Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB8

PPCS, Phosphopantothenate--cysteine ligase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCSQ9HAB8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPCSQ9HAB8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPCSQ9HAB8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPCSQ9HAB8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPCSQ9HAB8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPCSQ9HAB8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPCSQ9HAB8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPCSQ9HAB8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPCSQ9HAB8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPCSQ9HAB8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPCSQ9HAB8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPCSQ9HAB8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPCSQ9HAB8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPCSQ9HAB8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPCSQ9HAB8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPCSQ9HAB8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPCSQ9HAB8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPCSQ9HAB8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPCSQ9HAB8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPCSQ9HAB8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPCSQ9HAB8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPCSQ9HAB8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPCSQ9HAB8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPCSQ9HAB8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPCSQ9HAB8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPCSQ9HAB8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPCSQ9HAB8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPCSQ9HAB8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPCSQ9HAB8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPCSQ9HAB8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPCSQ9HAB8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPCSQ9HAB8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPCSQ9HAB8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPCSQ9HAB8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPCSQ9HAB8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPCSQ9HAB8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPCSQ9HAB8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPCSQ9HAB8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPCSQ9HAB8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPCSQ9HAB8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PPCSQ9HAB8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPCSQ9HAB8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPCSQ9HAB8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPCSQ9HAB8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPCSQ9HAB8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPCSQ9HAB8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPCSQ9HAB8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPCSQ9HAB8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPCSQ9HAB8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPCSQ9HAB8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPCSQ9HAB8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPCSQ9HAB8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPCSQ9HAB8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPCSQ9HAB8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPCSQ9HAB8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPCSQ9HAB8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPCSQ9HAB8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPCSQ9HAB8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPCSQ9HAB8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPCSQ9HAB8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PPCSQ9HAB8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPCSQ9HAB8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPCSQ9HAB8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPCSQ9HAB8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPCSQ9HAB8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPCSQ9HAB8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPCSQ9HAB8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PPCSQ9HAB8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPCSQ9HAB8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPCSQ9HAB8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPCSQ9HAB8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPCSQ9HAB8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPCSQ9HAB8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPCSQ9HAB8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPCSQ9HAB8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPCSQ9HAB8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPCSQ9HAB8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPCSQ9HAB8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPCSQ9HAB8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPCSQ9HAB8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPCSQ9HAB8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPCSQ9HAB8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPCSQ9HAB8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPCSQ9HAB8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPCSQ9HAB8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPCSQ9HAB8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPCSQ9HAB8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPCSQ9HAB8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPCSQ9HAB8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPCSQ9HAB8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPCSQ9HAB8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPCSQ9HAB8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPCSQ9HAB8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPCSQ9HAB8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPCSQ9HAB8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPCSQ9HAB8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPCSQ9HAB8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPCSQ9HAB8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPCSQ9HAB8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPCSQ9HAB8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms