RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528187.5

SLC43A3-210, Transcript of solute carrier family 43 member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SLC43A3, Length 648 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A3-210ENST00000528187 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.89■■■■■ 4.46
SLC43A3-210ENST00000528187 ABCC9O60706 1549 aa38.45■■■■□ 3.75
SLC43A3-210ENST00000528187 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.35■■■■□ 3.73
SLC43A3-210ENST00000528187 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.53■■■■□ 3.44
SLC43A3-210ENST00000528187 NACADO15069 1562 aa36.31■■■■□ 3.4
SLC43A3-210ENST00000528187 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.22■■■■□ 3.39
SLC43A3-210ENST00000528187 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.1■■■■□ 3.37
SLC43A3-210ENST00000528187 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.85■■■■□ 3.33
SLC43A3-210ENST00000528187 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.83■■■■□ 3.33
SLC43A3-210ENST00000528187 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.64■■■■□ 3.3
SLC43A3-210ENST00000528187 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.56■■■■□ 3.28
SLC43A3-210ENST00000528187 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.52■■■■□ 3.28
SLC43A3-210ENST00000528187 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.4■■■■□ 3.26
SLC43A3-210ENST00000528187 SCRIBQ14160 1630 aa35.03■■■■□ 3.2
SLC43A3-210ENST00000528187 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.99■■■■□ 3.19
SLC43A3-210ENST00000528187 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.67■■■■□ 3.14
SLC43A3-210ENST00000528187 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.63■■■■□ 3.13
SLC43A3-210ENST00000528187 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.61■■■■□ 3.13
SLC43A3-210ENST00000528187 NCAPD3P42695 1498 aa33.58■■■□□ 2.97
SLC43A3-210ENST00000528187 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.5■■■□□ 2.95
SLC43A3-210ENST00000528187 SMARCA4P51532 1647 aa33.41■■■□□ 2.94
SLC43A3-210ENST00000528187 SMARCA2P51531 1590 aa33.33■■■□□ 2.93
SLC43A3-210ENST00000528187 HMGXB3Q12766 1538 aa33.28■■■□□ 2.92
SLC43A3-210ENST00000528187 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.25■■■□□ 2.91
SLC43A3-210ENST00000528187 ERCC6Q03468 1493 aa33.14■■■□□ 2.9
SLC43A3-210ENST00000528187 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.13■■■□□ 2.89
SLC43A3-210ENST00000528187 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.09■■■□□ 2.89
SLC43A3-210ENST00000528187 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.08■■■□□ 2.89
SLC43A3-210ENST00000528187 CUX2O14529 1486 aa33.06■■■□□ 2.88
SLC43A3-210ENST00000528187 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.05■■■□□ 2.88
SLC43A3-210ENST00000528187 NESP48681 1621 aa33.05■■■□□ 2.88
SLC43A3-210ENST00000528187 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.75■■■□□ 2.83
SLC43A3-210ENST00000528187 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.64■■■□□ 2.82
SLC43A3-210ENST00000528187 WIZO95785 1651 aa32.62■■■□□ 2.81
SLC43A3-210ENST00000528187 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.59■■■□□ 2.81
SLC43A3-210ENST00000528187 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.57■■■□□ 2.8
SLC43A3-210ENST00000528187 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.52■■■□□ 2.8
SLC43A3-210ENST00000528187 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.43■■■□□ 2.78
SLC43A3-210ENST00000528187 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.32■■■□□ 2.76
SLC43A3-210ENST00000528187 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
SLC43A3-210ENST00000528187 WDR62O43379 1518 aa32.22■■■□□ 2.75
SLC43A3-210ENST00000528187 CFTRP13569 1480 aa32.2■■■□□ 2.75
SLC43A3-210ENST00000528187 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.18■■■□□ 2.74
SLC43A3-210ENST00000528187 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.18■■■□□ 2.74
SLC43A3-210ENST00000528187 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.93■■■□□ 2.7
SLC43A3-210ENST00000528187 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.91■■■□□ 2.7
SLC43A3-210ENST00000528187 PRDM2Q13029 1718 aa31.69■■■□□ 2.66
SLC43A3-210ENST00000528187 TRIM41Q8WV44 630 aa31.62■■■□□ 2.65
SLC43A3-210ENST00000528187 OSCARQ8IYS5 282 aa31.6■■■□□ 2.65
SLC43A3-210ENST00000528187 TOPBP1Q92547 1522 aa31.58■■■□□ 2.65
SLC43A3-210ENST00000528187 IFT140Q96RY7 1462 aa31.56■■■□□ 2.64
SLC43A3-210ENST00000528187 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.54■■■□□ 2.64
SLC43A3-210ENST00000528187 ABCC8Q09428 1581 aa31.46■■■□□ 2.63
SLC43A3-210ENST00000528187 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.43■■■□□ 2.62
SLC43A3-210ENST00000528187 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.3■■■□□ 2.6
SLC43A3-210ENST00000528187 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
SLC43A3-210ENST00000528187 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.27■■■□□ 2.61e-9■■■■■ 38.7
SLC43A3-210ENST00000528187 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.27■■■□□ 2.6
SLC43A3-210ENST00000528187 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.18■■■□□ 2.58
SLC43A3-210ENST00000528187 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.13■■■□□ 2.57
SLC43A3-210ENST00000528187 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.13■■■□□ 2.57
SLC43A3-210ENST00000528187 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.13■■■□□ 2.57
SLC43A3-210ENST00000528187 SOGA1O94964 1423 aa31.13■■■□□ 2.57
SLC43A3-210ENST00000528187 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.09■■■□□ 2.57
SLC43A3-210ENST00000528187 ARHGEF11O15085 1522 aa31.08■■■□□ 2.57
SLC43A3-210ENST00000528187 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.08■■■□□ 2.57
SLC43A3-210ENST00000528187 CUX1P39880 1505 aa31.06■■■□□ 2.56
SLC43A3-210ENST00000528187 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
SLC43A3-210ENST00000528187 FBLN2P98095 1184 aa31.03■■■□□ 2.56
SLC43A3-210ENST00000528187 CHD1O14646 1710 aa31■■■□□ 2.55
SLC43A3-210ENST00000528187 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.92■■■□□ 2.54
SLC43A3-210ENST00000528187 WDR97A6NE52 1622 aa30.88■■■□□ 2.53
SLC43A3-210ENST00000528187 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.88■■■□□ 2.53
SLC43A3-210ENST00000528187 GRIN2BQ13224 1484 aa30.82■■■□□ 2.53
SLC43A3-210ENST00000528187 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
SLC43A3-210ENST00000528187 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
SLC43A3-210ENST00000528187 ARAP1Q96P48 1450 aa30.8■■■□□ 2.52
SLC43A3-210ENST00000528187 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.73■■■□□ 2.51
SLC43A3-210ENST00000528187 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.73■■■□□ 2.51
SLC43A3-210ENST00000528187 SYNJ2O15056 1496 aa30.72■■■□□ 2.51
SLC43A3-210ENST00000528187 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.72■■■□□ 2.51
SLC43A3-210ENST00000528187 SYNJ1O43426 1573 aa30.66■■■□□ 2.5
SLC43A3-210ENST00000528187 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.63■■■□□ 2.49
SLC43A3-210ENST00000528187 PBRM1Q86U86 1689 aa30.62■■■□□ 2.49
SLC43A3-210ENST00000528187 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.6■■■□□ 2.49
SLC43A3-210ENST00000528187 TOP2BQ02880 1626 aa30.52■■■□□ 2.48
SLC43A3-210ENST00000528187 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.51■■■□□ 2.47
SLC43A3-210ENST00000528187 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
SLC43A3-210ENST00000528187 GRIN2AQ12879 1464 aa30.44■■■□□ 2.46
SLC43A3-210ENST00000528187 ADAMTS12P58397 1594 aa30.41■■■□□ 2.46
SLC43A3-210ENST00000528187 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.36■■■□□ 2.45
SLC43A3-210ENST00000528187 NUP160Q12769 1436 aa30.36■■■□□ 2.45
SLC43A3-210ENST00000528187 CEP170Q5SW79 1584 aa30.32■■■□□ 2.45
SLC43A3-210ENST00000528187 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.3■■■□□ 2.44
SLC43A3-210ENST00000528187 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.29■■■□□ 2.44
SLC43A3-210ENST00000528187 SHROOM2Q13796 1616 aa30.15■■■□□ 2.42
SLC43A3-210ENST00000528187 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
SLC43A3-210ENST00000528187 JPH4Q96JJ6 628 aa30.06■■■□□ 2.4
SLC43A3-210ENST00000528187 IGF1RP08069 1367 aa30.01■■■□□ 2.39
SLC43A3-210ENST00000528187 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.97■■■□□ 2.39
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