RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616352.4

ACACA-238, Transcript of acetyl-CoA carboxylase alpha, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACACA, Length 1,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACA-238ENST00000616352 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.47■■■■■ 6.31
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ACACA-238ENST00000616352 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.98■■■■■ 4.79
ACACA-238ENST00000616352 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.97■■■■■ 4.79
ACACA-238ENST00000616352 NACADO15069 1562 aa44.94■■■■■ 4.78
ACACA-238ENST00000616352 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.77■■■■■ 4.76
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ACACA-238ENST00000616352 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.49■■■■■ 4.55
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ACACA-238ENST00000616352 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.8■■■■■ 4.28
ACACA-238ENST00000616352 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.7■■■■■ 4.27
ACACA-238ENST00000616352 WIZO95785 1651 aa41.64■■■■■ 4.26
ACACA-238ENST00000616352 SMARCA2P51531 1590 aa41.6■■■■■ 4.25
ACACA-238ENST00000616352 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.59■■■■■ 4.25
ACACA-238ENST00000616352 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.48■■■■■ 4.23
ACACA-238ENST00000616352 NCAPD3P42695 1498 aa41.43■■■■■ 4.22
ACACA-238ENST00000616352 HMGXB3Q12766 1538 aa41.35■■■■■ 4.21
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ACACA-238ENST00000616352 CFTRP13569 1480 aa40.23■■■■■ 4.03
ACACA-238ENST00000616352 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.23■■■■■ 4.03
ACACA-238ENST00000616352 NESP48681 1621 aa40.19■■■■■ 4.02
ACACA-238ENST00000616352 PRDM2Q13029 1718 aa40.18■■■■■ 4.02
ACACA-238ENST00000616352 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.85■■■■□ 3.97
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ACACA-238ENST00000616352 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.8■■■■□ 3.96
ACACA-238ENST00000616352 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.66■■■■□ 3.94
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ACACA-238ENST00000616352 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.38■■■■□ 3.89
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ACACA-238ENST00000616352 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.34■■■■□ 3.89
ACACA-238ENST00000616352 SYNJ1O43426 1573 aa39.32■■■■□ 3.88
ACACA-238ENST00000616352 WDR62O43379 1518 aa39.31■■■■□ 3.88
ACACA-238ENST00000616352 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.3■■■■□ 3.88
ACACA-238ENST00000616352 TOPBP1Q92547 1522 aa39.29■■■■□ 3.88
ACACA-238ENST00000616352 TOP2BQ02880 1626 aa39.27■■■■□ 3.88
ACACA-238ENST00000616352 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.14■■■■□ 3.86
ACACA-238ENST00000616352 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.05■■■■□ 3.84
ACACA-238ENST00000616352 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.02■■■■□ 3.84
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ACACA-238ENST00000616352 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.82■■■■□ 3.81
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ACACA-238ENST00000616352 WDR97A6NE52 1622 aa38.81■■■■□ 3.8
ACACA-238ENST00000616352 IFT140Q96RY7 1462 aa38.79■■■■□ 3.8
ACACA-238ENST00000616352 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.72■■■■□ 3.79
ACACA-238ENST00000616352 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.57■■■■□ 3.76
ACACA-238ENST00000616352 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.55■■■■□ 3.76
ACACA-238ENST00000616352 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.51■■■■□ 3.76
ACACA-238ENST00000616352 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.48■■■■□ 3.75
ACACA-238ENST00000616352 KIF27Q86VH2 1401 aa38.46■■■■□ 3.75
ACACA-238ENST00000616352 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.45■■■■□ 3.75
ACACA-238ENST00000616352 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.44■■■■□ 3.745e-6■■■■■ 28
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ACACA-238ENST00000616352 EEA1Q15075 1411 aa38.33■■■■□ 3.73
ACACA-238ENST00000616352 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.28■■■■□ 3.72
ACACA-238ENST00000616352 GRIN2BQ13224 1484 aa38.28■■■■□ 3.72
ACACA-238ENST00000616352 IGF1RP08069 1367 aa38.2■■■■□ 3.71
ACACA-238ENST00000616352 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.16■■■■□ 3.7
ACACA-238ENST00000616352 CUL7Q14999 1698 aa38.15■■■■□ 3.7
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ACACA-238ENST00000616352 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.11■■■■□ 3.69
ACACA-238ENST00000616352 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.1■■■■□ 3.69
ACACA-238ENST00000616352 ADAMTS12P58397 1594 aa38.09■■■■□ 3.69
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ACACA-238ENST00000616352 CEP170Q5SW79 1584 aa37.63■■■■□ 3.62
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ACACA-238ENST00000616352 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa37.53■■■■□ 3.6
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