RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.5■■■■■ 5.35
CTPS1-206ENST00000470271 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.16■■■■■ 4.5
CTPS1-206ENST00000470271 ABCC9O60706 1549 aa42.37■■■■■ 4.37
CTPS1-206ENST00000470271 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.7■■■■■ 4.11
CTPS1-206ENST00000470271 NACADO15069 1562 aa40.63■■■■■ 4.09
CTPS1-206ENST00000470271 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.62■■■■■ 4.09
CTPS1-206ENST00000470271 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.38■■■■■ 4.05
CTPS1-206ENST00000470271 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.34■■■■■ 4.05
CTPS1-206ENST00000470271 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.12■■■■■ 4.01
CTPS1-206ENST00000470271 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.77■■■■□ 3.96
CTPS1-206ENST00000470271 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.59■■■■□ 3.93
CTPS1-206ENST00000470271 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.46■■■■□ 3.91
CTPS1-206ENST00000470271 SCRIBQ14160 1630 aa39.39■■■■□ 3.9
CTPS1-206ENST00000470271 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.05■■■■□ 3.84
CTPS1-206ENST00000470271 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.01■■■■□ 3.84
CTPS1-206ENST00000470271 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.44■■■■□ 3.74
CTPS1-206ENST00000470271 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.31■■■■□ 3.72
CTPS1-206ENST00000470271 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.09■■■■□ 3.69
CTPS1-206ENST00000470271 SMARCA4P51532 1647 aa37.65■■■■□ 3.62
CTPS1-206ENST00000470271 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.6■■■■□ 3.61
CTPS1-206ENST00000470271 NCAPD3P42695 1498 aa37.5■■■■□ 3.59
CTPS1-206ENST00000470271 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.5■■■■□ 3.59
CTPS1-206ENST00000470271 SMARCA2P51531 1590 aa37.44■■■■□ 3.58
CTPS1-206ENST00000470271 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.38■■■■□ 3.57
CTPS1-206ENST00000470271 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.29■■■■□ 3.56
CTPS1-206ENST00000470271 HMGXB3Q12766 1538 aa37.28■■■■□ 3.56
CTPS1-206ENST00000470271 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.19■■■■□ 3.54
CTPS1-206ENST00000470271 WIZO95785 1651 aa36.96■■■■□ 3.51
CTPS1-206ENST00000470271 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.92■■■■□ 3.5
CTPS1-206ENST00000470271 NESP48681 1621 aa36.63■■■■□ 3.45
CTPS1-206ENST00000470271 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.57■■■■□ 3.44
CTPS1-206ENST00000470271 ERCC6Q03468 1493 aa36.55■■■■□ 3.44
CTPS1-206ENST00000470271 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.52■■■■□ 3.44
CTPS1-206ENST00000470271 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.4■■■■□ 3.42
CTPS1-206ENST00000470271 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.3■■■■□ 3.4
CTPS1-206ENST00000470271 CUX2O14529 1486 aa36.18■■■■□ 3.38
CTPS1-206ENST00000470271 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.18■■■■□ 3.38
CTPS1-206ENST00000470271 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.15■■■■□ 3.38
CTPS1-206ENST00000470271 CFTRP13569 1480 aa36.15■■■■□ 3.38
CTPS1-206ENST00000470271 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
CTPS1-206ENST00000470271 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.98■■■■□ 3.35
CTPS1-206ENST00000470271 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.95■■■■□ 3.35
CTPS1-206ENST00000470271 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.92■■■■□ 3.34
CTPS1-206ENST00000470271 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
CTPS1-206ENST00000470271 PRDM2Q13029 1718 aa35.85■■■■□ 3.33
CTPS1-206ENST00000470271 WDR62O43379 1518 aa35.8■■■■□ 3.32
CTPS1-206ENST00000470271 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
CTPS1-206ENST00000470271 ABCC8Q09428 1581 aa35.39■■■■□ 3.26
CTPS1-206ENST00000470271 TOPBP1Q92547 1522 aa35.38■■■■□ 3.25
CTPS1-206ENST00000470271 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.33■■■■□ 3.25
CTPS1-206ENST00000470271 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.24■■■■□ 3.23
CTPS1-206ENST00000470271 IFT140Q96RY7 1462 aa35.2■■■■□ 3.23
CTPS1-206ENST00000470271 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.08■■■■□ 3.21
CTPS1-206ENST00000470271 CUX1P39880 1505 aa35.07■■■■□ 3.21
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.05■■■■□ 3.2
CTPS1-206ENST00000470271 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35■■■■□ 3.19
CTPS1-206ENST00000470271 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.98■■■■□ 3.19
CTPS1-206ENST00000470271 SOGA1O94964 1423 aa34.95■■■■□ 3.19
CTPS1-206ENST00000470271 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.93■■■■□ 3.18
CTPS1-206ENST00000470271 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.9■■■■□ 3.18
CTPS1-206ENST00000470271 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.84■■■■□ 3.17
CTPS1-206ENST00000470271 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.81■■■■□ 3.16
CTPS1-206ENST00000470271 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.76■■■■□ 3.16
CTPS1-206ENST00000470271 TOP2BQ02880 1626 aa34.73■■■■□ 3.15
CTPS1-206ENST00000470271 WDR97A6NE52 1622 aa34.73■■■■□ 3.15
CTPS1-206ENST00000470271 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.73■■■■□ 3.15
CTPS1-206ENST00000470271 SYNJ1O43426 1573 aa34.72■■■■□ 3.15
CTPS1-206ENST00000470271 OSCARQ8IYS5 282 aa34.7■■■■□ 3.15
CTPS1-206ENST00000470271 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.63■■■■□ 3.13
CTPS1-206ENST00000470271 GRIN2BQ13224 1484 aa34.55■■■■□ 3.12
CTPS1-206ENST00000470271 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.54■■■■□ 3.12
CTPS1-206ENST00000470271 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.52■■■■□ 3.12
CTPS1-206ENST00000470271 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.49■■■■□ 3.11
CTPS1-206ENST00000470271 CHD1O14646 1710 aa34.47■■■■□ 3.11
CTPS1-206ENST00000470271 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
CTPS1-206ENST00000470271 FBLN2P98095 1184 aa34.47■■■■□ 3.11
CTPS1-206ENST00000470271 PBRM1Q86U86 1689 aa34.45■■■■□ 3.11
CTPS1-206ENST00000470271 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.36■■■■□ 3.09
CTPS1-206ENST00000470271 SYNJ2O15056 1496 aa34.33■■■■□ 3.09
CTPS1-206ENST00000470271 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.22■■■■□ 3.07
CTPS1-206ENST00000470271 ADAMTS12P58397 1594 aa34.18■■■■□ 3.06
CTPS1-206ENST00000470271 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.13■■■■□ 3.05
CTPS1-206ENST00000470271 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.12■■■■□ 3.05
CTPS1-206ENST00000470271 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.12■■■■□ 3.05
CTPS1-206ENST00000470271 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.12■■■■□ 3.05
CTPS1-206ENST00000470271 KIF27Q86VH2 1401 aa34.11■■■■□ 3.05
CTPS1-206ENST00000470271 ARHGEF11O15085 1522 aa34.1■■■■□ 3.05
CTPS1-206ENST00000470271 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.1■■■■□ 3.05
CTPS1-206ENST00000470271 GRIN2AQ12879 1464 aa34.1■■■■□ 3.05
CTPS1-206ENST00000470271 TRIM41Q8WV44 630 aa34.05■■■■□ 3.04
CTPS1-206ENST00000470271 IGF1RP08069 1367 aa33.98■■■■□ 3.03
CTPS1-206ENST00000470271 NUP160Q12769 1436 aa33.96■■■■□ 3.03
CTPS1-206ENST00000470271 CEP170Q5SW79 1584 aa33.93■■■■□ 3.02
CTPS1-206ENST00000470271 CUL7Q14999 1698 aa33.88■■■■□ 3.01
CTPS1-206ENST00000470271 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.83■■■■□ 3.01
CTPS1-206ENST00000470271 ARAP1Q96P48 1450 aa33.82■■■■□ 3.01
CTPS1-206ENST00000470271 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.78■■■■□ 3
CTPS1-206ENST00000470271 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.74■■■□□ 2.99
CTPS1-206ENST00000470271 SHROOM2Q13796 1616 aa33.69■■■□□ 2.98
CTPS1-206ENST00000470271 JPH4Q96JJ6 628 aa33.63■■■□□ 2.97
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