RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.37■■■■■ 6.94
HOXB3-202ENST00000460160 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.09■■■■■ 5.93
HOXB3-202ENST00000460160 ABCC9O60706 1549 aa51.36■■■■■ 5.81
HOXB3-202ENST00000460160 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.21■■■■■ 5.47
HOXB3-202ENST00000460160 NACADO15069 1562 aa49.06■■■■■ 5.44
HOXB3-202ENST00000460160 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.88■■■■■ 5.41
HOXB3-202ENST00000460160 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.62■■■■■ 5.37
HOXB3-202ENST00000460160 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.54■■■■■ 5.36
HOXB3-202ENST00000460160 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.27■■■■■ 5.32
HOXB3-202ENST00000460160 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.19■■■■■ 5.3
HOXB3-202ENST00000460160 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.91■■■■■ 5.26
HOXB3-202ENST00000460160 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.8■■■■■ 5.24
HOXB3-202ENST00000460160 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.55■■■■■ 5.2
HOXB3-202ENST00000460160 SCRIBQ14160 1630 aa47.5■■■■■ 5.19
HOXB3-202ENST00000460160 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.19■■■■■ 5.15
HOXB3-202ENST00000460160 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.54■■■■■ 5.04
HOXB3-202ENST00000460160 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.46■■■■■ 5.03
HOXB3-202ENST00000460160 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.19■■■■■ 4.98
HOXB3-202ENST00000460160 SMARCA4P51532 1647 aa45.4■■■■■ 4.86
HOXB3-202ENST00000460160 NCAPD3P42695 1498 aa45.27■■■■■ 4.84
HOXB3-202ENST00000460160 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.26■■■■■ 4.84
HOXB3-202ENST00000460160 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.24■■■■■ 4.83
HOXB3-202ENST00000460160 SMARCA2P51531 1590 aa45.16■■■■■ 4.82
HOXB3-202ENST00000460160 HMGXB3Q12766 1538 aa45.02■■■■■ 4.8
HOXB3-202ENST00000460160 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.99■■■■■ 4.79
HOXB3-202ENST00000460160 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.96■■■■■ 4.79
HOXB3-202ENST00000460160 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.83■■■■■ 4.77
HOXB3-202ENST00000460160 WIZO95785 1651 aa44.5■■■■■ 4.71
HOXB3-202ENST00000460160 NESP48681 1621 aa44.35■■■■■ 4.69
HOXB3-202ENST00000460160 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.32■■■■■ 4.68
HOXB3-202ENST00000460160 ERCC6Q03468 1493 aa44.27■■■■■ 4.68
HOXB3-202ENST00000460160 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.14■■■■■ 4.66
HOXB3-202ENST00000460160 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.98■■■■■ 4.63
HOXB3-202ENST00000460160 CUX2O14529 1486 aa43.97■■■■■ 4.63
HOXB3-202ENST00000460160 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.92■■■■■ 4.62
HOXB3-202ENST00000460160 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.84■■■■■ 4.61
HOXB3-202ENST00000460160 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.83■■■■■ 4.61
HOXB3-202ENST00000460160 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.78■■■■■ 4.6
HOXB3-202ENST00000460160 CFTRP13569 1480 aa43.59■■■■■ 4.57
HOXB3-202ENST00000460160 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.46■■■■■ 4.55
HOXB3-202ENST00000460160 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.43■■■■■ 4.54
HOXB3-202ENST00000460160 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.43■■■■■ 4.54
HOXB3-202ENST00000460160 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.41■■■■■ 4.54
HOXB3-202ENST00000460160 WDR62O43379 1518 aa43.33■■■■■ 4.53
HOXB3-202ENST00000460160 PRDM2Q13029 1718 aa43.28■■■■■ 4.52
HOXB3-202ENST00000460160 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.11■■■■■ 4.49
HOXB3-202ENST00000460160 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.04■■■■■ 4.48
HOXB3-202ENST00000460160 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.84■■■■■ 4.45
HOXB3-202ENST00000460160 TOPBP1Q92547 1522 aa42.7■■■■■ 4.43
HOXB3-202ENST00000460160 ABCC8Q09428 1581 aa42.63■■■■■ 4.41
HOXB3-202ENST00000460160 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.61■■■■■ 4.41
HOXB3-202ENST00000460160 IFT140Q96RY7 1462 aa42.51■■■■■ 4.4
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.39■■■■■ 4.38
HOXB3-202ENST00000460160 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.31■■■■■ 4.36
HOXB3-202ENST00000460160 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.29■■■■■ 4.36
HOXB3-202ENST00000460160 CUX1P39880 1505 aa42.24■■■■■ 4.35
HOXB3-202ENST00000460160 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.21■■■■■ 4.35
HOXB3-202ENST00000460160 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.14■■■■■ 4.34
HOXB3-202ENST00000460160 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.13■■■■■ 4.34
HOXB3-202ENST00000460160 SOGA1O94964 1423 aa42.09■■■■■ 4.33
HOXB3-202ENST00000460160 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.09■■■■■ 4.332e-7■■■■□ 21.2
HOXB3-202ENST00000460160 OSCARQ8IYS5 282 aa42.05■■■■■ 4.32
HOXB3-202ENST00000460160 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.93■■■■■ 4.3
HOXB3-202ENST00000460160 WDR97A6NE52 1622 aa41.89■■■■■ 4.3
HOXB3-202ENST00000460160 CHD1O14646 1710 aa41.78■■■■■ 4.28
HOXB3-202ENST00000460160 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.77■■■■■ 4.28
HOXB3-202ENST00000460160 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.77■■■■■ 4.28
HOXB3-202ENST00000460160 TOP2BQ02880 1626 aa41.76■■■■■ 4.28
HOXB3-202ENST00000460160 SYNJ1O43426 1573 aa41.74■■■■■ 4.27
HOXB3-202ENST00000460160 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.71■■■■■ 4.27
HOXB3-202ENST00000460160 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.69■■■■■ 4.26
HOXB3-202ENST00000460160 GRIN2BQ13224 1484 aa41.66■■■■■ 4.26
HOXB3-202ENST00000460160 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.62■■■■■ 4.25
HOXB3-202ENST00000460160 FBLN2P98095 1184 aa41.61■■■■■ 4.25
HOXB3-202ENST00000460160 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.61■■■■■ 4.25
HOXB3-202ENST00000460160 PBRM1Q86U86 1689 aa41.6■■■■■ 4.25
HOXB3-202ENST00000460160 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.6■■■■■ 4.25
HOXB3-202ENST00000460160 TRIM41Q8WV44 630 aa41.49■■■■■ 4.23
HOXB3-202ENST00000460160 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.48■■■■■ 4.23
HOXB3-202ENST00000460160 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.48■■■■■ 4.23
HOXB3-202ENST00000460160 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.48■■■■■ 4.23
HOXB3-202ENST00000460160 SYNJ2O15056 1496 aa41.45■■■■■ 4.23
HOXB3-202ENST00000460160 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.44■■■■■ 4.22
HOXB3-202ENST00000460160 ARHGEF11O15085 1522 aa41.42■■■■■ 4.22
HOXB3-202ENST00000460160 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.3■■■■■ 4.2
HOXB3-202ENST00000460160 ADAMTS12P58397 1594 aa41.24■■■■■ 4.19
HOXB3-202ENST00000460160 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.2■■■■■ 4.19
HOXB3-202ENST00000460160 GRIN2AQ12879 1464 aa41.14■■■■■ 4.18
HOXB3-202ENST00000460160 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.11■■■■■ 4.17
HOXB3-202ENST00000460160 ARAP1Q96P48 1450 aa41.06■■■■■ 4.16
HOXB3-202ENST00000460160 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.02■■■■■ 4.16
HOXB3-202ENST00000460160 NUP160Q12769 1436 aa40.99■■■■■ 4.15
HOXB3-202ENST00000460160 CEP170Q5SW79 1584 aa40.98■■■■■ 4.15
HOXB3-202ENST00000460160 KIF27Q86VH2 1401 aa40.92■■■■■ 4.14
HOXB3-202ENST00000460160 IGF1RP08069 1367 aa40.83■■■■■ 4.13
HOXB3-202ENST00000460160 SHROOM2Q13796 1616 aa40.75■■■■■ 4.11
HOXB3-202ENST00000460160 CUL7Q14999 1698 aa40.75■■■■■ 4.11
HOXB3-202ENST00000460160 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.72■■■■■ 4.11
HOXB3-202ENST00000460160 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.64■■■■■ 4.1
HOXB3-202ENST00000460160 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.56■■■■■ 4.08
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