Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FXNQ16595 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FXNQ16595 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FXNQ16595 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FXNQ16595 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
FXNQ16595 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FXNQ16595 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FXNQ16595 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FXNQ16595 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FXNQ16595 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FXNQ16595 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FXNQ16595 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FXNQ16595 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FXNQ16595 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FXNQ16595 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FXNQ16595 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FXNQ16595 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FXNQ16595 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FXNQ16595 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FXNQ16595 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FXNQ16595 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FXNQ16595 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FXNQ16595 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FXNQ16595 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FXNQ16595 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FXNQ16595 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FXNQ16595 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FXNQ16595 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FXNQ16595 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FXNQ16595 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FXNQ16595 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FXNQ16595 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FXNQ16595 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FXNQ16595 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FXNQ16595 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FXNQ16595 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FXNQ16595 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FXNQ16595 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FXNQ16595 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FXNQ16595 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FXNQ16595 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FXNQ16595 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FXNQ16595 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FXNQ16595 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FXNQ16595 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FXNQ16595 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FXNQ16595 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FXNQ16595 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FXNQ16595 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FXNQ16595 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FXNQ16595 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FXNQ16595 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FXNQ16595 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FXNQ16595 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FXNQ16595 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FXNQ16595 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FXNQ16595 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FXNQ16595 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FXNQ16595 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FXNQ16595 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FXNQ16595 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FXNQ16595 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FXNQ16595 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FXNQ16595 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FXNQ16595 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FXNQ16595 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FXNQ16595 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FXNQ16595 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FXNQ16595 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FXNQ16595 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FXNQ16595 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FXNQ16595 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FXNQ16595 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FXNQ16595 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FXNQ16595 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FXNQ16595 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FXNQ16595 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FXNQ16595 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FXNQ16595 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FXNQ16595 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FXNQ16595 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FXNQ16595 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FXNQ16595 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FXNQ16595 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FXNQ16595 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FXNQ16595 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FXNQ16595 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FXNQ16595 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FXNQ16595 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FXNQ16595 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FXNQ16595 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FXNQ16595 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FXNQ16595 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FXNQ16595 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FXNQ16595 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FXNQ16595 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FXNQ16595 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FXNQ16595 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FXNQ16595 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FXNQ16595 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
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