Protein–RNA interactions for Protein: P55916

UCP3, Mitochondrial uncoupling protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UCP3P55916 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UCP3P55916 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UCP3P55916 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UCP3P55916 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UCP3P55916 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UCP3P55916 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UCP3P55916 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UCP3P55916 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UCP3P55916 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UCP3P55916 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UCP3P55916 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UCP3P55916 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UCP3P55916 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UCP3P55916 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UCP3P55916 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UCP3P55916 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UCP3P55916 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UCP3P55916 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UCP3P55916 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UCP3P55916 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UCP3P55916 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UCP3P55916 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UCP3P55916 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UCP3P55916 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UCP3P55916 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UCP3P55916 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UCP3P55916 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UCP3P55916 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UCP3P55916 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UCP3P55916 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UCP3P55916 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UCP3P55916 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UCP3P55916 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UCP3P55916 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UCP3P55916 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UCP3P55916 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UCP3P55916 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UCP3P55916 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UCP3P55916 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UCP3P55916 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UCP3P55916 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UCP3P55916 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UCP3P55916 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UCP3P55916 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UCP3P55916 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UCP3P55916 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UCP3P55916 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UCP3P55916 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
UCP3P55916 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UCP3P55916 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UCP3P55916 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UCP3P55916 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UCP3P55916 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UCP3P55916 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UCP3P55916 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UCP3P55916 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
UCP3P55916 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UCP3P55916 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UCP3P55916 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UCP3P55916 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UCP3P55916 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UCP3P55916 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UCP3P55916 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UCP3P55916 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UCP3P55916 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UCP3P55916 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UCP3P55916 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UCP3P55916 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UCP3P55916 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UCP3P55916 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UCP3P55916 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UCP3P55916 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UCP3P55916 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UCP3P55916 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
UCP3P55916 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UCP3P55916 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UCP3P55916 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UCP3P55916 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UCP3P55916 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UCP3P55916 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UCP3P55916 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UCP3P55916 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UCP3P55916 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UCP3P55916 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UCP3P55916 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UCP3P55916 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UCP3P55916 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UCP3P55916 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UCP3P55916 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UCP3P55916 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UCP3P55916 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UCP3P55916 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UCP3P55916 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UCP3P55916 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UCP3P55916 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UCP3P55916 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UCP3P55916 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UCP3P55916 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UCP3P55916 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UCP3P55916 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212.3 ms