RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476612.1

UBE2Q1-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2Q1, Length 301 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-204ENST00000476612 NISCHQ9Y2I1 1504 aa9.83□□□□□ -0.84
UBE2Q1-204ENST00000476612 ABCC9O60706 1549 aa8.66□□□□□ -1.02
UBE2Q1-204ENST00000476612 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa8.65□□□□□ -1.03
UBE2Q1-204ENST00000476612 DCAF8L2P0C7V8 631 aa8.3□□□□□ -1.08
UBE2Q1-204ENST00000476612 NACADO15069 1562 aa8.21□□□□□ -1.1
UBE2Q1-204ENST00000476612 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa8.21□□□□□ -1.1
UBE2Q1-204ENST00000476612 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP8.16□□□□□ -1.1
UBE2Q1-204ENST00000476612 DNAJC5BQ9UF47 199 aa8.16□□□□□ -1.1
UBE2Q1-204ENST00000476612 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
UBE2Q1-204ENST00000476612 MYO15BQ96JP2 1530 aa8.14□□□□□ -1.11
UBE2Q1-204ENST00000476612 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa8.09□□□□□ -1.11
UBE2Q1-204ENST00000476612 BICRAQ9NZM4 1560 aa8.05□□□□□ -1.12
UBE2Q1-204ENST00000476612 UNC13AQ9UPW8 1703 aa8□□□□□ -1.13
UBE2Q1-204ENST00000476612 SCRIBQ14160 1630 aa7.95□□□□□ -1.14
UBE2Q1-204ENST00000476612 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa7.85□□□□□ -1.15
UBE2Q1-204ENST00000476612 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
UBE2Q1-204ENST00000476612 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa7.78□□□□□ -1.16
UBE2Q1-204ENST00000476612 CECR2Q9BXF3 1484 aa7.77□□□□□ -1.17
UBE2Q1-204ENST00000476612 NCAPD3P42695 1498 aa7.65□□□□□ -1.18
UBE2Q1-204ENST00000476612 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa7.63□□□□□ -1.19
UBE2Q1-204ENST00000476612 MROH2BQ7Z745 1585 aa7.6□□□□□ -1.19
UBE2Q1-204ENST00000476612 SMARCA4P51532 1647 aa7.6□□□□□ -1.19
UBE2Q1-204ENST00000476612 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
UBE2Q1-204ENST00000476612 SMARCA2P51531 1590 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2Q1-204ENST00000476612 PEG3Q9GZU2 1588 aa7.53□□□□□ -1.2
UBE2Q1-204ENST00000476612 HMGXB3Q12766 1538 aa7.52□□□□□ -1.2
UBE2Q1-204ENST00000476612 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
UBE2Q1-204ENST00000476612 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
UBE2Q1-204ENST00000476612 NESP48681 1621 aa7.5□□□□□ -1.21
UBE2Q1-204ENST00000476612 WIZO95785 1651 aa7.47□□□□□ -1.21
UBE2Q1-204ENST00000476612 CADPSQ9ULU8 1353 aa7.42□□□□□ -1.22
UBE2Q1-204ENST00000476612 ERCC6Q03468 1493 aa7.41□□□□□ -1.22
UBE2Q1-204ENST00000476612 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa7.37□□□□□ -1.23
UBE2Q1-204ENST00000476612 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
UBE2Q1-204ENST00000476612 CUX2O14529 1486 aa7.36□□□□□ -1.23
UBE2Q1-204ENST00000476612 PDS5BQ9NTI5 1447 aa7.36□□□□□ -1.23
UBE2Q1-204ENST00000476612 CCDC88BA6NC98 1476 aa7.35□□□□□ -1.23
UBE2Q1-204ENST00000476612 CFTRP13569 1480 aa7.35□□□□□ -1.23
UBE2Q1-204ENST00000476612 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa7.33□□□□□ -1.24
UBE2Q1-204ENST00000476612 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
UBE2Q1-204ENST00000476612 FANCD2Q9BXW9 1451 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2Q1-204ENST00000476612 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2Q1-204ENST00000476612 MRC2Q9UBG0 1479 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2Q1-204ENST00000476612 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
UBE2Q1-204ENST00000476612 CEP164Q9UPV0 1460 aa7.27□□□□□ -1.25
UBE2Q1-204ENST00000476612 WDR62O43379 1518 aa7.26□□□□□ -1.25
UBE2Q1-204ENST00000476612 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
UBE2Q1-204ENST00000476612 TOPBP1Q92547 1522 aa7.18□□□□□ -1.26
UBE2Q1-204ENST00000476612 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
UBE2Q1-204ENST00000476612 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.279e-8■■■■■ 30.5
UBE2Q1-204ENST00000476612 IFT140Q96RY7 1462 aa7.13□□□□□ -1.27
UBE2Q1-204ENST00000476612 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa7.13□□□□□ -1.27
UBE2Q1-204ENST00000476612 ABCC8Q09428 1581 aa7.12□□□□□ -1.27
UBE2Q1-204ENST00000476612 DNMBPQ6XZF7 1577 aa7.12□□□□□ -1.27
UBE2Q1-204ENST00000476612 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
UBE2Q1-204ENST00000476612 CUX1P39880 1505 aa7.11□□□□□ -1.27
UBE2Q1-204ENST00000476612 SOGA1O94964 1423 aa7.11□□□□□ -1.27
UBE2Q1-204ENST00000476612 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
UBE2Q1-204ENST00000476612 PRDM2Q13029 1718 aa7.11□□□□□ -1.27
UBE2Q1-204ENST00000476612 OSCARQ8IYS5 282 aa7.11□□□□□ -1.27
UBE2Q1-204ENST00000476612 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
UBE2Q1-204ENST00000476612 FGD5Q6ZNL6 1462 aa7.08□□□□□ -1.28
UBE2Q1-204ENST00000476612 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
UBE2Q1-204ENST00000476612 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP7.03□□□□□ -1.28
UBE2Q1-204ENST00000476612 FBLN2P98095 1184 aa7.03□□□□□ -1.28
UBE2Q1-204ENST00000476612 TRIM41Q8WV44 630 aa7.03□□□□□ -1.28
UBE2Q1-204ENST00000476612 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa7.01□□□□□ -1.29
UBE2Q1-204ENST00000476612 SYNJ1O43426 1573 aa7.01□□□□□ -1.29
UBE2Q1-204ENST00000476612 GRIN2BQ13224 1484 aa7□□□□□ -1.29
UBE2Q1-204ENST00000476612 GAPVD1Q14C86 1478 aa7□□□□□ -1.29
UBE2Q1-204ENST00000476612 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa7□□□□□ -1.29
UBE2Q1-204ENST00000476612 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
UBE2Q1-204ENST00000476612 TOP2BQ02880 1626 aa6.99□□□□□ -1.29
UBE2Q1-204ENST00000476612 CYB5RLQ6IPT4 315 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2Q1-204ENST00000476612 WDR97A6NE52 1622 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2Q1-204ENST00000476612 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2Q1-204ENST00000476612 SYNJ2O15056 1496 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2Q1-204ENST00000476612 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
UBE2Q1-204ENST00000476612 ARHGEF11O15085 1522 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2Q1-204ENST00000476612 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2Q1-204ENST00000476612 IGF1RP08069 1367 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2Q1-204ENST00000476612 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa6.94□□□□□ -1.3
UBE2Q1-204ENST00000476612 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa6.94□□□□□ -1.3
UBE2Q1-204ENST00000476612 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa6.94□□□□□ -1.3
UBE2Q1-204ENST00000476612 CHD1O14646 1710 aa6.94□□□□□ -1.3
UBE2Q1-204ENST00000476612 CLASP1Q7Z460 1538 aa6.93□□□□□ -1.3
UBE2Q1-204ENST00000476612 ARAP1Q96P48 1450 aa6.92□□□□□ -1.3
UBE2Q1-204ENST00000476612 FHAD1B1AJZ9 1412 aa6.92□□□□□ -1.3
UBE2Q1-204ENST00000476612 NUP160Q12769 1436 aa6.91□□□□□ -1.3
UBE2Q1-204ENST00000476612 GRIN2AQ12879 1464 aa6.91□□□□□ -1.3
UBE2Q1-204ENST00000476612 PBRM1Q86U86 1689 aa6.9□□□□□ -1.31
UBE2Q1-204ENST00000476612 ERICH3Q5RHP9 1530 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2Q1-204ENST00000476612 ADAMTS12P58397 1594 aa6.88□□□□□ -1.31
UBE2Q1-204ENST00000476612 CEP170Q5SW79 1584 aa6.88□□□□□ -1.31
UBE2Q1-204ENST00000476612 ERCC6L2Q5T890 1561 aa6.88□□□□□ -1.31
UBE2Q1-204ENST00000476612 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa6.88□□□□□ -1.31
UBE2Q1-204ENST00000476612 JPH4Q96JJ6 628 aa6.88□□□□□ -1.31
UBE2Q1-204ENST00000476612 KIF27Q86VH2 1401 aa6.87□□□□□ -1.31
UBE2Q1-204ENST00000476612 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa6.86□□□□□ -1.31
UBE2Q1-204ENST00000476612 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.32
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