Protein–RNA interactions for Protein: P34059

GALNS, N-acetylgalactosamine-6-sulfatase, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNSP34059 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GALNSP34059 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GALNSP34059 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GALNSP34059 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GALNSP34059 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GALNSP34059 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GALNSP34059 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GALNSP34059 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GALNSP34059 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GALNSP34059 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GALNSP34059 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GALNSP34059 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GALNSP34059 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GALNSP34059 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GALNSP34059 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GALNSP34059 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GALNSP34059 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GALNSP34059 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GALNSP34059 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GALNSP34059 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GALNSP34059 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GALNSP34059 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GALNSP34059 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GALNSP34059 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GALNSP34059 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GALNSP34059 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GALNSP34059 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GALNSP34059 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GALNSP34059 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GALNSP34059 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GALNSP34059 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GALNSP34059 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GALNSP34059 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GALNSP34059 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GALNSP34059 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GALNSP34059 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GALNSP34059 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GALNSP34059 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GALNSP34059 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GALNSP34059 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GALNSP34059 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GALNSP34059 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GALNSP34059 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GALNSP34059 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GALNSP34059 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GALNSP34059 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GALNSP34059 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GALNSP34059 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GALNSP34059 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GALNSP34059 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GALNSP34059 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GALNSP34059 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GALNSP34059 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GALNSP34059 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GALNSP34059 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GALNSP34059 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GALNSP34059 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GALNSP34059 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GALNSP34059 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GALNSP34059 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GALNSP34059 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GALNSP34059 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GALNSP34059 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GALNSP34059 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GALNSP34059 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GALNSP34059 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GALNSP34059 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GALNSP34059 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GALNSP34059 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GALNSP34059 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GALNSP34059 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GALNSP34059 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GALNSP34059 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GALNSP34059 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GALNSP34059 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GALNSP34059 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GALNSP34059 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GALNSP34059 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GALNSP34059 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GALNSP34059 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GALNSP34059 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GALNSP34059 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GALNSP34059 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GALNSP34059 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GALNSP34059 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GALNSP34059 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALNSP34059 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALNSP34059 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALNSP34059 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALNSP34059 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GALNSP34059 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GALNSP34059 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GALNSP34059 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GALNSP34059 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GALNSP34059 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALNSP34059 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GALNSP34059 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALNSP34059 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALNSP34059 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GALNSP34059 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.4 ms