Protein–RNA interactions for Protein: P34059

GALNS, N-acetylgalactosamine-6-sulfatase, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNSP34059 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
GALNSP34059 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GALNSP34059 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
GALNSP34059 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
GALNSP34059 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GALNSP34059 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
GALNSP34059 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
GALNSP34059 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
GALNSP34059 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GALNSP34059 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GALNSP34059 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GALNSP34059 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GALNSP34059 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GALNSP34059 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GALNSP34059 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GALNSP34059 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GALNSP34059 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GALNSP34059 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
GALNSP34059 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GALNSP34059 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GALNSP34059 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GALNSP34059 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GALNSP34059 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GALNSP34059 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GALNSP34059 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GALNSP34059 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GALNSP34059 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.2
GALNSP34059 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GALNSP34059 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GALNSP34059 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GALNSP34059 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GALNSP34059 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GALNSP34059 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GALNSP34059 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GALNSP34059 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GALNSP34059 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GALNSP34059 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GALNSP34059 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GALNSP34059 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GALNSP34059 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GALNSP34059 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GALNSP34059 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GALNSP34059 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GALNSP34059 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GALNSP34059 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GALNSP34059 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GALNSP34059 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GALNSP34059 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GALNSP34059 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GALNSP34059 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GALNSP34059 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GALNSP34059 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GALNSP34059 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GALNSP34059 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GALNSP34059 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GALNSP34059 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GALNSP34059 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GALNSP34059 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GALNSP34059 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GALNSP34059 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GALNSP34059 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GALNSP34059 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GALNSP34059 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GALNSP34059 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GALNSP34059 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GALNSP34059 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GALNSP34059 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
GALNSP34059 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GALNSP34059 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GALNSP34059 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GALNSP34059 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GALNSP34059 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GALNSP34059 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GALNSP34059 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GALNSP34059 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GALNSP34059 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GALNSP34059 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GALNSP34059 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GALNSP34059 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GALNSP34059 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GALNSP34059 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GALNSP34059 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GALNSP34059 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GALNSP34059 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GALNSP34059 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GALNSP34059 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GALNSP34059 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GALNSP34059 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GALNSP34059 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GALNSP34059 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GALNSP34059 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GALNSP34059 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GALNSP34059 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GALNSP34059 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GALNSP34059 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GALNSP34059 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GALNSP34059 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GALNSP34059 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GALNSP34059 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GALNSP34059 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms