Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS26

ERP44, Endoplasmic reticulum resident protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP44Q9BS26 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERP44Q9BS26 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERP44Q9BS26 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERP44Q9BS26 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERP44Q9BS26 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERP44Q9BS26 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERP44Q9BS26 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERP44Q9BS26 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERP44Q9BS26 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERP44Q9BS26 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERP44Q9BS26 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERP44Q9BS26 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERP44Q9BS26 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERP44Q9BS26 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERP44Q9BS26 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERP44Q9BS26 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ERP44Q9BS26 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERP44Q9BS26 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERP44Q9BS26 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ERP44Q9BS26 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERP44Q9BS26 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERP44Q9BS26 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ERP44Q9BS26 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERP44Q9BS26 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERP44Q9BS26 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERP44Q9BS26 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERP44Q9BS26 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERP44Q9BS26 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERP44Q9BS26 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERP44Q9BS26 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERP44Q9BS26 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERP44Q9BS26 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERP44Q9BS26 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERP44Q9BS26 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERP44Q9BS26 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERP44Q9BS26 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERP44Q9BS26 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERP44Q9BS26 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERP44Q9BS26 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERP44Q9BS26 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERP44Q9BS26 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERP44Q9BS26 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERP44Q9BS26 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERP44Q9BS26 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERP44Q9BS26 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERP44Q9BS26 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERP44Q9BS26 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERP44Q9BS26 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERP44Q9BS26 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERP44Q9BS26 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERP44Q9BS26 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERP44Q9BS26 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERP44Q9BS26 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERP44Q9BS26 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERP44Q9BS26 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERP44Q9BS26 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERP44Q9BS26 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERP44Q9BS26 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERP44Q9BS26 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERP44Q9BS26 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERP44Q9BS26 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERP44Q9BS26 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERP44Q9BS26 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ERP44Q9BS26 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ERP44Q9BS26 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERP44Q9BS26 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERP44Q9BS26 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERP44Q9BS26 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERP44Q9BS26 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERP44Q9BS26 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERP44Q9BS26 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERP44Q9BS26 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERP44Q9BS26 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERP44Q9BS26 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERP44Q9BS26 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERP44Q9BS26 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERP44Q9BS26 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERP44Q9BS26 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERP44Q9BS26 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERP44Q9BS26 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERP44Q9BS26 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERP44Q9BS26 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERP44Q9BS26 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERP44Q9BS26 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERP44Q9BS26 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERP44Q9BS26 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERP44Q9BS26 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ERP44Q9BS26 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERP44Q9BS26 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERP44Q9BS26 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERP44Q9BS26 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERP44Q9BS26 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERP44Q9BS26 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERP44Q9BS26 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ERP44Q9BS26 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERP44Q9BS26 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERP44Q9BS26 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERP44Q9BS26 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERP44Q9BS26 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERP44Q9BS26 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms