Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E2

XPO4, Exportin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPO4Q9C0E2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
XPO4Q9C0E2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
XPO4Q9C0E2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
XPO4Q9C0E2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
XPO4Q9C0E2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
XPO4Q9C0E2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
XPO4Q9C0E2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
XPO4Q9C0E2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
XPO4Q9C0E2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
XPO4Q9C0E2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
XPO4Q9C0E2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
XPO4Q9C0E2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
XPO4Q9C0E2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
XPO4Q9C0E2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
XPO4Q9C0E2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
XPO4Q9C0E2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
XPO4Q9C0E2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
XPO4Q9C0E2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
XPO4Q9C0E2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
XPO4Q9C0E2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
XPO4Q9C0E2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
XPO4Q9C0E2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
XPO4Q9C0E2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
XPO4Q9C0E2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
XPO4Q9C0E2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
XPO4Q9C0E2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
XPO4Q9C0E2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
XPO4Q9C0E2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
XPO4Q9C0E2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
XPO4Q9C0E2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
XPO4Q9C0E2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
XPO4Q9C0E2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
XPO4Q9C0E2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
XPO4Q9C0E2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
XPO4Q9C0E2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
XPO4Q9C0E2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
XPO4Q9C0E2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
XPO4Q9C0E2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
XPO4Q9C0E2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
XPO4Q9C0E2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
XPO4Q9C0E2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
XPO4Q9C0E2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
XPO4Q9C0E2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
XPO4Q9C0E2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
XPO4Q9C0E2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
XPO4Q9C0E2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
XPO4Q9C0E2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
XPO4Q9C0E2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
XPO4Q9C0E2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
XPO4Q9C0E2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
XPO4Q9C0E2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
XPO4Q9C0E2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
XPO4Q9C0E2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
XPO4Q9C0E2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
XPO4Q9C0E2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
XPO4Q9C0E2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
XPO4Q9C0E2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
XPO4Q9C0E2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
XPO4Q9C0E2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
XPO4Q9C0E2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
XPO4Q9C0E2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
XPO4Q9C0E2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
XPO4Q9C0E2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
XPO4Q9C0E2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
XPO4Q9C0E2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
XPO4Q9C0E2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
XPO4Q9C0E2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
XPO4Q9C0E2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
XPO4Q9C0E2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
XPO4Q9C0E2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
XPO4Q9C0E2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
XPO4Q9C0E2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
XPO4Q9C0E2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
XPO4Q9C0E2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
XPO4Q9C0E2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
XPO4Q9C0E2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
XPO4Q9C0E2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
XPO4Q9C0E2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
XPO4Q9C0E2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
XPO4Q9C0E2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
XPO4Q9C0E2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
XPO4Q9C0E2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
XPO4Q9C0E2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
XPO4Q9C0E2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
XPO4Q9C0E2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
XPO4Q9C0E2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
XPO4Q9C0E2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
XPO4Q9C0E2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
XPO4Q9C0E2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
XPO4Q9C0E2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
XPO4Q9C0E2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
XPO4Q9C0E2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
XPO4Q9C0E2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
XPO4Q9C0E2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
XPO4Q9C0E2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
XPO4Q9C0E2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
XPO4Q9C0E2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
XPO4Q9C0E2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
XPO4Q9C0E2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
XPO4Q9C0E2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1662.7 ms