Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT4P19013 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT4P19013 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT4P19013 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT4P19013 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT4P19013 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT4P19013 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT4P19013 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT4P19013 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT4P19013 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT4P19013 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT4P19013 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT4P19013 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT4P19013 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT4P19013 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT4P19013 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT4P19013 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT4P19013 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT4P19013 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT4P19013 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT4P19013 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT4P19013 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT4P19013 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT4P19013 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT4P19013 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KRT4P19013 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT4P19013 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT4P19013 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT4P19013 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT4P19013 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT4P19013 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT4P19013 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT4P19013 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT4P19013 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT4P19013 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT4P19013 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT4P19013 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT4P19013 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT4P19013 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT4P19013 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT4P19013 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT4P19013 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT4P19013 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT4P19013 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT4P19013 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT4P19013 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT4P19013 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT4P19013 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT4P19013 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT4P19013 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT4P19013 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT4P19013 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT4P19013 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT4P19013 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT4P19013 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT4P19013 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT4P19013 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT4P19013 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT4P19013 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT4P19013 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT4P19013 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT4P19013 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT4P19013 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT4P19013 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT4P19013 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT4P19013 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT4P19013 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT4P19013 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT4P19013 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT4P19013 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT4P19013 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT4P19013 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT4P19013 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT4P19013 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT4P19013 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT4P19013 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT4P19013 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT4P19013 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT4P19013 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT4P19013 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT4P19013 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT4P19013 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT4P19013 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT4P19013 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT4P19013 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT4P19013 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT4P19013 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT4P19013 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT4P19013 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT4P19013 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT4P19013 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT4P19013 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT4P19013 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT4P19013 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT4P19013 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT4P19013 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KRT4P19013 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT4P19013 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT4P19013 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT4P19013 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms