RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.18■■■■■ 7.38
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.46■■■■■ 6.15
HOXB3-210ENST00000489475 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.34■■■■■ 5.81
HOXB3-210ENST00000489475 ABCC9O60706 1549 aa50.76■■■■■ 5.72
HOXB3-210ENST00000489475 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.66■■■■■ 5.7
HOXB3-210ENST00000489475 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.59■■■■■ 5.69
HOXB3-210ENST00000489475 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.1■■■■■ 5.61
HOXB3-210ENST00000489475 NACADO15069 1562 aa49.87■■■■■ 5.57
HOXB3-210ENST00000489475 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.74■■■■■ 5.55
HOXB3-210ENST00000489475 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.5■■■■■ 5.51
HOXB3-210ENST00000489475 SCRIBQ14160 1630 aa49.11■■■■■ 5.45
HOXB3-210ENST00000489475 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.41■■■■■ 5.34
HOXB3-210ENST00000489475 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.95■■■■■ 5.27
HOXB3-210ENST00000489475 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.84■■■■■ 5.25
HOXB3-210ENST00000489475 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.78■■■■■ 5.24
HOXB3-210ENST00000489475 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.53■■■■■ 5.2
HOXB3-210ENST00000489475 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.37■■■■■ 5.17
HOXB3-210ENST00000489475 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.28■■■■■ 5.16
HOXB3-210ENST00000489475 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.24■■■■■ 5.15
HOXB3-210ENST00000489475 SMARCA4P51532 1647 aa47.07■■■■■ 5.13
HOXB3-210ENST00000489475 WIZO95785 1651 aa46.82■■■■■ 5.09
HOXB3-210ENST00000489475 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.55■■■■■ 5.04
HOXB3-210ENST00000489475 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.51■■■■■ 5.04
HOXB3-210ENST00000489475 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.37■■■■■ 5.01
HOXB3-210ENST00000489475 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.37■■■■■ 5.01
HOXB3-210ENST00000489475 SMARCA2P51531 1590 aa46.36■■■■■ 5.01
HOXB3-210ENST00000489475 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.12■■■■■ 4.97
HOXB3-210ENST00000489475 NCAPD3P42695 1498 aa46.02■■■■■ 4.96
HOXB3-210ENST00000489475 HMGXB3Q12766 1538 aa45.93■■■■■ 4.94
HOXB3-210ENST00000489475 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.92■■■■■ 4.94
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.89■■■■■ 4.94
HOXB3-210ENST00000489475 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.59■■■■■ 4.89
HOXB3-210ENST00000489475 TRIM41Q8WV44 630 aa44.97■■■■■ 4.79
HOXB3-210ENST00000489475 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.94■■■■■ 4.78
HOXB3-210ENST00000489475 CFTRP13569 1480 aa44.93■■■■■ 4.78
HOXB3-210ENST00000489475 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.84■■■■■ 4.77
HOXB3-210ENST00000489475 ABCC8Q09428 1581 aa44.83■■■■■ 4.77
HOXB3-210ENST00000489475 PRDM2Q13029 1718 aa44.65■■■■■ 4.74
HOXB3-210ENST00000489475 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.63■■■■■ 4.73
HOXB3-210ENST00000489475 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.5■■■■■ 4.71
HOXB3-210ENST00000489475 NESP48681 1621 aa44.47■■■■■ 4.71
HOXB3-210ENST00000489475 SYNJ1O43426 1573 aa44.4■■■■■ 4.7
HOXB3-210ENST00000489475 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.34■■■■■ 4.69
HOXB3-210ENST00000489475 TOP2BQ02880 1626 aa44.26■■■■■ 4.68
HOXB3-210ENST00000489475 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.2■■■■■ 4.67
HOXB3-210ENST00000489475 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.19■■■■■ 4.67
HOXB3-210ENST00000489475 CUX1P39880 1505 aa44.19■■■■■ 4.66
HOXB3-210ENST00000489475 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.1■■■■■ 4.65
HOXB3-210ENST00000489475 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.09■■■■■ 4.65
HOXB3-210ENST00000489475 SOGA1O94964 1423 aa43.96■■■■■ 4.63
HOXB3-210ENST00000489475 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.92■■■■■ 4.62
HOXB3-210ENST00000489475 EEA1Q15075 1411 aa43.89■■■■■ 4.62
HOXB3-210ENST00000489475 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.89■■■■■ 4.62
HOXB3-210ENST00000489475 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.83■■■■■ 4.61
HOXB3-210ENST00000489475 TOPBP1Q92547 1522 aa43.82■■■■■ 4.61
HOXB3-210ENST00000489475 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.77■■■■■ 4.6
HOXB3-210ENST00000489475 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.77■■■■■ 4.6
HOXB3-210ENST00000489475 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.76■■■■■ 4.6
HOXB3-210ENST00000489475 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.66■■■■■ 4.58
HOXB3-210ENST00000489475 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.61■■■■■ 4.57
HOXB3-210ENST00000489475 ERCC6Q03468 1493 aa43.6■■■■■ 4.57
HOXB3-210ENST00000489475 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.58■■■■■ 4.57
HOXB3-210ENST00000489475 KIF27Q86VH2 1401 aa43.54■■■■■ 4.56
HOXB3-210ENST00000489475 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.48■■■■■ 4.55
HOXB3-210ENST00000489475 CUX2O14529 1486 aa43.45■■■■■ 4.55
HOXB3-210ENST00000489475 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.43■■■■■ 4.54
HOXB3-210ENST00000489475 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.38■■■■■ 4.53
HOXB3-210ENST00000489475 WDR62O43379 1518 aa43.37■■■■■ 4.53
HOXB3-210ENST00000489475 KIF21BO75037 1637 aa43.28■■■■■ 4.52
HOXB3-210ENST00000489475 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.26■■■■■ 4.52
HOXB3-210ENST00000489475 GOLGA3Q08378 1498 aa43.25■■■■■ 4.51
HOXB3-210ENST00000489475 WDR97A6NE52 1622 aa43.2■■■■■ 4.51
HOXB3-210ENST00000489475 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.16■■■■■ 4.5
HOXB3-210ENST00000489475 IGF1RP08069 1367 aa43.14■■■■■ 4.5
HOXB3-210ENST00000489475 PRXQ9BXM0 1461 aa43.14■■■■■ 4.5
HOXB3-210ENST00000489475 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.11■■■■■ 4.49
HOXB3-210ENST00000489475 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.08■■■■■ 4.49
HOXB3-210ENST00000489475 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.07■■■■■ 4.48
HOXB3-210ENST00000489475 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.05■■■■■ 4.48
HOXB3-210ENST00000489475 IFT140Q96RY7 1462 aa43.05■■■■■ 4.48
HOXB3-210ENST00000489475 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.05■■■■■ 4.48
HOXB3-210ENST00000489475 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.02■■■■■ 4.48
HOXB3-210ENST00000489475 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.99■■■■■ 4.47
HOXB3-210ENST00000489475 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.94■■■■■ 4.47
HOXB3-210ENST00000489475 CUL7Q14999 1698 aa42.84■■■■■ 4.45
HOXB3-210ENST00000489475 CEP162Q5TB80 1403 aa42.81■■■■■ 4.44
HOXB3-210ENST00000489475 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.81■■■■■ 4.442e-7■■■■□ 21.2
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.78■■■■■ 4.44
HOXB3-210ENST00000489475 PBRM1Q86U86 1689 aa42.71■■■■■ 4.43
HOXB3-210ENST00000489475 GRIN2BQ13224 1484 aa42.69■■■■■ 4.42
HOXB3-210ENST00000489475 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.64■■■■■ 4.42
HOXB3-210ENST00000489475 CLIP1P30622 1438 aa42.56■■■■■ 4.4
HOXB3-210ENST00000489475 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.52■■■■■ 4.4
HOXB3-210ENST00000489475 ADAMTS12P58397 1594 aa42.48■■■■■ 4.39
HOXB3-210ENST00000489475 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.45■■■■■ 4.39
HOXB3-210ENST00000489475 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.41■■■■■ 4.38
HOXB3-210ENST00000489475 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.36■■■■■ 4.37
HOXB3-210ENST00000489475 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.3■■■■■ 4.36
HOXB3-210ENST00000489475 SYNJ2O15056 1496 aa42.19■■■■■ 4.35
HOXB3-210ENST00000489475 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa42.16■■■■■ 4.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.9 ms