Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT1

ZNF260, Zinc finger protein 260, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260Q3ZCT1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF260Q3ZCT1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF260Q3ZCT1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF260Q3ZCT1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF260Q3ZCT1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF260Q3ZCT1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF260Q3ZCT1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF260Q3ZCT1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF260Q3ZCT1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF260Q3ZCT1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF260Q3ZCT1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF260Q3ZCT1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF260Q3ZCT1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF260Q3ZCT1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF260Q3ZCT1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF260Q3ZCT1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF260Q3ZCT1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF260Q3ZCT1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF260Q3ZCT1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF260Q3ZCT1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZNF260Q3ZCT1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF260Q3ZCT1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF260Q3ZCT1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF260Q3ZCT1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF260Q3ZCT1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF260Q3ZCT1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF260Q3ZCT1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF260Q3ZCT1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF260Q3ZCT1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ZNF260Q3ZCT1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ZNF260Q3ZCT1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF260Q3ZCT1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF260Q3ZCT1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF260Q3ZCT1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF260Q3ZCT1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF260Q3ZCT1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF260Q3ZCT1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF260Q3ZCT1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF260Q3ZCT1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF260Q3ZCT1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF260Q3ZCT1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF260Q3ZCT1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF260Q3ZCT1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF260Q3ZCT1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF260Q3ZCT1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF260Q3ZCT1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF260Q3ZCT1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF260Q3ZCT1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF260Q3ZCT1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF260Q3ZCT1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF260Q3ZCT1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF260Q3ZCT1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF260Q3ZCT1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF260Q3ZCT1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF260Q3ZCT1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF260Q3ZCT1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF260Q3ZCT1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF260Q3ZCT1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF260Q3ZCT1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF260Q3ZCT1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF260Q3ZCT1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF260Q3ZCT1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF260Q3ZCT1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF260Q3ZCT1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF260Q3ZCT1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF260Q3ZCT1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF260Q3ZCT1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF260Q3ZCT1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF260Q3ZCT1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF260Q3ZCT1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF260Q3ZCT1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF260Q3ZCT1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF260Q3ZCT1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF260Q3ZCT1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF260Q3ZCT1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF260Q3ZCT1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF260Q3ZCT1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF260Q3ZCT1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF260Q3ZCT1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF260Q3ZCT1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF260Q3ZCT1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF260Q3ZCT1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF260Q3ZCT1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF260Q3ZCT1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF260Q3ZCT1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF260Q3ZCT1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF260Q3ZCT1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF260Q3ZCT1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF260Q3ZCT1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF260Q3ZCT1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF260Q3ZCT1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF260Q3ZCT1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF260Q3ZCT1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF260Q3ZCT1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF260Q3ZCT1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF260Q3ZCT1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF260Q3ZCT1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF260Q3ZCT1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF260Q3ZCT1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF260Q3ZCT1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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