RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299155.9

AMN-201, Transcript of amnion associated transmembrane protein, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene AMN, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMN-201ENST00000299155 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.27■■■■■ 6.92
AMN-201ENST00000299155 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.45■■■■■ 5.67
AMN-201ENST00000299155 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.1■■■■■ 5.45
AMN-201ENST00000299155 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.18■■■■■ 5.3
AMN-201ENST00000299155 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.02■■■■■ 5.28
AMN-201ENST00000299155 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.84■■■■■ 5.25
AMN-201ENST00000299155 ABCC9O60706 1549 aa47.52■■■■■ 5.2
AMN-201ENST00000299155 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.34■■■■■ 5.17
AMN-201ENST00000299155 NACADO15069 1562 aa46.82■■■■■ 5.09
AMN-201ENST00000299155 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.54■■■■■ 5.04
AMN-201ENST00000299155 SCRIBQ14160 1630 aa46.52■■■■■ 5.04
AMN-201ENST00000299155 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.25■■■■■ 4.99
AMN-201ENST00000299155 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.49■■■■■ 4.87
AMN-201ENST00000299155 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.39■■■■■ 4.86
AMN-201ENST00000299155 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.25■■■■■ 4.83
AMN-201ENST00000299155 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.06■■■■■ 4.8
AMN-201ENST00000299155 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.96■■■■■ 4.79
AMN-201ENST00000299155 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.92■■■■■ 4.78
AMN-201ENST00000299155 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.9■■■■■ 4.78
AMN-201ENST00000299155 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.82■■■■■ 4.775e-8■■■■□ 23.3
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AMN-201ENST00000299155 SMARCA4P51532 1647 aa44.64■■■■■ 4.74
AMN-201ENST00000299155 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.26■■■■■ 4.68
AMN-201ENST00000299155 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.08■■■■■ 4.65
AMN-201ENST00000299155 SMARCA2P51531 1590 aa43.89■■■■■ 4.62
AMN-201ENST00000299155 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.85■■■■■ 4.61
AMN-201ENST00000299155 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.84■■■■■ 4.61
AMN-201ENST00000299155 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.74■■■■■ 4.59
AMN-201ENST00000299155 TRIM41Q8WV44 630 aa43.69■■■■■ 4.59
AMN-201ENST00000299155 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.51■■■■■ 4.56
AMN-201ENST00000299155 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.26■■■■■ 4.52
AMN-201ENST00000299155 NCAPD3P42695 1498 aa43.24■■■■■ 4.51
AMN-201ENST00000299155 HMGXB3Q12766 1538 aa43.23■■■■■ 4.51
AMN-201ENST00000299155 ABCC8Q09428 1581 aa43.15■■■■■ 4.5
AMN-201ENST00000299155 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.93■■■■■ 4.46
AMN-201ENST00000299155 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.89■■■■■ 4.46
AMN-201ENST00000299155 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.78■■■■■ 4.44
AMN-201ENST00000299155 SYNJ1O43426 1573 aa42.59■■■■■ 4.41
AMN-201ENST00000299155 EEA1Q15075 1411 aa42.53■■■■■ 4.4
AMN-201ENST00000299155 SOGA1O94964 1423 aa42.49■■■■■ 4.39
AMN-201ENST00000299155 CFTRP13569 1480 aa42.48■■■■■ 4.39
AMN-201ENST00000299155 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.44■■■■■ 4.38
AMN-201ENST00000299155 TOP2BQ02880 1626 aa42.35■■■■■ 4.37
AMN-201ENST00000299155 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.3■■■■■ 4.36
AMN-201ENST00000299155 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.3■■■■■ 4.36
AMN-201ENST00000299155 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.28■■■■■ 4.36
AMN-201ENST00000299155 PRDM2Q13029 1718 aa42.28■■■■■ 4.36
AMN-201ENST00000299155 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.22■■■■■ 4.35
AMN-201ENST00000299155 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.17■■■■■ 4.34
AMN-201ENST00000299155 CUX1P39880 1505 aa42.08■■■■■ 4.33
AMN-201ENST00000299155 PCGF6Q9BYE7 350 aa42■■■■■ 4.31
AMN-201ENST00000299155 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.99■■■■■ 4.31
AMN-201ENST00000299155 GOLGA3Q08378 1498 aa41.97■■■■■ 4.31
AMN-201ENST00000299155 KIF21BO75037 1637 aa41.95■■■■■ 4.31
AMN-201ENST00000299155 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.91■■■■■ 4.3
AMN-201ENST00000299155 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP41.83■■■■■ 4.29
AMN-201ENST00000299155 CEP162Q5TB80 1403 aa41.82■■■■■ 4.28
AMN-201ENST00000299155 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.72■■■■■ 4.27
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AMN-201ENST00000299155 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.63■■■■■ 4.26
AMN-201ENST00000299155 KIF27Q86VH2 1401 aa41.62■■■■■ 4.25
AMN-201ENST00000299155 NESP48681 1621 aa41.6■■■■■ 4.25
AMN-201ENST00000299155 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.59■■■■■ 4.25
AMN-201ENST00000299155 PRXQ9BXM0 1461 aa41.55■■■■■ 4.24
AMN-201ENST00000299155 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.54■■■■■ 4.24
AMN-201ENST00000299155 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.5■■■■■ 4.23
AMN-201ENST00000299155 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.47■■■■■ 4.23
AMN-201ENST00000299155 HRCP23327 699 aa41.4■■■■■ 4.22
AMN-201ENST00000299155 CUX2O14529 1486 aa41.35■■■■■ 4.21
AMN-201ENST00000299155 TOPBP1Q92547 1522 aa41.35■■■■■ 4.21
AMN-201ENST00000299155 CLIP1P30622 1438 aa41.33■■■■■ 4.21
AMN-201ENST00000299155 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.28■■■■■ 4.2
AMN-201ENST00000299155 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.2■■■■■ 4.19
AMN-201ENST00000299155 IGF1RP08069 1367 aa41.2■■■■■ 4.19
AMN-201ENST00000299155 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.17■■■■■ 4.18
AMN-201ENST00000299155 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.16■■■■■ 4.18
AMN-201ENST00000299155 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP41.14■■■■■ 4.18
AMN-201ENST00000299155 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.08■■■■■ 4.17
AMN-201ENST00000299155 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.08■■■■■ 4.17
AMN-201ENST00000299155 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.08■■■■■ 4.17
AMN-201ENST00000299155 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.99■■■■■ 4.15
AMN-201ENST00000299155 WDR97A6NE52 1622 aa40.96■■■■■ 4.15
AMN-201ENST00000299155 ARAP1Q96P48 1450 aa40.87■■■■■ 4.13
AMN-201ENST00000299155 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.83■■■■■ 4.13
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AMN-201ENST00000299155 ERCC6Q03468 1493 aa40.78■■■■■ 4.12
AMN-201ENST00000299155 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.77■■■■■ 4.12
AMN-201ENST00000299155 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.72■■■■■ 4.11
AMN-201ENST00000299155 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.72■■■■■ 4.11
AMN-201ENST00000299155 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.69■■■■■ 4.1
AMN-201ENST00000299155 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
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AMN-201ENST00000299155 APLP2Q06481 763 aa40.61■■■■■ 4.09
AMN-201ENST00000299155 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.6■■■■■ 4.09
AMN-201ENST00000299155 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP40.5■■■■■ 4.07
AMN-201ENST00000299155 WDR62O43379 1518 aa40.5■■■■■ 4.07
AMN-201ENST00000299155 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.45■■■■■ 4.07
AMN-201ENST00000299155 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.37■■■■■ 4.05
AMN-201ENST00000299155 PBRM1Q86U86 1689 aa40.34■■■■■ 4.05
AMN-201ENST00000299155 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.34■■■■■ 4.05
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