RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486889.1

CTPS1-210, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTPS1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-210ENST00000486889 NISCHQ9Y2I1 1504 aa22.67■■□□□ 1.22
CTPS1-210ENST00000486889 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa20.06■□□□□ 0.8
CTPS1-210ENST00000486889 ABCC9O60706 1549 aa19.54■□□□□ 0.72
CTPS1-210ENST00000486889 DCAF8L2P0C7V8 631 aa18.96■□□□□ 0.63
CTPS1-210ENST00000486889 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
CTPS1-210ENST00000486889 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa18.82■□□□□ 0.6
CTPS1-210ENST00000486889 NACADO15069 1562 aa18.81■□□□□ 0.6
CTPS1-210ENST00000486889 MYO15BQ96JP2 1530 aa18.8■□□□□ 0.6
CTPS1-210ENST00000486889 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa18.77■□□□□ 0.6
CTPS1-210ENST00000486889 SCRIBQ14160 1630 aa18.27■□□□□ 0.52
CTPS1-210ENST00000486889 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP18.23■□□□□ 0.51
CTPS1-210ENST00000486889 DNAJC5BQ9UF47 199 aa18.19■□□□□ 0.5
CTPS1-210ENST00000486889 UNC13AQ9UPW8 1703 aa18.16■□□□□ 0.5
CTPS1-210ENST00000486889 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa18.1■□□□□ 0.49
CTPS1-210ENST00000486889 BICRAQ9NZM4 1560 aa18■□□□□ 0.47
CTPS1-210ENST00000486889 CHIC1Q5VXU3 224 aa17.76■□□□□ 0.43
CTPS1-210ENST00000486889 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP17.65■□□□□ 0.42
CTPS1-210ENST00000486889 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP17.62■□□□□ 0.41
CTPS1-210ENST00000486889 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa17.6■□□□□ 0.41
CTPS1-210ENST00000486889 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
CTPS1-210ENST00000486889 CECR2Q9BXF3 1484 aa17.56■□□□□ 0.4
CTPS1-210ENST00000486889 SMARCA4P51532 1647 aa17.51■□□□□ 0.39
CTPS1-210ENST00000486889 SMARCA2P51531 1590 aa17.44■□□□□ 0.38
CTPS1-210ENST00000486889 MROH2BQ7Z745 1585 aa17.41■□□□□ 0.38
CTPS1-210ENST00000486889 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
CTPS1-210ENST00000486889 PEG3Q9GZU2 1588 aa17.34■□□□□ 0.37
CTPS1-210ENST00000486889 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa17.33■□□□□ 0.37
CTPS1-210ENST00000486889 NCAPD3P42695 1498 aa17.31■□□□□ 0.36
CTPS1-210ENST00000486889 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
CTPS1-210ENST00000486889 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
CTPS1-210ENST00000486889 HMGXB3Q12766 1538 aa17.27■□□□□ 0.36
CTPS1-210ENST00000486889 WIZO95785 1651 aa17.26■□□□□ 0.35
CTPS1-210ENST00000486889 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
CTPS1-210ENST00000486889 CCDC88BA6NC98 1476 aa16.93■□□□□ 0.3
CTPS1-210ENST00000486889 ERCC6Q03468 1493 aa16.92■□□□□ 0.3
CTPS1-210ENST00000486889 CADPSQ9ULU8 1353 aa16.86■□□□□ 0.29
CTPS1-210ENST00000486889 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa16.85■□□□□ 0.29
CTPS1-210ENST00000486889 CFTRP13569 1480 aa16.79■□□□□ 0.28
CTPS1-210ENST00000486889 PDS5BQ9NTI5 1447 aa16.79■□□□□ 0.28
CTPS1-210ENST00000486889 NESP48681 1621 aa16.76■□□□□ 0.27
CTPS1-210ENST00000486889 CUX2O14529 1486 aa16.74■□□□□ 0.27
CTPS1-210ENST00000486889 PRDM2Q13029 1718 aa16.7■□□□□ 0.26
CTPS1-210ENST00000486889 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa16.69■□□□□ 0.26
CTPS1-210ENST00000486889 FANCD2Q9BXW9 1451 aa16.65■□□□□ 0.26
CTPS1-210ENST00000486889 CEP164Q9UPV0 1460 aa16.64■□□□□ 0.25
CTPS1-210ENST00000486889 ABCC8Q09428 1581 aa16.56■□□□□ 0.24
CTPS1-210ENST00000486889 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa16.55■□□□□ 0.24
CTPS1-210ENST00000486889 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
CTPS1-210ENST00000486889 MRC2Q9UBG0 1479 aa16.52■□□□□ 0.23
CTPS1-210ENST00000486889 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP16.45■□□□□ 0.22
CTPS1-210ENST00000486889 DNMBPQ6XZF7 1577 aa16.43■□□□□ 0.22
CTPS1-210ENST00000486889 WDR62O43379 1518 aa16.4■□□□□ 0.22
CTPS1-210ENST00000486889 TRIM41Q8WV44 630 aa16.39■□□□□ 0.21
CTPS1-210ENST00000486889 TOPBP1Q92547 1522 aa16.39■□□□□ 0.21
CTPS1-210ENST00000486889 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
CTPS1-210ENST00000486889 TOP2BQ02880 1626 aa16.34■□□□□ 0.21
CTPS1-210ENST00000486889 CUX1P39880 1505 aa16.33■□□□□ 0.2
CTPS1-210ENST00000486889 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa16.32■□□□□ 0.2
CTPS1-210ENST00000486889 SYNJ1O43426 1573 aa16.28■□□□□ 0.2
CTPS1-210ENST00000486889 FGD5Q6ZNL6 1462 aa16.28■□□□□ 0.2
CTPS1-210ENST00000486889 IFT140Q96RY7 1462 aa16.28■□□□□ 0.2
CTPS1-210ENST00000486889 SOGA1O94964 1423 aa16.28■□□□□ 0.2
CTPS1-210ENST00000486889 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
CTPS1-210ENST00000486889 WDR97A6NE52 1622 aa16.18■□□□□ 0.18
CTPS1-210ENST00000486889 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa16.16■□□□□ 0.18
CTPS1-210ENST00000486889 KIF27Q86VH2 1401 aa16.15■□□□□ 0.18
CTPS1-210ENST00000486889 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa16.15■□□□□ 0.18
CTPS1-210ENST00000486889 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
CTPS1-210ENST00000486889 EEA1Q15075 1411 aa16.11■□□□□ 0.17
CTPS1-210ENST00000486889 OSCARQ8IYS5 282 aa16.09■□□□□ 0.17
CTPS1-210ENST00000486889 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CTPS1-210ENST00000486889 GAPVD1Q14C86 1478 aa16.08■□□□□ 0.16
CTPS1-210ENST00000486889 GRIN2BQ13224 1484 aa16.05■□□□□ 0.16
CTPS1-210ENST00000486889 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CTPS1-210ENST00000486889 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.163e-9■■□□□ 13.5
CTPS1-210ENST00000486889 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa16.01■□□□□ 0.15
CTPS1-210ENST00000486889 ERICH3Q5RHP9 1530 aa16.01■□□□□ 0.15
CTPS1-210ENST00000486889 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
CTPS1-210ENST00000486889 CSRNP3Q8WYN3 585 aa15.98■□□□□ 0.15
CTPS1-210ENST00000486889 PBRM1Q86U86 1689 aa15.97■□□□□ 0.15
CTPS1-210ENST00000486889 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CTPS1-210ENST00000486889 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CTPS1-210ENST00000486889 CUL7Q14999 1698 aa15.95■□□□□ 0.14
CTPS1-210ENST00000486889 IGF1RP08069 1367 aa15.93■□□□□ 0.14
CTPS1-210ENST00000486889 FBLN2P98095 1184 aa15.93■□□□□ 0.14
CTPS1-210ENST00000486889 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.93■□□□□ 0.14
CTPS1-210ENST00000486889 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.92■□□□□ 0.14
CTPS1-210ENST00000486889 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa15.91■□□□□ 0.14
CTPS1-210ENST00000486889 SYNJ2O15056 1496 aa15.9■□□□□ 0.14
CTPS1-210ENST00000486889 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa15.88■□□□□ 0.13
CTPS1-210ENST00000486889 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa15.86■□□□□ 0.13
CTPS1-210ENST00000486889 ADAMTS12P58397 1594 aa15.86■□□□□ 0.13
CTPS1-210ENST00000486889 GRIN2AQ12879 1464 aa15.8■□□□□ 0.12
CTPS1-210ENST00000486889 PRXQ9BXM0 1461 aa15.8■□□□□ 0.12
CTPS1-210ENST00000486889 CHD1O14646 1710 aa15.8■□□□□ 0.12
CTPS1-210ENST00000486889 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa15.79■□□□□ 0.12
CTPS1-210ENST00000486889 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa15.79■□□□□ 0.12
CTPS1-210ENST00000486889 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa15.79■□□□□ 0.12
CTPS1-210ENST00000486889 UBTFP17480 764 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
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