Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR7

DDX24, ATP-dependent RNA helicase DDX24, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX24Q9GZR7 EDRF1-201ENST00000337623 4387 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 06e-8■■■■■ 46.2
DDX24Q9GZR7 URB1-203ENST00000492603 551 ntTSL 414.63□□□□□ -0.076e-8■■■■■ 46.2
DDX24Q9GZR7 UBTF-211ENST00000530828 721 ntTSL 514.57□□□□□ -0.086e-8■■■■■ 46.2
DDX24Q9GZR7 URB1-202ENST00000480196 479 ntTSL 314.47□□□□□ -0.096e-8■■■■■ 46.2
DDX24Q9GZR7 WDTC1-203ENST00000447062 3115 ntTSL 214.28□□□□□ -0.126e-8■■■■■ 46.2
DDX24Q9GZR7 CCDC78-213ENST00000482878 3458 ntTSL 214.17□□□□□ -0.146e-8■■■■■ 46.2
DDX24Q9GZR7 EDRF1-208ENST00000481600 4181 ntTSL 213.66□□□□□ -0.226e-8■■■■■ 46.2
DDX24Q9GZR7 EDRF1-206ENST00000419769 4243 ntTSL 1 (best)13.49□□□□□ -0.256e-8■■■■■ 46.2
DDX24Q9GZR7 ANKFY1-213ENST00000575955 948 ntTSL 213.34□□□□□ -0.276e-8■■■■■ 46.2
DDX24Q9GZR7 EDRF1-205ENST00000368815 4123 ntTSL 1 (best)12.81□□□□□ -0.366e-8■■■■■ 46.2
DDX24Q9GZR7 EDRF1-202ENST00000356792 4128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.366e-8■■■■■ 46.2
DDX24Q9GZR7 BBS4-205ENST00000562219 1004 ntTSL 1 (best)12.38□□□□□ -0.436e-8■■■■■ 46.2
DDX24Q9GZR7 AC008267.2-201ENST00000411606 981 ntBASIC12.35□□□□□ -0.431e-7■■■■■ 46.2
DDX24Q9GZR7 CTPS1-210ENST00000486889 568 ntTSL 211.86□□□□□ -0.517e-15■■■■■ 46.2
DDX24Q9GZR7 LINC00174-210ENST00000638592 2261 ntTSL 511.39□□□□□ -0.591e-7■■■■■ 46.2
DDX24Q9GZR7 LRRC40-201ENST00000370952 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.676e-8■■■■■ 46.2
DDX24Q9GZR7 USP19-213ENST00000483667 558 ntTSL 210.5□□□□□ -0.736e-8■■■■■ 46.2
DDX24Q9GZR7 LINC00174-212ENST00000640964 4039 ntTSL 510.15□□□□□ -0.791e-7■■■■■ 46.2
DDX24Q9GZR7 BBS4-209ENST00000566197 541 ntTSL 39.97□□□□□ -0.816e-8■■■■■ 46.2
DDX24Q9GZR7 GLOD4-210ENST00000575528 585 ntTSL 29.29□□□□□ -0.926e-8■■■■■ 46.2
DDX24Q9GZR7 TRAPPC11-206ENST00000509857 548 ntTSL 47.84□□□□□ -1.156e-8■■■■■ 46.2
DDX24Q9GZR7 LINC00174-209ENST00000638517 4621 ntTSL 57.82□□□□□ -1.161e-7■■■■■ 46.2
DDX24Q9GZR7 LINC00174-207ENST00000442578 1016 ntTSL 57.76□□□□□ -1.171e-7■■■■■ 46.2
DDX24Q9GZR7 LINC00174-211ENST00000639086 1016 ntTSL 57.76□□□□□ -1.171e-7■■■■■ 46.2
DDX24Q9GZR7 EDRF1-213ENST00000530795 945 ntTSL 57.31□□□□□ -1.246e-8■■■■■ 46.2
DDX24Q9GZR7 TRAPPC11-210ENST00000513600 545 ntTSL 36.88□□□□□ -1.316e-8■■■■■ 46.2
DDX24Q9GZR7 DENND6A-206ENST00000487662 487 ntTSL 26.03□□□□□ -1.446e-8■■■■■ 46.2
DDX24Q9GZR7 GLOD4-206ENST00000573137 447 ntTSL 35.84□□□□□ -1.476e-8■■■■■ 46.2
DDX24Q9GZR7 BBS4-216ENST00000569151 272 ntTSL 35.11□□□□□ -1.596e-8■■■■■ 46.2
DDX24Q9GZR7 TRAPPC11-207ENST00000511409 568 ntTSL 44.06□□□□□ -1.766e-8■■■■■ 46.2
DDX24Q9GZR7 NBPF11-201ENST00000613531 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)9.24□□□□□ -0.939e-12■■■■■ 45.9
DDX24Q9GZR7 HSF4-202ENST00000517680 368 ntTSL 315.95■□□□□ 0.143e-8■■■■■ 45.9
DDX24Q9GZR7 LTBP3-206ENST00000526825 1002 ntTSL 518.11■□□□□ 0.492e-7■■■■■ 45.8
DDX24Q9GZR7 SSBP4-207ENST00000600244 622 ntTSL 220.94■□□□□ 0.943e-11■■■■■ 45.8
DDX24Q9GZR7 LMBR1L-225ENST00000552153 549 ntTSL 420.36■□□□□ 0.852e-6■■■■■ 45.7
DDX24Q9GZR7 LMBR1L-230ENST00000553204 582 ntTSL 315.08■□□□□ 02e-6■■■■■ 45.7
DDX24Q9GZR7 LMBR1L-213ENST00000549730 585 ntTSL 512.17□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 45.7
DDX24Q9GZR7 LMBR1L-219ENST00000551169 771 ntTSL 511.69□□□□□ -0.542e-6■■■■■ 45.7
DDX24Q9GZR7 WDR4-206ENST00000479429 759 ntTSL 526.86■■□□□ 1.898e-8■■■■■ 45.6
DDX24Q9GZR7 IDUA-212ENST00000514698 2185 ntTSL 523.08■■□□□ 1.294e-9■■■■■ 45.5
DDX24Q9GZR7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.124e-9■■■■■ 45.5
DDX24Q9GZR7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.054e-9■■■■■ 45.5
DDX24Q9GZR7 UROS-206ENST00000462490 3188 ntTSL 59.43□□□□□ -0.91e-6■■■■■ 45.4
DDX24Q9GZR7 SEC24C-205ENST00000496827 948 ntTSL 314.85□□□□□ -0.032e-8■■■■■ 45.2
DDX24Q9GZR7 FAM129B-207ENST00000484348 654 ntTSL 1 (best)27.81■■■□□ 2.042e-9■■■■■ 45.1
DDX24Q9GZR7 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.72e-9■■■■■ 45.1
DDX24Q9GZR7 FAM129B-204ENST00000468379 828 ntTSL 317.21■□□□□ 0.352e-9■■■■■ 45.1
DDX24Q9GZR7 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.242e-9■■■■■ 45.1
DDX24Q9GZR7 MYBBP1A-206ENST00000572759 588 ntTSL 319.6■□□□□ 0.732e-6■■■■■ 45.1
DDX24Q9GZR7 MYBBP1A-209ENST00000573723 613 ntTSL 514.83□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 45.1
DDX24Q9GZR7 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.655e-8■■■■■ 45.1
DDX24Q9GZR7 ATG4D-205ENST00000586477 628 ntTSL 519.46■□□□□ 0.711e-7■■■■■ 45
DDX24Q9GZR7 CORO7-217ENST00000572666 1237 ntTSL 519.5■□□□□ 0.711e-7■■■■■ 45
DDX24Q9GZR7 XPO5-212ENST00000612911 911 ntTSL 211.61□□□□□ -0.552e-8■■■■■ 44.8
DDX24Q9GZR7 ANKRD13D-205ENST00000504729 490 ntTSL 517.08■□□□□ 0.321e-9■■■■■ 44.8
DDX24Q9GZR7 ANKRD13D-217ENST00000514779 642 ntTSL 215.64■□□□□ 0.091e-9■■■■■ 44.8
DDX24Q9GZR7 DNM1-221ENST00000636220 111 ntTSL 52.35□□□□□ -2.036e-13■■■■■ 44.7
DDX24Q9GZR7 TMEM94-222ENST00000581834 484 ntTSL 316.77■□□□□ 0.281e-13■■■■■ 44.6
DDX24Q9GZR7 ABHD16A-208ENST00000477016 868 ntTSL 519.96■□□□□ 0.792e-9■■■■■ 44.6
DDX24Q9GZR7 ABHD16A-207ENST00000475742 1319 ntTSL 518.91■□□□□ 0.622e-9■■■■■ 44.6
DDX24Q9GZR7 AGRN-209ENST00000492947 690 ntTSL 220.47■□□□□ 0.871e-15■■■■■ 44.6
DDX24Q9GZR7 NUP214-217ENST00000526412 551 ntTSL 54.75□□□□□ -1.651e-26■■■■■ 44.5
DDX24Q9GZR7 MMS19-204ENST00000415383 3401 ntTSL 1 (best)13.26□□□□□ -0.291e-7■■■■■ 44.5
DDX24Q9GZR7 MMS19-201ENST00000327238 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.291e-7■■■■■ 44.5
DDX24Q9GZR7 MMS19-209ENST00000438925 3797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.371e-7■■■■■ 44.5
DDX24Q9GZR7 MMS19-202ENST00000355839 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.521e-7■■■■■ 44.5
DDX24Q9GZR7 MMS19-203ENST00000370782 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.531e-7■■■■■ 44.5
DDX24Q9GZR7 PIEZO1-206ENST00000474606 544 ntTSL 421.49■■□□□ 1.032e-12■■■■■ 44.4
DDX24Q9GZR7 RBM12-204ENST00000424458 1068 ntTSL 230.68■■■□□ 2.55e-8■■■■■ 44.3
DDX24Q9GZR7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.45e-8■■■■■ 44.3
DDX24Q9GZR7 CPNE1-223ENST00000475146 627 ntTSL 329.1■■■□□ 2.255e-8■■■■■ 44.3
DDX24Q9GZR7 EFEMP2-220ENST00000533347 1040 ntTSL 228.69■■■□□ 2.185e-8■■■■■ 44.3
DDX24Q9GZR7 E4F1-208ENST00000567111 691 ntTSL 227.46■■□□□ 1.995e-8■■■■■ 44.3
DDX24Q9GZR7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.145e-8■■■■■ 44.3
DDX24Q9GZR7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.075e-8■■■■■ 44.3
DDX24Q9GZR7 TSC2-221ENST00000568366 767 ntTSL 421■□□□□ 0.955e-8■■■■■ 44.3
DDX24Q9GZR7 KDM6B-203ENST00000570632 1339 ntTSL 520.08■□□□□ 0.815e-8■■■■■ 44.3
DDX24Q9GZR7 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.575e-8■■■■■ 44.3
DDX24Q9GZR7 SGSM2-212ENST00000574650 242 ntTSL 318.55■□□□□ 0.565e-8■■■■■ 44.3
DDX24Q9GZR7 EFEMP2-208ENST00000527378 614 ntTSL 316.45■□□□□ 0.225e-8■■■■■ 44.3
DDX24Q9GZR7 SLC43A1-209ENST00000533515 774 ntTSL 516.26■□□□□ 0.195e-8■■■■■ 44.3
DDX24Q9GZR7 SLC43A1-205ENST00000529452 821 ntTSL 315.47■□□□□ 0.075e-8■■■■■ 44.3
DDX24Q9GZR7 RBM12-206ENST00000435161 565 ntTSL 414.75□□□□□ -0.055e-8■■■■■ 44.3
DDX24Q9GZR7 RBM12-202ENST00000374104 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.135e-8■■■■■ 44.3
DDX24Q9GZR7 RBM12-205ENST00000431148 583 ntTSL 414.1□□□□□ -0.155e-8■■■■■ 44.3
DDX24Q9GZR7 RBM12-203ENST00000374114 6662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.665e-8■■■■■ 44.3
DDX24Q9GZR7 TCF4-251ENST00000625925 606 ntTSL 59.96□□□□□ -0.825e-8■■■■■ 44.3
DDX24Q9GZR7 SPOPL-202ENST00000420679 1386 ntTSL 59.34□□□□□ -0.915e-8■■■■■ 44.3
DDX24Q9GZR7 TCF4-235ENST00000566777 653 ntTSL 57.35□□□□□ -1.235e-8■■■■■ 44.3
DDX24Q9GZR7 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.515e-8■■■■■ 44.3
DDX24Q9GZR7 VPS13D-203ENST00000466732 377 ntTSL 54.55□□□□□ -1.685e-8■■■■■ 44.3
DDX24Q9GZR7 FANCA-228ENST00000567943 860 ntTSL 330.41■■■□□ 2.463e-14■■■■■ 44.3
DDX24Q9GZR7 CTPS1-206ENST00000470271 801 ntTSL 324.12■■□□□ 1.453e-14■■■■■ 44.3
DDX24Q9GZR7 ABCA2-221ENST00000492260 2062 ntTSL 522.43■■□□□ 1.183e-8■■■■■ 44.3
DDX24Q9GZR7 FANCA-227ENST00000567883 650 ntTSL 213.33□□□□□ -0.283e-14■■■■■ 44.3
DDX24Q9GZR7 COL6A5-202ENST00000312481 9226 ntTSL 1 (best)10.46□□□□□ -0.736e-7■■■■■ 44.3
DDX24Q9GZR7 COL6A5-201ENST00000265379 9214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.836e-7■■■■■ 44.3
DDX24Q9GZR7 VPS13B-209ENST00000521559 466 ntTSL 33.66□□□□□ -1.822e-7■■■■■ 44.3
DDX24Q9GZR7 ANO8-202ENST00000597643 4618 ntTSL 226.09■■□□□ 1.772e-6■■■■■ 44.1
DDX24Q9GZR7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.562e-6■■■■■ 44.1
Retrieved 100 of 28,409 protein–RNA pairs in 1105.9 ms