Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFNKQ9P0W0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFNKQ9P0W0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFNKQ9P0W0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFNKQ9P0W0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFNKQ9P0W0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFNKQ9P0W0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFNKQ9P0W0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFNKQ9P0W0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFNKQ9P0W0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFNKQ9P0W0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFNKQ9P0W0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IFNKQ9P0W0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFNKQ9P0W0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IFNKQ9P0W0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFNKQ9P0W0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFNKQ9P0W0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFNKQ9P0W0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFNKQ9P0W0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IFNKQ9P0W0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFNKQ9P0W0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IFNKQ9P0W0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IFNKQ9P0W0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFNKQ9P0W0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFNKQ9P0W0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFNKQ9P0W0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFNKQ9P0W0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
IFNKQ9P0W0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFNKQ9P0W0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IFNKQ9P0W0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IFNKQ9P0W0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IFNKQ9P0W0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IFNKQ9P0W0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IFNKQ9P0W0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IFNKQ9P0W0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IFNKQ9P0W0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IFNKQ9P0W0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IFNKQ9P0W0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IFNKQ9P0W0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFNKQ9P0W0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFNKQ9P0W0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFNKQ9P0W0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IFNKQ9P0W0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IFNKQ9P0W0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IFNKQ9P0W0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IFNKQ9P0W0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IFNKQ9P0W0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IFNKQ9P0W0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IFNKQ9P0W0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IFNKQ9P0W0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IFNKQ9P0W0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
IFNKQ9P0W0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
IFNKQ9P0W0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IFNKQ9P0W0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IFNKQ9P0W0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IFNKQ9P0W0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IFNKQ9P0W0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IFNKQ9P0W0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IFNKQ9P0W0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IFNKQ9P0W0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IFNKQ9P0W0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IFNKQ9P0W0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IFNKQ9P0W0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IFNKQ9P0W0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
IFNKQ9P0W0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IFNKQ9P0W0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IFNKQ9P0W0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IFNKQ9P0W0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IFNKQ9P0W0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IFNKQ9P0W0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IFNKQ9P0W0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IFNKQ9P0W0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IFNKQ9P0W0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IFNKQ9P0W0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IFNKQ9P0W0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IFNKQ9P0W0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IFNKQ9P0W0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IFNKQ9P0W0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IFNKQ9P0W0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IFNKQ9P0W0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IFNKQ9P0W0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IFNKQ9P0W0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IFNKQ9P0W0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFNKQ9P0W0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFNKQ9P0W0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFNKQ9P0W0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFNKQ9P0W0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFNKQ9P0W0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFNKQ9P0W0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFNKQ9P0W0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFNKQ9P0W0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFNKQ9P0W0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFNKQ9P0W0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFNKQ9P0W0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFNKQ9P0W0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFNKQ9P0W0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
IFNKQ9P0W0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFNKQ9P0W0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
IFNKQ9P0W0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFNKQ9P0W0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms