Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIKE1Q9BRV8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIKE1Q9BRV8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIKE1Q9BRV8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIKE1Q9BRV8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIKE1Q9BRV8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIKE1Q9BRV8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIKE1Q9BRV8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIKE1Q9BRV8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIKE1Q9BRV8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIKE1Q9BRV8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIKE1Q9BRV8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIKE1Q9BRV8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SIKE1Q9BRV8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIKE1Q9BRV8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIKE1Q9BRV8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIKE1Q9BRV8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIKE1Q9BRV8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIKE1Q9BRV8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIKE1Q9BRV8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIKE1Q9BRV8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIKE1Q9BRV8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIKE1Q9BRV8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIKE1Q9BRV8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIKE1Q9BRV8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIKE1Q9BRV8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIKE1Q9BRV8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIKE1Q9BRV8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIKE1Q9BRV8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIKE1Q9BRV8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIKE1Q9BRV8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIKE1Q9BRV8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIKE1Q9BRV8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIKE1Q9BRV8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIKE1Q9BRV8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIKE1Q9BRV8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIKE1Q9BRV8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIKE1Q9BRV8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIKE1Q9BRV8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIKE1Q9BRV8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIKE1Q9BRV8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIKE1Q9BRV8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIKE1Q9BRV8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIKE1Q9BRV8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIKE1Q9BRV8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIKE1Q9BRV8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIKE1Q9BRV8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIKE1Q9BRV8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIKE1Q9BRV8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIKE1Q9BRV8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIKE1Q9BRV8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIKE1Q9BRV8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIKE1Q9BRV8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SIKE1Q9BRV8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIKE1Q9BRV8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIKE1Q9BRV8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIKE1Q9BRV8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIKE1Q9BRV8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIKE1Q9BRV8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SIKE1Q9BRV8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIKE1Q9BRV8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIKE1Q9BRV8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIKE1Q9BRV8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIKE1Q9BRV8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIKE1Q9BRV8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIKE1Q9BRV8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIKE1Q9BRV8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIKE1Q9BRV8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIKE1Q9BRV8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIKE1Q9BRV8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SIKE1Q9BRV8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SIKE1Q9BRV8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIKE1Q9BRV8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIKE1Q9BRV8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIKE1Q9BRV8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIKE1Q9BRV8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIKE1Q9BRV8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIKE1Q9BRV8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIKE1Q9BRV8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIKE1Q9BRV8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIKE1Q9BRV8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIKE1Q9BRV8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIKE1Q9BRV8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIKE1Q9BRV8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIKE1Q9BRV8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SIKE1Q9BRV8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIKE1Q9BRV8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIKE1Q9BRV8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIKE1Q9BRV8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIKE1Q9BRV8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIKE1Q9BRV8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SIKE1Q9BRV8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SIKE1Q9BRV8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIKE1Q9BRV8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIKE1Q9BRV8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIKE1Q9BRV8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIKE1Q9BRV8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIKE1Q9BRV8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIKE1Q9BRV8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIKE1Q9BRV8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 320.8 ms