Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4A7

SFXN4, Sideroflexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN4Q6P4A7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SFXN4Q6P4A7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SFXN4Q6P4A7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SFXN4Q6P4A7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SFXN4Q6P4A7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SFXN4Q6P4A7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SFXN4Q6P4A7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SFXN4Q6P4A7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SFXN4Q6P4A7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SFXN4Q6P4A7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SFXN4Q6P4A7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SFXN4Q6P4A7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SFXN4Q6P4A7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SFXN4Q6P4A7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SFXN4Q6P4A7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SFXN4Q6P4A7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SFXN4Q6P4A7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SFXN4Q6P4A7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SFXN4Q6P4A7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SFXN4Q6P4A7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SFXN4Q6P4A7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SFXN4Q6P4A7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SFXN4Q6P4A7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SFXN4Q6P4A7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SFXN4Q6P4A7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SFXN4Q6P4A7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SFXN4Q6P4A7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SFXN4Q6P4A7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SFXN4Q6P4A7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SFXN4Q6P4A7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SFXN4Q6P4A7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SFXN4Q6P4A7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SFXN4Q6P4A7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SFXN4Q6P4A7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SFXN4Q6P4A7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SFXN4Q6P4A7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SFXN4Q6P4A7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SFXN4Q6P4A7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SFXN4Q6P4A7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SFXN4Q6P4A7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SFXN4Q6P4A7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SFXN4Q6P4A7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SFXN4Q6P4A7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SFXN4Q6P4A7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SFXN4Q6P4A7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SFXN4Q6P4A7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SFXN4Q6P4A7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SFXN4Q6P4A7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SFXN4Q6P4A7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SFXN4Q6P4A7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SFXN4Q6P4A7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SFXN4Q6P4A7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SFXN4Q6P4A7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SFXN4Q6P4A7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SFXN4Q6P4A7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SFXN4Q6P4A7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SFXN4Q6P4A7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SFXN4Q6P4A7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SFXN4Q6P4A7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SFXN4Q6P4A7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SFXN4Q6P4A7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SFXN4Q6P4A7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SFXN4Q6P4A7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SFXN4Q6P4A7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SFXN4Q6P4A7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SFXN4Q6P4A7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SFXN4Q6P4A7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SFXN4Q6P4A7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SFXN4Q6P4A7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SFXN4Q6P4A7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SFXN4Q6P4A7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SFXN4Q6P4A7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SFXN4Q6P4A7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SFXN4Q6P4A7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SFXN4Q6P4A7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SFXN4Q6P4A7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFXN4Q6P4A7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFXN4Q6P4A7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFXN4Q6P4A7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SFXN4Q6P4A7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SFXN4Q6P4A7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SFXN4Q6P4A7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SFXN4Q6P4A7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SFXN4Q6P4A7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SFXN4Q6P4A7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SFXN4Q6P4A7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SFXN4Q6P4A7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SFXN4Q6P4A7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SFXN4Q6P4A7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SFXN4Q6P4A7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SFXN4Q6P4A7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SFXN4Q6P4A7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SFXN4Q6P4A7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SFXN4Q6P4A7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SFXN4Q6P4A7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SFXN4Q6P4A7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SFXN4Q6P4A7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SFXN4Q6P4A7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SFXN4Q6P4A7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SFXN4Q6P4A7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms