Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU7

SDAD1, Protein SDA1 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDAD1Q9NVU7 SPPL2B-206ENST00000593243 551 ntTSL 414.52□□□□□ -0.091e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 SLC25A6-203ENST00000484026 854 ntTSL 512.17□□□□□ -0.461e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.465e-11■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 ACACA-239ENST00000617548 1063 ntTSL 1 (best)21.4■■□□□ 1.021e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 ACACA-238ENST00000616352 1626 ntTSL 1 (best)21.36■■□□□ 1.011e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 ACACA-236ENST00000615229 1468 ntTSL 1 (best)20.03■□□□□ 0.81e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 ACACA-235ENST00000614789 662 ntTSL 1 (best)10.51□□□□□ -0.731e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 ACACA-246ENST00000621960 551 ntTSL 58.77□□□□□ -1.011e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 ACACA-232ENST00000614438 569 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.161e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 ACACA-224ENST00000612007 451 ntTSL 51.98□□□□□ -2.091e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 SPTAN1-210ENST00000625282 4102 ntTSL 29.79□□□□□ -0.841e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 TGFBR3-210ENST00000533089 6455 ntTSL 1 (best)7.77□□□□□ -1.171e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.21e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 TGFBR3-209ENST00000532540 3913 ntTSL 1 (best)7.39□□□□□ -1.231e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.158e-28■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 FN1-202ENST00000336916 8435 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.238e-28■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 FN1-206ENST00000359671 8524 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.278e-28■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 FN1-212ENST00000446046 7952 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.348e-28■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 FN1-211ENST00000443816 7762 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.438e-28■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 FN1-204ENST00000356005 7846 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.448e-28■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 FN1-207ENST00000421182 8103 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.448e-28■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 FN1-203ENST00000354785 8905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.488e-28■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 FN1-205ENST00000357867 7898 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.488e-28■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 FN1-209ENST00000432072 7759 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.688e-28■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.578e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.418e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.278e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.258e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.228e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.198e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.128e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.128e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 ABCA2-217ENST00000479446 6295 ntTSL 1 (best)21.81■■□□□ 1.088e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.088e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 ACAA1-212ENST00000460424 538 ntTSL 421.44■■□□□ 1.028e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.018e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 18e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 NIPSNAP1-202ENST00000415100 661 ntTSL 520.93■□□□□ 0.948e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 ACAA1-218ENST00000489559 579 ntTSL 420.71■□□□□ 0.918e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.828e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.828e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.818e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 SEMA3B-208ENST00000456210 2065 ntTSL 220.06■□□□□ 0.88e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.88e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 DIP2B-204ENST00000549620 2676 ntTSL 1 (best)19.97■□□□□ 0.798e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.738e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 CC2D1A-202ENST00000585896 1843 ntTSL 219.6■□□□□ 0.738e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.78e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 PKD1-210ENST00000473780 667 ntTSL 519.29■□□□□ 0.688e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.678e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.658e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 FKBP10-204ENST00000464180 1129 ntTSL 219.04■□□□□ 0.642e-8■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 SSFA2-212ENST00000480753 2526 ntTSL 218.94■□□□□ 0.628e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.628e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.598e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 ZNF516-205ENST00000617840 2326 ntTSL 1 (best)18.74■□□□□ 0.598e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 ACAA1-204ENST00000418880 737 ntTSL 318.47■□□□□ 0.558e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.528e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 SMYD2-203ENST00000460580 1618 ntTSL 1 (best)18.2■□□□□ 0.58e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.478e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.468e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.458e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 GAA-204ENST00000570803 956 ntTSL 517.85■□□□□ 0.458e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.448e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 DDX3X-210ENST00000615313 568 ntTSL 417.81■□□□□ 0.448e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.438e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 MEGF6-205ENST00000485002 4705 ntTSL 517.38■□□□□ 0.378e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.378e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.358e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.358e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.358e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.348e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 SEMA3B-207ENST00000441915 2710 ntTSL 1 (best)17.14■□□□□ 0.338e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 SEMA3B-214ENST00000619119 3158 ntTSL 517.08■□□□□ 0.328e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 COL6A1-206ENST00000498614 2358 ntTSL 1 (best)17.05■□□□□ 0.322e-10■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 OTUB1-205ENST00000535140 638 ntTSL 316.98■□□□□ 0.318e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.318e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.38e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 OTUB1-201ENST00000301453 2493 ntTSL 216.89■□□□□ 0.298e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 SEMA3B-201ENST00000416295 1088 ntTSL 516.77■□□□□ 0.288e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.268e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 ACAA1-217ENST00000484284 580 ntTSL 216.68■□□□□ 0.268e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 DDX3X-206ENST00000542215 1592 ntTSL 216.63■□□□□ 0.258e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 CTSH-211ENST00000530010 556 ntTSL 216.59■□□□□ 0.258e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 COL6A1-204ENST00000486023 968 ntTSL 216.34■□□□□ 0.212e-10■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 CSF3R-212ENST00000487540 1931 ntTSL 516.31■□□□□ 0.28e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC16.24■□□□□ 0.198e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 RABL6-205ENST00000435930 3328 ntTSL 216.13■□□□□ 0.178e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 SMYD2-204ENST00000471645 4732 ntTSL 1 (best)15.89■□□□□ 0.138e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 SEMA3B-203ENST00000419007 3283 ntTSL 215.89■□□□□ 0.138e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 GRB7-208ENST00000485182 879 ntTSL 215.88■□□□□ 0.138e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 PLOD1-204ENST00000449038 762 ntTSL 515.87■□□□□ 0.132e-7■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.118e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 DDX3X-213ENST00000622198 409 ntTSL 415.72■□□□□ 0.118e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 DDX3X-208ENST00000611546 442 ntTSL 515.72■□□□□ 0.118e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.088e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.088e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.088e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.078e-6■■■□□ 14.7
SDAD1Q9NVU7 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.068e-6■■■□□ 14.7
Retrieved 100 of 11,671 protein–RNA pairs in 149.1 ms