RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617548.1

ACACA-239, Transcript of acetyl-CoA carboxylase alpha, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACACA, Length 1,063 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACA-239ENST00000617548 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.42■■■■■ 6.62
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ACACA-239ENST00000617548 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.55■■■■■ 5.2
ACACA-239ENST00000617548 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.46■■■■■ 5.19
ACACA-239ENST00000617548 NACADO15069 1562 aa47.39■■■■■ 5.18
ACACA-239ENST00000617548 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.93■■■■■ 5.1
ACACA-239ENST00000617548 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.89■■■■■ 5.1
ACACA-239ENST00000617548 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.62■■■■■ 5.05
ACACA-239ENST00000617548 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.45■■■■■ 5.03
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ACACA-239ENST00000617548 SCRIBQ14160 1630 aa45.93■■■■■ 4.94
ACACA-239ENST00000617548 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.83■■■■■ 4.93
ACACA-239ENST00000617548 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.55■■■■■ 4.88
ACACA-239ENST00000617548 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.92■■■■■ 4.78
ACACA-239ENST00000617548 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.83■■■■■ 4.77
ACACA-239ENST00000617548 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.61■■■■■ 4.73
ACACA-239ENST00000617548 SMARCA4P51532 1647 aa43.86■■■■■ 4.61
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ACACA-239ENST00000617548 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.7■■■■■ 4.59
ACACA-239ENST00000617548 SMARCA2P51531 1590 aa43.65■■■■■ 4.58
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ACACA-239ENST00000617548 HMGXB3Q12766 1538 aa43.47■■■■■ 4.55
ACACA-239ENST00000617548 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.38■■■■■ 4.54
ACACA-239ENST00000617548 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.37■■■■■ 4.53
ACACA-239ENST00000617548 WIZO95785 1651 aa43.02■■■■■ 4.48
ACACA-239ENST00000617548 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.86■■■■■ 4.45
ACACA-239ENST00000617548 ERCC6Q03468 1493 aa42.83■■■■■ 4.45
ACACA-239ENST00000617548 NESP48681 1621 aa42.82■■■■■ 4.44
ACACA-239ENST00000617548 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.65■■■■■ 4.42
ACACA-239ENST00000617548 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.51■■■■■ 4.4
ACACA-239ENST00000617548 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.46■■■■■ 4.39
ACACA-239ENST00000617548 CUX2O14529 1486 aa42.43■■■■■ 4.38
ACACA-239ENST00000617548 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.4■■■■■ 4.38
ACACA-239ENST00000617548 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.3■■■■■ 4.36
ACACA-239ENST00000617548 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.2■■■■■ 4.35
ACACA-239ENST00000617548 CFTRP13569 1480 aa42.11■■■■■ 4.33
ACACA-239ENST00000617548 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.04■■■■■ 4.32
ACACA-239ENST00000617548 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.98■■■■■ 4.31
ACACA-239ENST00000617548 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.97■■■■■ 4.31
ACACA-239ENST00000617548 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.97■■■■■ 4.31
ACACA-239ENST00000617548 WDR62O43379 1518 aa41.81■■■■■ 4.28
ACACA-239ENST00000617548 PRDM2Q13029 1718 aa41.77■■■■■ 4.28
ACACA-239ENST00000617548 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.64■■■■■ 4.26
ACACA-239ENST00000617548 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.56■■■■■ 4.24
ACACA-239ENST00000617548 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.56■■■■■ 4.24
ACACA-239ENST00000617548 TOPBP1Q92547 1522 aa41.26■■■■■ 4.2
ACACA-239ENST00000617548 ABCC8Q09428 1581 aa41.25■■■■■ 4.19
ACACA-239ENST00000617548 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.18■■■■■ 4.18
ACACA-239ENST00000617548 IFT140Q96RY7 1462 aa41.09■■■■■ 4.17
ACACA-239ENST00000617548 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.93■■■■■ 4.14
ACACA-239ENST00000617548 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.88■■■■■ 4.13
ACACA-239ENST00000617548 CUX1P39880 1505 aa40.82■■■■■ 4.12
ACACA-239ENST00000617548 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.82■■■■■ 4.12
ACACA-239ENST00000617548 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.75■■■■■ 4.11
ACACA-239ENST00000617548 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.75■■■■■ 4.11
ACACA-239ENST00000617548 SOGA1O94964 1423 aa40.75■■■■■ 4.11
ACACA-239ENST00000617548 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.73■■■■■ 4.11
ACACA-239ENST00000617548 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.69■■■■■ 4.15e-6■■■■■ 28
ACACA-239ENST00000617548 OSCARQ8IYS5 282 aa40.68■■■■■ 4.1
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ACACA-239ENST00000617548 WDR97A6NE52 1622 aa40.46■■■■■ 4.07
ACACA-239ENST00000617548 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.45■■■■■ 4.07
ACACA-239ENST00000617548 TOP2BQ02880 1626 aa40.37■■■■■ 4.05
ACACA-239ENST00000617548 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.36■■■■■ 4.05
ACACA-239ENST00000617548 FBLN2P98095 1184 aa40.36■■■■■ 4.05
ACACA-239ENST00000617548 SYNJ1O43426 1573 aa40.35■■■■■ 4.05
ACACA-239ENST00000617548 CHD1O14646 1710 aa40.33■■■■■ 4.05
ACACA-239ENST00000617548 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.31■■■■■ 4.04
ACACA-239ENST00000617548 GRIN2BQ13224 1484 aa40.29■■■■■ 4.04
ACACA-239ENST00000617548 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.29■■■■■ 4.04
ACACA-239ENST00000617548 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.26■■■■■ 4.03
ACACA-239ENST00000617548 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.2■■■■■ 4.03
ACACA-239ENST00000617548 PBRM1Q86U86 1689 aa40.19■■■■■ 4.02
ACACA-239ENST00000617548 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.17■■■■■ 4.02
ACACA-239ENST00000617548 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
ACACA-239ENST00000617548 TRIM41Q8WV44 630 aa40.15■■■■■ 4.02
ACACA-239ENST00000617548 SYNJ2O15056 1496 aa40.07■■■■■ 4
ACACA-239ENST00000617548 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.02■■■■■ 4
ACACA-239ENST00000617548 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.02■■■■■ 4
ACACA-239ENST00000617548 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.02■■■■■ 4
ACACA-239ENST00000617548 ARHGEF11O15085 1522 aa39.96■■■■□ 3.99
ACACA-239ENST00000617548 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.84■■■■□ 3.97
ACACA-239ENST00000617548 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.83■■■■□ 3.97
ACACA-239ENST00000617548 ADAMTS12P58397 1594 aa39.83■■■■□ 3.97
ACACA-239ENST00000617548 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.77■■■■□ 3.96
ACACA-239ENST00000617548 GRIN2AQ12879 1464 aa39.76■■■■□ 3.96
ACACA-239ENST00000617548 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.69■■■■□ 3.94
ACACA-239ENST00000617548 KIF27Q86VH2 1401 aa39.65■■■■□ 3.94
ACACA-239ENST00000617548 ARAP1Q96P48 1450 aa39.61■■■■□ 3.93
ACACA-239ENST00000617548 CEP170Q5SW79 1584 aa39.58■■■■□ 3.93
ACACA-239ENST00000617548 NUP160Q12769 1436 aa39.57■■■■□ 3.93
ACACA-239ENST00000617548 IGF1RP08069 1367 aa39.5■■■■□ 3.91
ACACA-239ENST00000617548 CUL7Q14999 1698 aa39.41■■■■□ 3.9
ACACA-239ENST00000617548 SHROOM2Q13796 1616 aa39.31■■■■□ 3.88
ACACA-239ENST00000617548 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.29■■■■□ 3.88
ACACA-239ENST00000617548 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.29■■■■□ 3.88
ACACA-239ENST00000617548 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.24■■■■□ 3.87
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