Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 DCAF6-204ENST00000432587 3522 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.141e-6■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 DCAF6-202ENST00000367840 3349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.951e-6■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 HSPA9-201ENST00000297185 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.613e-6■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 ALDH1A2-204ENST00000537372 3700 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.032e-6■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 ALDH1A2-202ENST00000347587 3297 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 ALDH1A2-207ENST00000558231 1664 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.572e-6■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 ALDH1A2-203ENST00000430119 3049 ntTSL 210.62□□□□□ -0.712e-6■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.33e-6■■■■■ 42.5
UTP3Q9NQZ2 VARS2-213ENST00000625423 3362 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.463e-6■■■■■ 42.5
UTP3Q9NQZ2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.486e-7■■■■■ 42.5
UTP3Q9NQZ2 NLK-201ENST00000407008 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.991e-6■■■■■ 42.5
UTP3Q9NQZ2 NLK-202ENST00000496808 1702 ntTSL 25.98□□□□□ -1.451e-6■■■■■ 42.5
UTP3Q9NQZ2 DDX3X-210ENST00000615313 568 ntTSL 420.58■□□□□ 0.892e-7■■■■■ 42.4
UTP3Q9NQZ2 DDX3X-206ENST00000542215 1592 ntTSL 219.23■□□□□ 0.672e-7■■■■■ 42.4
UTP3Q9NQZ2 DDX3X-208ENST00000611546 442 ntTSL 518.15■□□□□ 0.52e-7■■■■■ 42.4
UTP3Q9NQZ2 DDX3X-213ENST00000622198 409 ntTSL 418.15■□□□□ 0.52e-7■■■■■ 42.4
UTP3Q9NQZ2 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.142e-7■■■■■ 42.4
UTP3Q9NQZ2 DDX3X-203ENST00000457138 5346 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.352e-7■■■■■ 42.4
UTP3Q9NQZ2 DDX3X-217ENST00000629496 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.522e-7■■■■■ 42.4
UTP3Q9NQZ2 DDX3X-215ENST00000625837 3237 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.522e-7■■■■■ 42.4
UTP3Q9NQZ2 DDX3X-216ENST00000626301 3013 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.632e-7■■■■■ 42.4
UTP3Q9NQZ2 DDX3X-218ENST00000629785 3457 ntTSL 510.94□□□□□ -0.662e-7■■■■■ 42.4
UTP3Q9NQZ2 DDX3X-220ENST00000630370 3120 ntTSL 510.84□□□□□ -0.672e-7■■■■■ 42.4
UTP3Q9NQZ2 DDX3X-221ENST00000630858 3181 ntTSL 510.52□□□□□ -0.732e-7■■■■■ 42.4
UTP3Q9NQZ2 DDX3X-219ENST00000630255 3289 ntTSL 510.44□□□□□ -0.742e-7■■■■■ 42.4
UTP3Q9NQZ2 DDX3X-204ENST00000478993 3397 ntTSL 1 (best)9.84□□□□□ -0.832e-7■■■■■ 42.4
UTP3Q9NQZ2 DDX3X-222ENST00000631641 583 ntTSL 38.79□□□□□ -12e-7■■■■■ 42.4
UTP3Q9NQZ2 DDX3X-211ENST00000615742 485 ntTSL 48.7□□□□□ -1.022e-7■■■■■ 42.4
UTP3Q9NQZ2 DDX3X-202ENST00000441189 1051 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.022e-7■■■■■ 42.4
UTP3Q9NQZ2 KDM5B-204ENST00000456180 558 ntTSL 46.81□□□□□ -1.328e-9■■■■■ 42.4
UTP3Q9NQZ2 RANBP1-211ENST00000448394 688 ntTSL 215.48■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 42.4
UTP3Q9NQZ2 SRSF7-201ENST00000313117 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.473e-7■■■■■ 42.4
UTP3Q9NQZ2 SRSF7-209ENST00000446327 2453 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.493e-7■■■■■ 42.4
UTP3Q9NQZ2 SRSF7-205ENST00000425941 1944 ntTSL 510.7□□□□□ -0.73e-7■■■■■ 42.4
UTP3Q9NQZ2 SRSF7-204ENST00000425778 2857 ntTSL 29.77□□□□□ -0.853e-7■■■■■ 42.4
UTP3Q9NQZ2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.461e-6■■■■■ 42.4
UTP3Q9NQZ2 KLHL24-210ENST00000475827 545 ntTSL 416.83■□□□□ 0.281e-6■■■■■ 42.4
UTP3Q9NQZ2 CBX5-202ENST00000439541 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.673e-8■■■■■ 42.4
UTP3Q9NQZ2 CD46P1-201ENST00000441364 763 ntBASIC9.75□□□□□ -0.853e-8■■■■■ 42.4
UTP3Q9NQZ2 CBX5-203ENST00000547872 745 ntTSL 27.38□□□□□ -1.233e-8■■■■■ 42.4
UTP3Q9NQZ2 CBX5-204ENST00000550411 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.243e-8■■■■■ 42.4
UTP3Q9NQZ2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.625e-12■■■■■ 42.4
UTP3Q9NQZ2 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.175e-12■■■■■ 42.4
UTP3Q9NQZ2 PSME4-208ENST00000481518 886 ntTSL 524.53■■□□□ 1.526e-10■■■■■ 42.4
UTP3Q9NQZ2 AKT2-226ENST00000497948 456 ntTSL 312.29□□□□□ -0.446e-8■■■■■ 42.3
UTP3Q9NQZ2 AKT2-222ENST00000489375 734 ntTSL 511.42□□□□□ -0.586e-8■■■■■ 42.3
UTP3Q9NQZ2 AKT2-215ENST00000476247 488 ntTSL 38.16□□□□□ -1.16e-8■■■■■ 42.3
UTP3Q9NQZ2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.893e-6■■■■■ 42.3
UTP3Q9NQZ2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.653e-6■■■■■ 42.3
UTP3Q9NQZ2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.571e-11■■■■■ 42.3
UTP3Q9NQZ2 MRPL4-211ENST00000592514 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 524.29■■□□□ 1.483e-6■■■■■ 42.3
UTP3Q9NQZ2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.444e-6■■■■■ 42.3
UTP3Q9NQZ2 MRPL4-209ENST00000591054 777 ntTSL 323.79■■□□□ 1.43e-6■■■■■ 42.3
UTP3Q9NQZ2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.111e-11■■■■■ 42.3
UTP3Q9NQZ2 MRPL4-206ENST00000590150 747 ntTSL 521.67■■□□□ 1.063e-6■■■■■ 42.3
UTP3Q9NQZ2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.963e-6■■■■■ 42.3
UTP3Q9NQZ2 JAGN1-202ENST00000489724 342 ntTSL 318.74■□□□□ 0.594e-6■■■■■ 42.3
UTP3Q9NQZ2 UBXN2A-203ENST00000446425 2195 ntTSL 1 (best)17.74■□□□□ 0.431e-11■■■■■ 42.3
UTP3Q9NQZ2 DLAT-204ENST00000531306 1766 ntTSL 217.57■□□□□ 0.41e-11■■■■■ 42.3
UTP3Q9NQZ2 SSBP3-208ENST00000444533 560 ntTSL 315.08■□□□□ 01e-11■■■■■ 42.3
UTP3Q9NQZ2 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.051e-11■■■■■ 42.3
UTP3Q9NQZ2 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.111e-11■■■■■ 42.3
UTP3Q9NQZ2 DLAT-202ENST00000393051 3517 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.331e-11■■■■■ 42.3
UTP3Q9NQZ2 DLAT-201ENST00000280346 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.371e-11■■■■■ 42.3
UTP3Q9NQZ2 METAP1-211ENST00000514051 1058 ntTSL 1 (best)9.18□□□□□ -0.941e-11■■■■■ 42.3
UTP3Q9NQZ2 METAP1-207ENST00000510133 715 ntTSL 58.04□□□□□ -1.121e-11■■■■■ 42.3
UTP3Q9NQZ2 BTG3-206ENST00000496601 378 ntTSL 36.6□□□□□ -1.351e-11■■■■■ 42.3
UTP3Q9NQZ2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.056e-7■■■■■ 42.3
UTP3Q9NQZ2 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.196e-7■■■■■ 42.3
UTP3Q9NQZ2 SERP1-203ENST00000479209 3934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.286e-7■■■■■ 42.3
UTP3Q9NQZ2 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.032e-7■■■■■ 42.3
UTP3Q9NQZ2 SYCP2L-202ENST00000341041 3069 ntTSL 213.01□□□□□ -0.332e-7■■■■■ 42.3
UTP3Q9NQZ2 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.191e-6■■■■■ 42.3
UTP3Q9NQZ2 LTBP4-212ENST00000595118 2446 ntTSL 218.94■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 42.3
UTP3Q9NQZ2 LTBP4-204ENST00000318809 1700 ntTSL 218.89■□□□□ 0.611e-6■■■■■ 42.3
UTP3Q9NQZ2 TAF15-201ENST00000603067 580 ntTSL 58.94□□□□□ -0.983e-6■■■■■ 42.3
UTP3Q9NQZ2 SLC2A1-202ENST00000415851 578 ntTSL 220.06■□□□□ 0.81e-6■■■■■ 42.3
UTP3Q9NQZ2 SLC2A1-206ENST00000625233 1031 ntTSL 218.97■□□□□ 0.631e-6■■■■■ 42.3
UTP3Q9NQZ2 SLC2A1-201ENST00000372500 533 ntTSL 316.62■□□□□ 0.251e-6■■■■■ 42.3
UTP3Q9NQZ2 SLC2A1-209ENST00000630821 591 ntTSL 215.05■□□□□ -01e-6■■■■■ 42.3
UTP3Q9NQZ2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.462e-6■■■■■ 42.3
UTP3Q9NQZ2 EMD-205ENST00000471965 800 ntTSL 224.16■■□□□ 1.461e-7■■■■■ 42.2
UTP3Q9NQZ2 NCOA4-207ENST00000585132 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.769e-14■■■■■ 42.2
UTP3Q9NQZ2 NCOA4-204ENST00000581486 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.999e-14■■■■■ 42.2
UTP3Q9NQZ2 MACF1-211ENST00000467673 792 ntTSL 322.92■■□□□ 1.264e-6■■■■■ 42.2
UTP3Q9NQZ2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.473e-6■■■■■ 42.2
UTP3Q9NQZ2 NSD2-223ENST00000513726 648 ntTSL 311.93□□□□□ -0.57e-7■■■■■ 42.2
UTP3Q9NQZ2 NSD2-211ENST00000502425 421 ntTSL 36.91□□□□□ -1.37e-7■■■■■ 42.2
UTP3Q9NQZ2 RNF10-224ENST00000546262 776 ntTSL 417.57■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 42.1
UTP3Q9NQZ2 RNF10-208ENST00000537376 328 ntTSL 317.23■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 42.1
UTP3Q9NQZ2 RNF10-209ENST00000537740 412 ntTSL 211.61□□□□□ -0.552e-6■■■■■ 42.1
UTP3Q9NQZ2 DROSHA-215ENST00000512076 1124 ntTSL 1 (best)9.16□□□□□ -0.945e-6■■■■■ 42.1
UTP3Q9NQZ2 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.121e-6■■■■■ 42.1
UTP3Q9NQZ2 CMBL-207ENST00000514202 593 ntTSL 213.55□□□□□ -0.241e-6■■■■■ 42.1
UTP3Q9NQZ2 CMBL-204ENST00000506821 901 ntTSL 212.87□□□□□ -0.351e-6■■■■■ 42.1
UTP3Q9NQZ2 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.372e-6■■■■■ 42.1
UTP3Q9NQZ2 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 42.1
UTP3Q9NQZ2 PCM1-212ENST00000519253 6443 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.932e-6■■■■■ 42.1
UTP3Q9NQZ2 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.922e-6■■■■■ 42.1
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 4825.9 ms