Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 CALCOCO2-224ENST00000514962 765 ntTSL 26.41□□□□□ -1.382e-7■□□□□ 9
SF3B4Q15427 NDUFS1-208ENST00000456284 563 ntTSL 46.03□□□□□ -1.442e-7■□□□□ 9
SF3B4Q15427 PA2G4-204ENST00000552266 779 ntTSL 26.03□□□□□ -1.442e-7■□□□□ 9
SF3B4Q15427 PPWD1-202ENST00000502703 570 ntTSL 45.43□□□□□ -1.542e-7■□□□□ 9
SF3B4Q15427 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.612e-7■□□□□ 9
SF3B4Q15427 TM9SF2-202ENST00000463709 727 ntTSL 34.74□□□□□ -1.652e-7■□□□□ 9
SF3B4Q15427 PPWD1-205ENST00000507608 987 ntTSL 33.88□□□□□ -1.792e-7■□□□□ 9
SF3B4Q15427 MYB-228ENST00000529297 343 ntTSL 1 (best)3.68□□□□□ -1.827e-14■□□□□ 9
SF3B4Q15427 UBE2Q1-204ENST00000476612 301 ntTSL 33.55□□□□□ -1.842e-7■□□□□ 9
SF3B4Q15427 PPWD1-204ENST00000505380 829 ntTSL 33.5□□□□□ -1.852e-7■□□□□ 9
SF3B4Q15427 TFRC-213ENST00000482479 540 ntTSL 34.24□□□□□ -1.732e-16■□□□□ 9
SF3B4Q15427 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC1.26□□□□□ -2.211e-323■□□□□ 9
SF3B4Q15427 FXR1-209ENST00000472339 2130 ntTSL 514.53□□□□□ -0.081e-6■□□□□ 9
SF3B4Q15427 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.191e-6■□□□□ 9
SF3B4Q15427 FXR1-211ENST00000475315 2341 ntTSL 212.08□□□□□ -0.481e-6■□□□□ 9
SF3B4Q15427 FXR1-220ENST00000491062 1768 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.541e-6■□□□□ 9
SF3B4Q15427 FXR1-207ENST00000468861 1989 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.591e-6■□□□□ 9
SF3B4Q15427 FXR1-201ENST00000305586 3277 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.791e-6■□□□□ 9
SF3B4Q15427 FXR1-202ENST00000357559 8711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.831e-6■□□□□ 9
SF3B4Q15427 FXR1-203ENST00000445140 2651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.141e-6■□□□□ 9
SF3B4Q15427 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.851e-323■□□□□ 9
SF3B4Q15427 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.092e-9■□□□□ 9
SF3B4Q15427 SOCS2-209ENST00000549887 984 ntTSL 321.89■■□□□ 1.092e-9■□□□□ 9
SF3B4Q15427 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.872e-9■□□□□ 9
SF3B4Q15427 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.842e-9■□□□□ 9
SF3B4Q15427 SOCS2-204ENST00000548091 744 ntTSL 319.31■□□□□ 0.682e-9■□□□□ 9
SF3B4Q15427 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.652e-9■□□□□ 9
SF3B4Q15427 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.532e-9■□□□□ 9
SF3B4Q15427 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.492e-9■□□□□ 9
SF3B4Q15427 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.432e-9■□□□□ 9
SF3B4Q15427 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.432e-9■□□□□ 9
SF3B4Q15427 SOCS2-203ENST00000547229 462 ntTSL 217.01■□□□□ 0.312e-9■□□□□ 9
SF3B4Q15427 PGGHG-207ENST00000482937 734 ntTSL 515□□□□□ -0.012e-9■□□□□ 9
SF3B4Q15427 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.162e-9■□□□□ 9
SF3B4Q15427 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.222e-9■□□□□ 9
SF3B4Q15427 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.232e-9■□□□□ 9
SF3B4Q15427 PSIP1-205ENST00000397519 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.712e-9■□□□□ 9
SF3B4Q15427 COCH-207ENST00000553833 635 ntTSL 56.91□□□□□ -1.32e-9■□□□□ 9
SF3B4Q15427 CELF1-216ENST00000532146 473 ntTSL 34.45□□□□□ -1.72e-9■□□□□ 9
SF3B4Q15427 ERBIN-210ENST00000507128 561 ntTSL 34.42□□□□□ -1.72e-9■□□□□ 9
SF3B4Q15427 PSIP1-211ENST00000495873 863 ntTSL 24.39□□□□□ -1.712e-9■□□□□ 9
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SF3B4Q15427 TMBIM6-220ENST00000549966 538 ntTSL 57.52□□□□□ -1.211e-10■□□□□ 9
SF3B4Q15427 TMBIM6-204ENST00000546796 556 ntTSL 56.75□□□□□ -1.331e-10■□□□□ 9
SF3B4Q15427 TMBIM6-226ENST00000552635 574 ntTSL 46.33□□□□□ -1.41e-10■□□□□ 9
SF3B4Q15427 TMBIM6-210ENST00000547832 640 ntTSL 36.24□□□□□ -1.411e-10■□□□□ 9
SF3B4Q15427 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.462e-45■□□□□ 9
SF3B4Q15427 KMT2C-211ENST00000490130 641 ntTSL 24.32□□□□□ -1.725e-15■□□□□ 9
SF3B4Q15427 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.064e-14■□□□□ 9
SF3B4Q15427 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.264e-14■□□□□ 9
SF3B4Q15427 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.434e-14■□□□□ 9
SF3B4Q15427 TGOLN2-206ENST00000444342 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.544e-14■□□□□ 9
SF3B4Q15427 TGOLN2-202ENST00000377386 6489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.674e-14■□□□□ 9
SF3B4Q15427 TGOLN2-201ENST00000282120 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.914e-14■□□□□ 9
SF3B4Q15427 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.182e-46■□□□□ 9
SF3B4Q15427 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.392e-46■□□□□ 9
SF3B4Q15427 PRAME-209ENST00000439106 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 312.51□□□□□ -0.412e-46■□□□□ 9
SF3B4Q15427 PRAME-201ENST00000398741 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.432e-46■□□□□ 9
SF3B4Q15427 PRAME-213ENST00000492657 2831 ntTSL 1 (best)12.34□□□□□ -0.432e-46■□□□□ 9
SF3B4Q15427 PRAME-211ENST00000476336 589 ntTSL 212.24□□□□□ -0.452e-46■□□□□ 9
SF3B4Q15427 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.462e-46■□□□□ 9
SF3B4Q15427 PRAME-203ENST00000402697 2057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.492e-46■□□□□ 9
SF3B4Q15427 PRAME-207ENST00000420709 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 211.7□□□□□ -0.542e-46■□□□□ 9
SF3B4Q15427 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.542e-46■□□□□ 9
SF3B4Q15427 PRAME-212ENST00000485532 709 ntTSL 311.45□□□□□ -0.582e-46■□□□□ 9
SF3B4Q15427 PRAME-204ENST00000403441 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 311.33□□□□□ -0.62e-46■□□□□ 9
SF3B4Q15427 PRAME-208ENST00000438888 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 411.22□□□□□ -0.612e-46■□□□□ 9
SF3B4Q15427 PRAME-210ENST00000442481 581 ntTSL 310.77□□□□□ -0.692e-46■□□□□ 9
SF3B4Q15427 RNF10-218ENST00000543578 548 ntTSL 45.09□□□□□ -1.592e-6■□□□□ 9
SF3B4Q15427 HMBOX1-209ENST00000522468 817 ntTSL 312.81□□□□□ -0.366e-12■□□□□ 9
SF3B4Q15427 PSME2-206ENST00000559042 643 nt12.45□□□□□ -0.423e-8■□□□□ 9
SF3B4Q15427 PSME2-205ENST00000559005 496 ntTSL 27.75□□□□□ -1.173e-8■□□□□ 9
SF3B4Q15427 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.558e-9■□□□□ 9
SF3B4Q15427 TPTEP1-202ENST00000400593 1430 ntTSL 1 (best)14.28□□□□□ -0.128e-9■□□□□ 9
SF3B4Q15427 TPTEP1-204ENST00000426585 5725 ntTSL 1 (best)11.83□□□□□ -0.528e-9■□□□□ 9
SF3B4Q15427 TPTEP1-201ENST00000383140 971 ntTSL 1 (best)7.23□□□□□ -1.258e-9■□□□□ 9
SF3B4Q15427 TPTEP1-206ENST00000585784 473 ntTSL 25□□□□□ -1.618e-9■□□□□ 9
SF3B4Q15427 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC3.05□□□□□ -1.928e-9■□□□□ 9
SF3B4Q15427 SHARPIN-205ENST00000531375 613 ntTSL 223.65■■□□□ 1.383e-6■□□□□ 8.9
SF3B4Q15427 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.193e-6■□□□□ 8.9
SF3B4Q15427 SHARPIN-201ENST00000359551 1687 ntTSL 1 (best)22.01■■□□□ 1.113e-6■□□□□ 8.9
SF3B4Q15427 SHARPIN-209ENST00000534242 933 ntTSL 220.9■□□□□ 0.943e-6■□□□□ 8.9
SF3B4Q15427 SHARPIN-208ENST00000533948 981 ntTSL 513.19□□□□□ -0.33e-6■□□□□ 8.9
SF3B4Q15427 SHARPIN-210ENST00000534435 656 ntTSL 27.46□□□□□ -1.223e-6■□□□□ 8.9
SF3B4Q15427 SHARPIN-207ENST00000533184 352 ntTSL 36.68□□□□□ -1.343e-6■□□□□ 8.9
SF3B4Q15427 STT3A-209ENST00000527456 481 ntTSL 54.51□□□□□ -1.692e-6■□□□□ 8.9
SF3B4Q15427 RAF1-210ENST00000491290 572 ntTSL 42.75□□□□□ -1.975e-8■□□□□ 8.9
SF3B4Q15427 EXOSC10-211ENST00000498576 486 ntTSL 48.55□□□□□ -1.045e-7■□□□□ 8.9
SF3B4Q15427 TOMM40-204ENST00000589253 207 ntTSL 310.5□□□□□ -0.731e-7■□□□□ 8.9
SF3B4Q15427 SYMPK-208ENST00000598059 611 ntTSL 419.45■□□□□ 0.74e-6■□□□□ 8.9
SF3B4Q15427 SYMPK-205ENST00000594293 623 ntTSL 416.06■□□□□ 0.164e-6■□□□□ 8.9
SF3B4Q15427 SYMPK-218ENST00000602061 503 ntTSL 411.73□□□□□ -0.534e-6■□□□□ 8.9
SF3B4Q15427 MDK-208ENST00000481047 775 ntTSL 221.1■□□□□ 0.971e-8■□□□□ 8.9
SF3B4Q15427 MDK-210ENST00000490240 603 ntTSL 1 (best)17.01■□□□□ 0.311e-8■□□□□ 8.9
SF3B4Q15427 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.131e-8■□□□□ 8.9
SF3B4Q15427 MED16-215ENST00000621073 492 ntTSL 513.62□□□□□ -0.231e-8■□□□□ 8.9
SF3B4Q15427 CABIN1-213ENST00000496016 557 ntTSL 211.76□□□□□ -0.531e-8■□□□□ 8.9
SF3B4Q15427 TUBB-208ENST00000396389 2903 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.781e-8■□□□□ 8.9
SF3B4Q15427 TUBB-205ENST00000327892 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.791e-8■□□□□ 8.9
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