RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476342.1

HOXB3-208, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,420 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-208ENST00000476342 NISCHQ9Y2I1 1504 aa70.94■■■■■ 8.95
HOXB3-208ENST00000476342 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa62.94■■■■■ 7.67
HOXB3-208ENST00000476342 ABCC9O60706 1549 aa61.06■■■■■ 7.36
HOXB3-208ENST00000476342 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP59.21■■■■■ 7.07
HOXB3-208ENST00000476342 DCAF8L2P0C7V8 631 aa59.06■■■■■ 7.05
HOXB3-208ENST00000476342 NACADO15069 1562 aa59.04■■■■■ 7.04
HOXB3-208ENST00000476342 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa59■■■■■ 7.04
HOXB3-208ENST00000476342 MYO15BQ96JP2 1530 aa58.83■■■■■ 7.01
HOXB3-208ENST00000476342 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa58.75■■■■■ 7
HOXB3-208ENST00000476342 UNC13AQ9UPW8 1703 aa57.67■■■■■ 6.82
HOXB3-208ENST00000476342 SCRIBQ14160 1630 aa57.42■■■■■ 6.78
HOXB3-208ENST00000476342 BICRAQ9NZM4 1560 aa57.13■■■■■ 6.74
HOXB3-208ENST00000476342 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP57.08■■■■■ 6.73
HOXB3-208ENST00000476342 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa56.67■■■■■ 6.66
HOXB3-208ENST00000476342 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP55.63■■■■■ 6.5
HOXB3-208ENST00000476342 DNAJC5BQ9UF47 199 aa55.51■■■■■ 6.48
HOXB3-208ENST00000476342 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa55.28■■■■■ 6.44
HOXB3-208ENST00000476342 CECR2Q9BXF3 1484 aa55.16■■■■■ 6.42
HOXB3-208ENST00000476342 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP55■■■■■ 6.39
HOXB3-208ENST00000476342 SMARCA4P51532 1647 aa54.98■■■■■ 6.39
HOXB3-208ENST00000476342 MROH2BQ7Z745 1585 aa54.66■■■■■ 6.34
HOXB3-208ENST00000476342 SMARCA2P51531 1590 aa54.54■■■■■ 6.32
HOXB3-208ENST00000476342 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa54.53■■■■■ 6.32
HOXB3-208ENST00000476342 PEG3Q9GZU2 1588 aa54.43■■■■■ 6.3
HOXB3-208ENST00000476342 NCAPD3P42695 1498 aa54.43■■■■■ 6.3
HOXB3-208ENST00000476342 HMGXB3Q12766 1538 aa54.26■■■■■ 6.28
HOXB3-208ENST00000476342 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP54.19■■■■■ 6.27
HOXB3-208ENST00000476342 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP54.15■■■■■ 6.26
HOXB3-208ENST00000476342 WIZO95785 1651 aa54.12■■■■■ 6.25
HOXB3-208ENST00000476342 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP53.6■■■■■ 6.17
HOXB3-208ENST00000476342 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP53.17■■■■■ 6.1
HOXB3-208ENST00000476342 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa52.98■■■■■ 6.07
HOXB3-208ENST00000476342 NESP48681 1621 aa52.95■■■■■ 6.07
HOXB3-208ENST00000476342 CCDC88BA6NC98 1476 aa52.92■■■■■ 6.06
HOXB3-208ENST00000476342 CADPSQ9ULU8 1353 aa52.87■■■■■ 6.05
HOXB3-208ENST00000476342 CFTRP13569 1480 aa52.66■■■■■ 6.02
HOXB3-208ENST00000476342 ERCC6Q03468 1493 aa52.65■■■■■ 6.02
HOXB3-208ENST00000476342 PDS5BQ9NTI5 1447 aa52.59■■■■■ 6.01
HOXB3-208ENST00000476342 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa52.42■■■■■ 5.98
HOXB3-208ENST00000476342 PRDM2Q13029 1718 aa52.4■■■■■ 5.98
HOXB3-208ENST00000476342 FANCD2Q9BXW9 1451 aa52.28■■■■■ 5.96
HOXB3-208ENST00000476342 CEP164Q9UPV0 1460 aa52.2■■■■■ 5.95
HOXB3-208ENST00000476342 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP52.11■■■■■ 5.93
HOXB3-208ENST00000476342 MRC2Q9UBG0 1479 aa52■■■■■ 5.92
HOXB3-208ENST00000476342 CUX2O14529 1486 aa51.92■■■■■ 5.9
HOXB3-208ENST00000476342 WDR62O43379 1518 aa51.83■■■■■ 5.89
HOXB3-208ENST00000476342 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP51.7■■■■■ 5.87
HOXB3-208ENST00000476342 ABCC8Q09428 1581 aa51.56■■■■■ 5.85
HOXB3-208ENST00000476342 DNMBPQ6XZF7 1577 aa51.5■■■■■ 5.83
HOXB3-208ENST00000476342 TOPBP1Q92547 1522 aa51.5■■■■■ 5.83
HOXB3-208ENST00000476342 CUX1P39880 1505 aa51.26■■■■■ 5.8
HOXB3-208ENST00000476342 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP51.13■■■■■ 5.78
HOXB3-208ENST00000476342 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP51.08■■■■■ 5.77
HOXB3-208ENST00000476342 IFT140Q96RY7 1462 aa51.07■■■■■ 5.77
HOXB3-208ENST00000476342 FGD5Q6ZNL6 1462 aa51.03■■■■■ 5.76
HOXB3-208ENST00000476342 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa50.99■■■■■ 5.75
HOXB3-208ENST00000476342 TOP2BQ02880 1626 aa50.98■■■■■ 5.75
HOXB3-208ENST00000476342 SYNJ1O43426 1573 aa50.96■■■■■ 5.75
HOXB3-208ENST00000476342 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP50.89■■■■■ 5.74
HOXB3-208ENST00000476342 SOGA1O94964 1423 aa50.88■■■■■ 5.73
HOXB3-208ENST00000476342 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa50.82■■■■■ 5.73
HOXB3-208ENST00000476342 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP50.75■■■■■ 5.71
HOXB3-208ENST00000476342 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP50.64■■■■■ 5.7
HOXB3-208ENST00000476342 WDR97A6NE52 1622 aa50.62■■■■■ 5.69
HOXB3-208ENST00000476342 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa50.57■■■■■ 5.69
HOXB3-208ENST00000476342 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP50.52■■■■■ 5.682e-7■■■■□ 21.2
HOXB3-208ENST00000476342 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP50.51■■■■■ 5.68
HOXB3-208ENST00000476342 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa50.34■■■■■ 5.65
HOXB3-208ENST00000476342 GAPVD1Q14C86 1478 aa50.31■■■■■ 5.64
HOXB3-208ENST00000476342 GRIN2BQ13224 1484 aa50.25■■■■■ 5.63
HOXB3-208ENST00000476342 TRIM41Q8WV44 630 aa50.23■■■■■ 5.63
HOXB3-208ENST00000476342 PBRM1Q86U86 1689 aa50.23■■■■■ 5.63
HOXB3-208ENST00000476342 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa50.11■■■■■ 5.61
HOXB3-208ENST00000476342 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP50.09■■■■■ 5.61
HOXB3-208ENST00000476342 KIF27Q86VH2 1401 aa50.04■■■■■ 5.6
HOXB3-208ENST00000476342 ERICH3Q5RHP9 1530 aa50■■■■■ 5.59
HOXB3-208ENST00000476342 CHD1O14646 1710 aa49.92■■■■■ 5.58
HOXB3-208ENST00000476342 SYNJ2O15056 1496 aa49.88■■■■■ 5.58
HOXB3-208ENST00000476342 CHIC1Q5VXU3 224 aa49.87■■■■■ 5.57
HOXB3-208ENST00000476342 FBLN2P98095 1184 aa49.85■■■■■ 5.57
HOXB3-208ENST00000476342 ADAMTS12P58397 1594 aa49.83■■■■■ 5.57
HOXB3-208ENST00000476342 OSCARQ8IYS5 282 aa49.82■■■■■ 5.57
HOXB3-208ENST00000476342 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP49.8■■■■■ 5.56
HOXB3-208ENST00000476342 FHAD1B1AJZ9 1412 aa49.75■■■■■ 5.56
HOXB3-208ENST00000476342 IGF1RP08069 1367 aa49.71■■■■■ 5.55
HOXB3-208ENST00000476342 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49.71■■■■■ 5.55
HOXB3-208ENST00000476342 CUL7Q14999 1698 aa49.67■■■■■ 5.54
HOXB3-208ENST00000476342 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa49.64■■■■■ 5.54
HOXB3-208ENST00000476342 GRIN2AQ12879 1464 aa49.61■■■■■ 5.53
HOXB3-208ENST00000476342 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa49.46■■■■■ 5.51
HOXB3-208ENST00000476342 EEA1Q15075 1411 aa49.42■■■■■ 5.5
HOXB3-208ENST00000476342 CLASP1Q7Z460 1538 aa49.35■■■■■ 5.49
HOXB3-208ENST00000476342 NUP160Q12769 1436 aa49.35■■■■■ 5.49
HOXB3-208ENST00000476342 CEP170Q5SW79 1584 aa49.33■■■■■ 5.49
HOXB3-208ENST00000476342 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa49.25■■■■■ 5.47
HOXB3-208ENST00000476342 CSRNP3Q8WYN3 585 aa49.22■■■■■ 5.47
HOXB3-208ENST00000476342 PRXQ9BXM0 1461 aa49.16■■■■■ 5.46
HOXB3-208ENST00000476342 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP49.13■■■■■ 5.46
HOXB3-208ENST00000476342 ARHGEF11O15085 1522 aa49.03■■■■■ 5.44
HOXB3-208ENST00000476342 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa49.01■■■■■ 5.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms