Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4A7

SFXN4, Sideroflexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN4Q6P4A7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFXN4Q6P4A7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFXN4Q6P4A7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFXN4Q6P4A7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFXN4Q6P4A7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFXN4Q6P4A7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFXN4Q6P4A7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFXN4Q6P4A7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFXN4Q6P4A7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFXN4Q6P4A7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFXN4Q6P4A7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFXN4Q6P4A7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFXN4Q6P4A7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFXN4Q6P4A7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFXN4Q6P4A7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFXN4Q6P4A7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFXN4Q6P4A7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFXN4Q6P4A7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SFXN4Q6P4A7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFXN4Q6P4A7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFXN4Q6P4A7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFXN4Q6P4A7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFXN4Q6P4A7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFXN4Q6P4A7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFXN4Q6P4A7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFXN4Q6P4A7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFXN4Q6P4A7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFXN4Q6P4A7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFXN4Q6P4A7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFXN4Q6P4A7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFXN4Q6P4A7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFXN4Q6P4A7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFXN4Q6P4A7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFXN4Q6P4A7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SFXN4Q6P4A7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFXN4Q6P4A7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFXN4Q6P4A7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SFXN4Q6P4A7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFXN4Q6P4A7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFXN4Q6P4A7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFXN4Q6P4A7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFXN4Q6P4A7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFXN4Q6P4A7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFXN4Q6P4A7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFXN4Q6P4A7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFXN4Q6P4A7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFXN4Q6P4A7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFXN4Q6P4A7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SFXN4Q6P4A7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFXN4Q6P4A7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFXN4Q6P4A7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFXN4Q6P4A7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SFXN4Q6P4A7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFXN4Q6P4A7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFXN4Q6P4A7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFXN4Q6P4A7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFXN4Q6P4A7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFXN4Q6P4A7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFXN4Q6P4A7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFXN4Q6P4A7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFXN4Q6P4A7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFXN4Q6P4A7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFXN4Q6P4A7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFXN4Q6P4A7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFXN4Q6P4A7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFXN4Q6P4A7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFXN4Q6P4A7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFXN4Q6P4A7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFXN4Q6P4A7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFXN4Q6P4A7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFXN4Q6P4A7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SFXN4Q6P4A7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SFXN4Q6P4A7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFXN4Q6P4A7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFXN4Q6P4A7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFXN4Q6P4A7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFXN4Q6P4A7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFXN4Q6P4A7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFXN4Q6P4A7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFXN4Q6P4A7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFXN4Q6P4A7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFXN4Q6P4A7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFXN4Q6P4A7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFXN4Q6P4A7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFXN4Q6P4A7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFXN4Q6P4A7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFXN4Q6P4A7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SFXN4Q6P4A7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFXN4Q6P4A7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFXN4Q6P4A7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFXN4Q6P4A7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFXN4Q6P4A7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SFXN4Q6P4A7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFXN4Q6P4A7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFXN4Q6P4A7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFXN4Q6P4A7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFXN4Q6P4A7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SFXN4Q6P4A7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SFXN4Q6P4A7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SFXN4Q6P4A7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms