Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BGNP21810 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BGNP21810 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BGNP21810 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BGNP21810 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BGNP21810 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BGNP21810 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BGNP21810 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BGNP21810 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BGNP21810 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BGNP21810 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BGNP21810 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BGNP21810 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BGNP21810 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BGNP21810 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BGNP21810 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BGNP21810 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BGNP21810 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BGNP21810 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
BGNP21810 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BGNP21810 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BGNP21810 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BGNP21810 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BGNP21810 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BGNP21810 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BGNP21810 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BGNP21810 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
BGNP21810 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
BGNP21810 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BGNP21810 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BGNP21810 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BGNP21810 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BGNP21810 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BGNP21810 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BGNP21810 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BGNP21810 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BGNP21810 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BGNP21810 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BGNP21810 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BGNP21810 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BGNP21810 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BGNP21810 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BGNP21810 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BGNP21810 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BGNP21810 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BGNP21810 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BGNP21810 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BGNP21810 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BGNP21810 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BGNP21810 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BGNP21810 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BGNP21810 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BGNP21810 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BGNP21810 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BGNP21810 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BGNP21810 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BGNP21810 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BGNP21810 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BGNP21810 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BGNP21810 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BGNP21810 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BGNP21810 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BGNP21810 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BGNP21810 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BGNP21810 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BGNP21810 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BGNP21810 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BGNP21810 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BGNP21810 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BGNP21810 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BGNP21810 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BGNP21810 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BGNP21810 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BGNP21810 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BGNP21810 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BGNP21810 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BGNP21810 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BGNP21810 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BGNP21810 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BGNP21810 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BGNP21810 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BGNP21810 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BGNP21810 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BGNP21810 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BGNP21810 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BGNP21810 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BGNP21810 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BGNP21810 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BGNP21810 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BGNP21810 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BGNP21810 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BGNP21810 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BGNP21810 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BGNP21810 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BGNP21810 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BGNP21810 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BGNP21810 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BGNP21810 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BGNP21810 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BGNP21810 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms