RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380716.8

PSIP1-202, Transcript of PC4 and SFRS1 interacting protein 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PSIP1, Length 1,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSIP1-202ENST00000380716 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.73■■■■■ 6.03
PSIP1-202ENST00000380716 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.29■■■■■ 5
PSIP1-202ENST00000380716 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.21■■■■■ 4.67
PSIP1-202ENST00000380716 ABCC9O60706 1549 aa44■■■■■ 4.63
PSIP1-202ENST00000380716 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.68■■■■■ 4.58
PSIP1-202ENST00000380716 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.59■■■■■ 4.57
PSIP1-202ENST00000380716 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.35■■■■■ 4.53
PSIP1-202ENST00000380716 NACADO15069 1562 aa43.2■■■■■ 4.51
PSIP1-202ENST00000380716 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.93■■■■■ 4.46
PSIP1-202ENST00000380716 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.56■■■■■ 4.4
PSIP1-202ENST00000380716 SCRIBQ14160 1630 aa42.38■■■■■ 4.38
PSIP1-202ENST00000380716 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.97■■■■■ 4.31
PSIP1-202ENST00000380716 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.52■■■■■ 4.24
PSIP1-202ENST00000380716 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.34■■■■■ 4.21
PSIP1-202ENST00000380716 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.9■■■■■ 4.14
PSIP1-202ENST00000380716 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.81■■■■■ 4.12
PSIP1-202ENST00000380716 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.12
PSIP1-202ENST00000380716 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.69■■■■■ 4.1
PSIP1-202ENST00000380716 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.65■■■■■ 4.1
PSIP1-202ENST00000380716 SMARCA4P51532 1647 aa40.64■■■■■ 4.1
PSIP1-202ENST00000380716 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.37■■■■■ 4.05
PSIP1-202ENST00000380716 WIZO95785 1651 aa40.31■■■■■ 4.04
PSIP1-202ENST00000380716 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.2■■■■■ 4.03
PSIP1-202ENST00000380716 SMARCA2P51531 1590 aa40.11■■■■■ 4.01
PSIP1-202ENST00000380716 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.05■■■■■ 4
PSIP1-202ENST00000380716 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.96■■■■□ 3.99
PSIP1-202ENST00000380716 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.87■■■■□ 3.97
PSIP1-202ENST00000380716 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.85■■■■□ 3.97
PSIP1-202ENST00000380716 NCAPD3P42695 1498 aa39.81■■■■□ 3.96
PSIP1-202ENST00000380716 HMGXB3Q12766 1538 aa39.78■■■■□ 3.96
PSIP1-202ENST00000380716 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.47■■■■□ 3.91
PSIP1-202ENST00000380716 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.07■■■■□ 3.84
PSIP1-202ENST00000380716 CFTRP13569 1480 aa38.81■■■■□ 3.8
PSIP1-202ENST00000380716 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.78■■■■□ 3.8
PSIP1-202ENST00000380716 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.75■■■■□ 3.79
PSIP1-202ENST00000380716 PRDM2Q13029 1718 aa38.67■■■■□ 3.78
PSIP1-202ENST00000380716 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.59■■■■□ 3.77
PSIP1-202ENST00000380716 ABCC8Q09428 1581 aa38.48■■■■□ 3.75
PSIP1-202ENST00000380716 NESP48681 1621 aa38.46■■■■□ 3.75
PSIP1-202ENST00000380716 TRIM41Q8WV44 630 aa38.44■■■■□ 3.74
PSIP1-202ENST00000380716 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.37■■■■□ 3.73
PSIP1-202ENST00000380716 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.32■■■■□ 3.73
PSIP1-202ENST00000380716 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.29■■■■□ 3.72
PSIP1-202ENST00000380716 SYNJ1O43426 1573 aa38.18■■■■□ 3.7
PSIP1-202ENST00000380716 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.17■■■■□ 3.7
PSIP1-202ENST00000380716 TOP2BQ02880 1626 aa38.13■■■■□ 3.69
PSIP1-202ENST00000380716 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.09■■■■□ 3.69
PSIP1-202ENST00000380716 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.08■■■■□ 3.69
PSIP1-202ENST00000380716 CUX1P39880 1505 aa38.06■■■■□ 3.68
PSIP1-202ENST00000380716 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.93■■■■□ 3.66
PSIP1-202ENST00000380716 ERCC6Q03468 1493 aa37.87■■■■□ 3.65
PSIP1-202ENST00000380716 TOPBP1Q92547 1522 aa37.85■■■■□ 3.65
PSIP1-202ENST00000380716 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.83■■■■□ 3.65
PSIP1-202ENST00000380716 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.8■■■■□ 3.64
PSIP1-202ENST00000380716 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.74■■■■□ 3.63
PSIP1-202ENST00000380716 EEA1Q15075 1411 aa37.66■■■■□ 3.62
PSIP1-202ENST00000380716 SOGA1O94964 1423 aa37.65■■■■□ 3.62
PSIP1-202ENST00000380716 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.63■■■■□ 3.61
PSIP1-202ENST00000380716 WDR62O43379 1518 aa37.62■■■■□ 3.61
PSIP1-202ENST00000380716 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.61■■■■□ 3.61
PSIP1-202ENST00000380716 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.58■■■■□ 3.61
PSIP1-202ENST00000380716 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.48■■■■□ 3.59
PSIP1-202ENST00000380716 KIF27Q86VH2 1401 aa37.47■■■■□ 3.59
PSIP1-202ENST00000380716 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.44■■■■□ 3.58
PSIP1-202ENST00000380716 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.44■■■■□ 3.58
PSIP1-202ENST00000380716 CUX2O14529 1486 aa37.42■■■■□ 3.58
PSIP1-202ENST00000380716 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.38■■■■□ 3.57
PSIP1-202ENST00000380716 WDR97A6NE52 1622 aa37.35■■■■□ 3.57
PSIP1-202ENST00000380716 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.33■■■■□ 3.57
PSIP1-202ENST00000380716 IFT140Q96RY7 1462 aa37.28■■■■□ 3.56
PSIP1-202ENST00000380716 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa37.21■■■■□ 3.55
PSIP1-202ENST00000380716 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.17■■■■□ 3.54
PSIP1-202ENST00000380716 KIF21BO75037 1637 aa37.15■■■■□ 3.54
PSIP1-202ENST00000380716 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.13■■■■□ 3.53
PSIP1-202ENST00000380716 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.11■■■■□ 3.53
PSIP1-202ENST00000380716 IGF1RP08069 1367 aa37.09■■■■□ 3.53
PSIP1-202ENST00000380716 GOLGA3Q08378 1498 aa37.07■■■■□ 3.52
PSIP1-202ENST00000380716 PRXQ9BXM0 1461 aa37.05■■■■□ 3.52
PSIP1-202ENST00000380716 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.04■■■■□ 3.52
PSIP1-202ENST00000380716 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.03■■■■□ 3.52
PSIP1-202ENST00000380716 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.98■■■■□ 3.51
PSIP1-202ENST00000380716 CUL7Q14999 1698 aa36.98■■■■□ 3.51
PSIP1-202ENST00000380716 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.97■■■■□ 3.514e-6■■■■□ 21.2
PSIP1-202ENST00000380716 PBRM1Q86U86 1689 aa36.95■■■■□ 3.51
PSIP1-202ENST00000380716 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.94■■■■□ 3.5
PSIP1-202ENST00000380716 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.94■■■■□ 3.5
PSIP1-202ENST00000380716 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.93■■■■□ 3.5
PSIP1-202ENST00000380716 GRIN2BQ13224 1484 aa36.91■■■■□ 3.5
PSIP1-202ENST00000380716 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.88■■■■□ 3.49
PSIP1-202ENST00000380716 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.83■■■■□ 3.49
PSIP1-202ENST00000380716 ADAMTS12P58397 1594 aa36.72■■■■□ 3.47
PSIP1-202ENST00000380716 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.71■■■■□ 3.47
PSIP1-202ENST00000380716 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.67■■■■□ 3.46
PSIP1-202ENST00000380716 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.67■■■■□ 3.46
PSIP1-202ENST00000380716 CEP162Q5TB80 1403 aa36.6■■■■□ 3.45
PSIP1-202ENST00000380716 SYNJ2O15056 1496 aa36.51■■■■□ 3.43
PSIP1-202ENST00000380716 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.48■■■■□ 3.43
PSIP1-202ENST00000380716 GRIN2AQ12879 1464 aa36.44■■■■□ 3.42
PSIP1-202ENST00000380716 CLIP1P30622 1438 aa36.43■■■■□ 3.42
PSIP1-202ENST00000380716 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.41■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms