Protein–RNA interactions for Protein: Q96T37

RBM15, Putative RNA-binding protein 15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 977 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM15Q96T37 PTPN7-202ENST00000367279 3265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.311e-6■■■■□ 23.6
RBM15Q96T37 PTPN7-201ENST00000309017 3765 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.511e-6■■■■□ 23.6
RBM15Q96T37 NFRKB-211ENST00000532225 938 ntTSL 523.09■■□□□ 1.292e-6■■■■□ 23.6
RBM15Q96T37 NFRKB-206ENST00000529319 843 ntTSL 323.09■■□□□ 1.292e-6■■■■□ 23.6
RBM15Q96T37 YTHDF3-204ENST00000522282 445 ntTSL 320.73■□□□□ 0.912e-6■■■■□ 23.6
RBM15Q96T37 YTHDF3-203ENST00000519428 676 ntTSL 215.91■□□□□ 0.142e-6■■■■□ 23.6
RBM15Q96T37 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.181e-6■■■■□ 23.6
RBM15Q96T37 GTPBP6-202ENST00000485332 2016 ntTSL 219.54■□□□□ 0.721e-6■■■■□ 23.6
RBM15Q96T37 C1GALT1-205ENST00000436587 6235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.265e-7■■■■□ 23.6
RBM15Q96T37 C1GALT1-201ENST00000223122 6078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.035e-7■■■■□ 23.6
RBM15Q96T37 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.655e-7■■■■□ 23.6
RBM15Q96T37 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.143e-6■■■■□ 23.6
RBM15Q96T37 ZNF627-203ENST00000587939 591 ntTSL 413.79□□□□□ -0.23e-6■■■■□ 23.6
RBM15Q96T37 ZNF627-201ENST00000361113 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.413e-6■■■■□ 23.6
RBM15Q96T37 ZNF627-204ENST00000588174 2755 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.463e-6■■■■□ 23.6
RBM15Q96T37 POLR1A-203ENST00000409681 6454 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.745e-9■■■■□ 23.6
RBM15Q96T37 ZNF627-206ENST00000593279 588 ntTSL 49.97□□□□□ -0.813e-6■■■■□ 23.6
RBM15Q96T37 ZNF627-202ENST00000585493 541 ntTSL 48.65□□□□□ -1.023e-6■■■■□ 23.6
RBM15Q96T37 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.295e-9■■■■□ 23.6
RBM15Q96T37 CLDN12-213ENST00000496677 1098 ntTSL 1 (best)12.4□□□□□ -0.421e-7■■■■□ 23.6
RBM15Q96T37 CLDN12-204ENST00000416322 1163 ntTSL 59.69□□□□□ -0.861e-7■■■■□ 23.6
RBM15Q96T37 CLDN12-202ENST00000394604 846 ntTSL 59.27□□□□□ -0.931e-7■■■■□ 23.6
RBM15Q96T37 AC006153.1-201ENST00000480135 371 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.021e-7■■■■□ 23.6
RBM15Q96T37 CLDN12-201ENST00000287916 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.041e-7■■■■□ 23.6
RBM15Q96T37 CLDN12-205ENST00000427904 618 ntTSL 37.6□□□□□ -1.191e-7■■■■□ 23.6
RBM15Q96T37 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.461e-7■■■■□ 23.6
RBM15Q96T37 CLDN12-206ENST00000451941 527 ntTSL 35.58□□□□□ -1.521e-7■■■■□ 23.6
RBM15Q96T37 CLDN12-210ENST00000483862 338 ntTSL 25.44□□□□□ -1.541e-7■■■■□ 23.6
RBM15Q96T37 CLDN12-214ENST00000498033 420 ntTSL 35□□□□□ -1.611e-7■■■■□ 23.6
RBM15Q96T37 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.741e-6■■■■□ 23.6
RBM15Q96T37 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.493e-6■■■■□ 23.6
RBM15Q96T37 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.13e-6■■■■□ 23.6
RBM15Q96T37 DNMT1-227ENST00000592342 636 ntTSL 320.93■□□□□ 0.945e-6■■■■□ 23.6
RBM15Q96T37 DNMT1-216ENST00000588952 841 ntTSL 520.27■□□□□ 0.845e-6■■■■□ 23.6
RBM15Q96T37 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.095e-6■■■■□ 23.6
RBM15Q96T37 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.494e-7■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 REPIN1-216ENST00000518462 621 ntTSL 418.07■□□□□ 0.484e-7■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 SRCAP-205ENST00000483083 5937 ntTSL 211.11□□□□□ -0.637e-7■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.512e-7■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.815e-7■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 IL4I1-208ENST00000601717 2261 ntTSL 1 (best)19.96■□□□□ 0.795e-7■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.525e-7■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.495e-7■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 IL4I1-206ENST00000596022 747 ntTSL 217.14■□□□□ 0.335e-7■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.185e-7■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 NUP62-208ENST00000596217 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.35e-7■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 NUP62-201ENST00000352066 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.315e-7■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 IL4I1-207ENST00000597295 651 ntTSL 312.64□□□□□ -0.395e-7■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 IL4I1-205ENST00000596011 714 ntTSL 212.54□□□□□ -0.45e-7■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 NUP62-202ENST00000422090 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.715e-7■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.491e-9■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.41e-9■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.381e-9■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.881e-9■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.363e-7■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.13e-7■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.993e-7■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.893e-7■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.383e-7■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.722e-6■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 CD46-214ENST00000480003 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.862e-10■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 CD46-202ENST00000322918 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.892e-10■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 CD46-206ENST00000360212 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.952e-10■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 CD46-209ENST00000367047 3089 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.992e-10■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 CD46-205ENST00000358170 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -12e-10■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 CD46-208ENST00000367042 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.012e-10■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 CD46-203ENST00000354848 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.082e-10■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.092e-10■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.092e-10■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.12e-10■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 CD46-212ENST00000469535 7826 ntTSL 1 (best)7.29□□□□□ -1.242e-10■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 CD46-211ENST00000464082 567 ntTSL 26.66□□□□□ -1.342e-10■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 15e-9■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.011e-6■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 SLC43A3-207ENST00000526125 554 ntTSL 519.66■□□□□ 0.741e-6■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 SLC43A3-224ENST00000533245 589 ntTSL 519.66■□□□□ 0.741e-6■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 SLC43A3-213ENST00000529494 560 ntTSL 419.59■□□□□ 0.731e-6■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 SLC43A3-217ENST00000530005 1434 ntTSL 1 (best)19.35■□□□□ 0.691e-6■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.381e-6■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 SLC43A3-210ENST00000528187 648 ntTSL 517.2■□□□□ 0.341e-6■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 SLC43A3-209ENST00000528098 1260 ntTSL 214.73□□□□□ -0.051e-6■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 SLC43A3-211ENST00000529112 653 ntTSL 514.71□□□□□ -0.051e-6■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.071e-6■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 SLC43A3-223ENST00000533235 581 ntTSL 514.46□□□□□ -0.091e-6■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 SLC43A3-221ENST00000532795 587 ntTSL 414.46□□□□□ -0.091e-6■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 SLC43A3-222ENST00000533051 571 ntTSL 214.27□□□□□ -0.131e-6■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 SLC43A3-208ENST00000526621 562 ntTSL 413.7□□□□□ -0.221e-6■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 SLC43A3-204ENST00000524863 539 ntTSL 313.7□□□□□ -0.221e-6■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 SLC43A3-216ENST00000529896 494 ntTSL 413.62□□□□□ -0.231e-6■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 SLC43A3-202ENST00000395123 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.41e-6■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 SLC43A3-201ENST00000352187 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.641e-6■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 SLC43A3-206ENST00000525474 801 ntTSL 510.2□□□□□ -0.781e-6■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.814e-8■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.894e-8■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 ANKRD10-211ENST00000603993 704 ntTSL 28.59□□□□□ -1.037e-12■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 ANKRD10-208ENST00000485844 641 ntTSL 28□□□□□ -1.137e-12■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.591e-6■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.931e-7■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 MBD3-209ENST00000592012 2379 ntTSL 520.7■□□□□ 0.91e-6■■■■□ 23.5
RBM15Q96T37 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.831e-6■■■■□ 23.5
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