
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FAM120AQ9NZB2 PIAS3-203ENST00000393045 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.398e-7■■■■□ 19.9
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FAM120AQ9NZB2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.845e-8■■■■□ 19.9
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FAM120AQ9NZB2 ELMO2-208ENST00000460474 749 ntTSL 517.28■□□□□ 0.362e-10■■■■□ 19.9
FAM120AQ9NZB2 ELMO2-218ENST00000497412 777 ntTSL 59.3□□□□□ -0.922e-10■■■■□ 19.9
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FAM120AQ9NZB2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.561e-10■■■■□ 19.9
FAM120AQ9NZB2 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.512e-9■■■■□ 19.9
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FAM120AQ9NZB2 LARP1-202ENST00000517616 501 ntTSL 54.17□□□□□ -1.746e-9■■■■□ 19.9
FAM120AQ9NZB2 PSTPIP2-203ENST00000588801 1023 ntTSL 517.87■□□□□ 0.457e-7■■■■□ 19.9
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FAM120AQ9NZB2 KIF1B-201ENST00000263934 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.084e-7■■■■□ 19.9
FAM120AQ9NZB2 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.284e-7■■■■□ 19.9
FAM120AQ9NZB2 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.177e-7■■■■□ 19.9
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FAM120AQ9NZB2 XIAP-202ENST00000371199 8591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.992e-7■■■■□ 19.9
FAM120AQ9NZB2 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.382e-7■■■■□ 19.9
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FAM120AQ9NZB2 CTBS-204ENST00000477677 2892 ntTSL 1 (best)16.39■□□□□ 0.218e-7■■■■□ 19.9
FAM120AQ9NZB2 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.348e-7■■■■□ 19.9
FAM120AQ9NZB2 SARDH-206ENST00000427237 1957 ntTSL 218.63■□□□□ 0.572e-7■■■■□ 19.8
FAM120AQ9NZB2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.171e-6■■■■□ 19.8
FAM120AQ9NZB2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.091e-6■■■■□ 19.8
FAM120AQ9NZB2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.486e-11■■■■□ 19.8
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FAM120AQ9NZB2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.874e-15■■■■□ 19.8
FAM120AQ9NZB2 TSC2-221ENST00000568366 767 ntTSL 418.73■□□□□ 0.594e-15■■■■□ 19.8
FAM120AQ9NZB2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.384e-15■■■■□ 19.8
FAM120AQ9NZB2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.364e-15■■■■□ 19.8
FAM120AQ9NZB2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.344e-15■■■■□ 19.8
FAM120AQ9NZB2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.314e-15■■■■□ 19.8
FAM120AQ9NZB2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.264e-15■■■■□ 19.8
FAM120AQ9NZB2 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.074e-15■■■■□ 19.8
FAM120AQ9NZB2 TSC2-206ENST00000439117 5073 ntTSL 1 (best)15.35■□□□□ 0.054e-15■■■■□ 19.8
FAM120AQ9NZB2 TSC2-213ENST00000483020 563 ntTSL 414.53□□□□□ -0.084e-15■■■■□ 19.8
FAM120AQ9NZB2 TSC2-212ENST00000471143 577 ntTSL 413.05□□□□□ -0.324e-15■■■■□ 19.8
FAM120AQ9NZB2 COPB1-209ENST00000533096 547 ntTSL 414.54□□□□□ -0.081e-34■■■■□ 19.8
FAM120AQ9NZB2 COPB1-206ENST00000529210 607 ntTSL 413.13□□□□□ -0.311e-34■■■■□ 19.8
FAM120AQ9NZB2 COPB1-207ENST00000529866 729 ntTSL 211.74□□□□□ -0.531e-34■■■■□ 19.8
FAM120AQ9NZB2 COPB1-201ENST00000249923 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.681e-34■■■■□ 19.8
FAM120AQ9NZB2 COPB1-211ENST00000534234 1584 ntTSL 59.76□□□□□ -0.851e-34■■■■□ 19.8
FAM120AQ9NZB2 COPB1-202ENST00000439561 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.851e-34■■■■□ 19.8
FAM120AQ9NZB2 COPB1-210ENST00000533533 537 ntTSL 49.61□□□□□ -0.871e-34■■■■□ 19.8
FAM120AQ9NZB2 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.071e-34■■■■□ 19.8
FAM120AQ9NZB2 COPB1-212ENST00000534771 576 ntTSL 42.54□□□□□ -21e-34■■■■□ 19.8
FAM120AQ9NZB2 GRPEL1-201ENST00000264954 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.525e-16■■■■□ 19.8
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