RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415100.5

NIPSNAP1-202, Transcript of nipsnap homolog 1, humanhuman

TSL 5

Gene NIPSNAP1, Length 661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1-202ENST00000415100 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.05■■■■■ 6.4
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NIPSNAP1-202ENST00000415100 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.73■■■■■ 5.55
NIPSNAP1-202ENST00000415100 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.86■■■■■ 5.25
NIPSNAP1-202ENST00000415100 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.62■■■■■ 5.21
NIPSNAP1-202ENST00000415100 NACADO15069 1562 aa47.16■■■■■ 5.14
NIPSNAP1-202ENST00000415100 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.68■■■■■ 5.06
NIPSNAP1-202ENST00000415100 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.57■■■■■ 5.04
NIPSNAP1-202ENST00000415100 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.52■■■■■ 5.04
NIPSNAP1-202ENST00000415100 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.36■■■■■ 5.01
NIPSNAP1-202ENST00000415100 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.34■■■■■ 5.01
NIPSNAP1-202ENST00000415100 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.68■■■■■ 4.9
NIPSNAP1-202ENST00000415100 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.49■■■■■ 4.87
NIPSNAP1-202ENST00000415100 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.49■■■■■ 4.87
NIPSNAP1-202ENST00000415100 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.46■■■■■ 4.87
NIPSNAP1-202ENST00000415100 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.42■■■■■ 4.86
NIPSNAP1-202ENST00000415100 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.21■■■■■ 4.83
NIPSNAP1-202ENST00000415100 SCRIBQ14160 1630 aa45.17■■■■■ 4.82
NIPSNAP1-202ENST00000415100 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.46■■■■■ 4.71
NIPSNAP1-202ENST00000415100 CUX2O14529 1486 aa43.72■■■■■ 4.59
NIPSNAP1-202ENST00000415100 NCAPD3P42695 1498 aa43.57■■■■■ 4.57
NIPSNAP1-202ENST00000415100 ERCC6Q03468 1493 aa43.45■■■■■ 4.55
NIPSNAP1-202ENST00000415100 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.32■■■■■ 4.52
NIPSNAP1-202ENST00000415100 HMGXB3Q12766 1538 aa43.18■■■■■ 4.5
NIPSNAP1-202ENST00000415100 SMARCA2P51531 1590 aa43.14■■■■■ 4.5
NIPSNAP1-202ENST00000415100 SMARCA4P51532 1647 aa43.08■■■■■ 4.49
NIPSNAP1-202ENST00000415100 NESP48681 1621 aa43.04■■■■■ 4.48
NIPSNAP1-202ENST00000415100 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.82■■■■■ 4.44
NIPSNAP1-202ENST00000415100 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.81■■■■■ 4.44
NIPSNAP1-202ENST00000415100 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.76■■■■■ 4.44
NIPSNAP1-202ENST00000415100 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.74■■■■■ 4.43
NIPSNAP1-202ENST00000415100 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.67■■■■■ 4.42
NIPSNAP1-202ENST00000415100 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.47■■■■■ 4.39
NIPSNAP1-202ENST00000415100 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.4■■■■■ 4.38
NIPSNAP1-202ENST00000415100 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.39■■■■■ 4.38
NIPSNAP1-202ENST00000415100 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.16■■■■■ 4.34
NIPSNAP1-202ENST00000415100 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.11■■■■■ 4.33
NIPSNAP1-202ENST00000415100 TRIM41Q8WV44 630 aa42.08■■■■■ 4.33
NIPSNAP1-202ENST00000415100 WDR62O43379 1518 aa42.07■■■■■ 4.33
NIPSNAP1-202ENST00000415100 WIZO95785 1651 aa41.81■■■■■ 4.28
NIPSNAP1-202ENST00000415100 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.78■■■■■ 4.28
NIPSNAP1-202ENST00000415100 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.67■■■■■ 4.26
NIPSNAP1-202ENST00000415100 CFTRP13569 1480 aa41.58■■■■■ 4.25
NIPSNAP1-202ENST00000415100 OSCARQ8IYS5 282 aa41.51■■■■■ 4.24
NIPSNAP1-202ENST00000415100 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
NIPSNAP1-202ENST00000415100 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.28■■■■■ 4.2
NIPSNAP1-202ENST00000415100 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.26■■■■■ 4.19
NIPSNAP1-202ENST00000415100 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.11■■■■■ 4.17
NIPSNAP1-202ENST00000415100 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.11■■■■■ 4.17
NIPSNAP1-202ENST00000415100 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.11■■■■■ 4.17
NIPSNAP1-202ENST00000415100 PRDM2Q13029 1718 aa41.07■■■■■ 4.16
NIPSNAP1-202ENST00000415100 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.99■■■■■ 4.15
NIPSNAP1-202ENST00000415100 IFT140Q96RY7 1462 aa40.99■■■■■ 4.15
NIPSNAP1-202ENST00000415100 ARHGEF11O15085 1522 aa40.93■■■■■ 4.14
NIPSNAP1-202ENST00000415100 TOPBP1Q92547 1522 aa40.83■■■■■ 4.13
NIPSNAP1-202ENST00000415100 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.79■■■■■ 4.12
NIPSNAP1-202ENST00000415100 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.74■■■■■ 4.11
NIPSNAP1-202ENST00000415100 ABCC8Q09428 1581 aa40.68■■■■■ 4.1
NIPSNAP1-202ENST00000415100 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.61■■■■■ 4.09
NIPSNAP1-202ENST00000415100 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.56■■■■■ 4.08
NIPSNAP1-202ENST00000415100 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.56■■■■■ 4.08
NIPSNAP1-202ENST00000415100 CHD1O14646 1710 aa40.54■■■■■ 4.08
NIPSNAP1-202ENST00000415100 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.5■■■■■ 4.074e-8■■■■■ 32.5
NIPSNAP1-202ENST00000415100 ARAP1Q96P48 1450 aa40.48■■■■■ 4.07
NIPSNAP1-202ENST00000415100 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.4■■■■■ 4.06
NIPSNAP1-202ENST00000415100 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.37■■■■■ 4.05
NIPSNAP1-202ENST00000415100 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.27■■■■■ 4.04
NIPSNAP1-202ENST00000415100 FBLN2P98095 1184 aa40.25■■■■■ 4.03
NIPSNAP1-202ENST00000415100 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.19■■■■■ 4.03
NIPSNAP1-202ENST00000415100 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.13■■■■■ 4.01
NIPSNAP1-202ENST00000415100 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.12■■■■■ 4.01
NIPSNAP1-202ENST00000415100 SOGA1O94964 1423 aa40.12■■■■■ 4.01
NIPSNAP1-202ENST00000415100 WDR97A6NE52 1622 aa40.11■■■■■ 4.01
NIPSNAP1-202ENST00000415100 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.07■■■■■ 4.01
NIPSNAP1-202ENST00000415100 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40■■■■□ 3.99
NIPSNAP1-202ENST00000415100 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.98■■■■□ 3.99
NIPSNAP1-202ENST00000415100 SYNJ1O43426 1573 aa39.97■■■■□ 3.99
NIPSNAP1-202ENST00000415100 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.89■■■■□ 3.98
NIPSNAP1-202ENST00000415100 GRIN2BQ13224 1484 aa39.88■■■■□ 3.98
NIPSNAP1-202ENST00000415100 CUX1P39880 1505 aa39.87■■■■□ 3.97
NIPSNAP1-202ENST00000415100 SYNJ2O15056 1496 aa39.85■■■■□ 3.97
NIPSNAP1-202ENST00000415100 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.68■■■■□ 3.94
NIPSNAP1-202ENST00000415100 PBRM1Q86U86 1689 aa39.67■■■■□ 3.94
NIPSNAP1-202ENST00000415100 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.59■■■■□ 3.93
NIPSNAP1-202ENST00000415100 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.56■■■■□ 3.92
NIPSNAP1-202ENST00000415100 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.54■■■■□ 3.92
NIPSNAP1-202ENST00000415100 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.42■■■■□ 3.9
NIPSNAP1-202ENST00000415100 GRIN2AQ12879 1464 aa39.38■■■■□ 3.9
NIPSNAP1-202ENST00000415100 NUP160Q12769 1436 aa39.31■■■■□ 3.88
NIPSNAP1-202ENST00000415100 ADAMTS12P58397 1594 aa39.29■■■■□ 3.88
NIPSNAP1-202ENST00000415100 CEP170Q5SW79 1584 aa39.29■■■■□ 3.88
NIPSNAP1-202ENST00000415100 SHROOM2Q13796 1616 aa39.24■■■■□ 3.87
NIPSNAP1-202ENST00000415100 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.19■■■■□ 3.86
NIPSNAP1-202ENST00000415100 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.12■■■■□ 3.85
NIPSNAP1-202ENST00000415100 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.07■■■■□ 3.84
NIPSNAP1-202ENST00000415100 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.05■■■■□ 3.84
NIPSNAP1-202ENST00000415100 TOP2BQ02880 1626 aa39.04■■■■□ 3.84
NIPSNAP1-202ENST00000415100 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.02■■■■□ 3.84
NIPSNAP1-202ENST00000415100 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.92■■■■□ 3.82
NIPSNAP1-202ENST00000415100 JPH4Q96JJ6 628 aa38.81■■■■□ 3.8
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