RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592514.5

MRPL4-211, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene MRPL4, Length 1,118 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL4-211ENST00000592514 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.79■■■■■ 6.68
MRPL4-211ENST00000592514 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.81■■■■■ 5.72
MRPL4-211ENST00000592514 ABCC9O60706 1549 aa50.53■■■■■ 5.68
MRPL4-211ENST00000592514 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.23■■■■■ 5.31
MRPL4-211ENST00000592514 NACADO15069 1562 aa47.96■■■■■ 5.27
MRPL4-211ENST00000592514 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.86■■■■■ 5.25
MRPL4-211ENST00000592514 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.38■■■■■ 5.18
MRPL4-211ENST00000592514 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.14■■■■■ 5.14
MRPL4-211ENST00000592514 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.1■■■■■ 5.13
MRPL4-211ENST00000592514 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.1■■■■■ 5.13
MRPL4-211ENST00000592514 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.04■■■■■ 5.12
MRPL4-211ENST00000592514 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.91■■■■■ 5.1
MRPL4-211ENST00000592514 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.77■■■■■ 5.08
MRPL4-211ENST00000592514 SCRIBQ14160 1630 aa46.37■■■■■ 5.01
MRPL4-211ENST00000592514 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.19■■■■■ 4.99
MRPL4-211ENST00000592514 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.64■■■■■ 4.9
MRPL4-211ENST00000592514 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.63■■■■■ 4.9
MRPL4-211ENST00000592514 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.47■■■■■ 4.87
MRPL4-211ENST00000592514 NCAPD3P42695 1498 aa44.26■■■■■ 4.68
MRPL4-211ENST00000592514 SMARCA4P51532 1647 aa44.24■■■■■ 4.67
MRPL4-211ENST00000592514 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.19■■■■■ 4.66
MRPL4-211ENST00000592514 SMARCA2P51531 1590 aa44.09■■■■■ 4.65
MRPL4-211ENST00000592514 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.08■■■■■ 4.65
MRPL4-211ENST00000592514 HMGXB3Q12766 1538 aa43.98■■■■■ 4.63
MRPL4-211ENST00000592514 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.81■■■■■ 4.6
MRPL4-211ENST00000592514 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.78■■■■■ 4.6
MRPL4-211ENST00000592514 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.77■■■■■ 4.6
MRPL4-211ENST00000592514 ERCC6Q03468 1493 aa43.63■■■■■ 4.57
MRPL4-211ENST00000592514 NESP48681 1621 aa43.48■■■■■ 4.55
MRPL4-211ENST00000592514 CUX2O14529 1486 aa43.39■■■■■ 4.54
MRPL4-211ENST00000592514 WIZO95785 1651 aa43.27■■■■■ 4.52
MRPL4-211ENST00000592514 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.24■■■■■ 4.51
MRPL4-211ENST00000592514 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.98■■■■■ 4.47
MRPL4-211ENST00000592514 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.98■■■■■ 4.47
MRPL4-211ENST00000592514 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.97■■■■■ 4.47
MRPL4-211ENST00000592514 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.96■■■■■ 4.47
MRPL4-211ENST00000592514 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.95■■■■■ 4.47
MRPL4-211ENST00000592514 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.94■■■■■ 4.46
MRPL4-211ENST00000592514 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.75■■■■■ 4.43
MRPL4-211ENST00000592514 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.6■■■■■ 4.41
MRPL4-211ENST00000592514 CFTRP13569 1480 aa42.52■■■■■ 4.4
MRPL4-211ENST00000592514 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.51■■■■■ 4.4
MRPL4-211ENST00000592514 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.49■■■■■ 4.39
MRPL4-211ENST00000592514 WDR62O43379 1518 aa42.47■■■■■ 4.39
MRPL4-211ENST00000592514 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.25■■■■■ 4.35
MRPL4-211ENST00000592514 PRDM2Q13029 1718 aa42.13■■■■■ 4.33
MRPL4-211ENST00000592514 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.1■■■■■ 4.33
MRPL4-211ENST00000592514 TOPBP1Q92547 1522 aa41.7■■■■■ 4.27
MRPL4-211ENST00000592514 ABCC8Q09428 1581 aa41.63■■■■■ 4.26
MRPL4-211ENST00000592514 IFT140Q96RY7 1462 aa41.63■■■■■ 4.25
MRPL4-211ENST00000592514 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.59■■■■■ 4.25
MRPL4-211ENST00000592514 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.53■■■■■ 4.24
MRPL4-211ENST00000592514 OSCARQ8IYS5 282 aa41.47■■■■■ 4.23
MRPL4-211ENST00000592514 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.39■■■■■ 4.22
MRPL4-211ENST00000592514 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
MRPL4-211ENST00000592514 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.3■■■■■ 4.2
MRPL4-211ENST00000592514 TRIM41Q8WV44 630 aa41.3■■■■■ 4.2
MRPL4-211ENST00000592514 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.29■■■■■ 4.2
MRPL4-211ENST00000592514 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.2■■■■■ 4.198e-9■■■■■ 43.4
MRPL4-211ENST00000592514 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.15■■■■■ 4.18
MRPL4-211ENST00000592514 SOGA1O94964 1423 aa41.12■■■■■ 4.17
MRPL4-211ENST00000592514 CUX1P39880 1505 aa41.11■■■■■ 4.17
MRPL4-211ENST00000592514 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.1■■■■■ 4.17
MRPL4-211ENST00000592514 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41■■■■■ 4.15
MRPL4-211ENST00000592514 CHD1O14646 1710 aa40.96■■■■■ 4.15
MRPL4-211ENST00000592514 WDR97A6NE52 1622 aa40.91■■■■■ 4.14
MRPL4-211ENST00000592514 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.9■■■■■ 4.14
MRPL4-211ENST00000592514 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.9■■■■■ 4.14
MRPL4-211ENST00000592514 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.9■■■■■ 4.14
MRPL4-211ENST00000592514 FBLN2P98095 1184 aa40.9■■■■■ 4.14
MRPL4-211ENST00000592514 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.81■■■■■ 4.12
MRPL4-211ENST00000592514 ARHGEF11O15085 1522 aa40.81■■■■■ 4.12
MRPL4-211ENST00000592514 GRIN2BQ13224 1484 aa40.74■■■■■ 4.11
MRPL4-211ENST00000592514 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.7■■■■■ 4.11
MRPL4-211ENST00000592514 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.64■■■■■ 4.1
MRPL4-211ENST00000592514 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.64■■■■■ 4.1
MRPL4-211ENST00000592514 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.64■■■■■ 4.1
MRPL4-211ENST00000592514 PBRM1Q86U86 1689 aa40.6■■■■■ 4.09
MRPL4-211ENST00000592514 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.57■■■■■ 4.08
MRPL4-211ENST00000592514 SYNJ2O15056 1496 aa40.56■■■■■ 4.08
MRPL4-211ENST00000592514 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.55■■■■■ 4.08
MRPL4-211ENST00000592514 TOP2BQ02880 1626 aa40.54■■■■■ 4.08
MRPL4-211ENST00000592514 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.54■■■■■ 4.08
MRPL4-211ENST00000592514 SYNJ1O43426 1573 aa40.52■■■■■ 4.08
MRPL4-211ENST00000592514 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.49■■■■■ 4.07
MRPL4-211ENST00000592514 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.48■■■■■ 4.07
MRPL4-211ENST00000592514 ARAP1Q96P48 1450 aa40.43■■■■■ 4.06
MRPL4-211ENST00000592514 ADAMTS12P58397 1594 aa40.24■■■■■ 4.03
MRPL4-211ENST00000592514 GRIN2AQ12879 1464 aa40.2■■■■■ 4.03
MRPL4-211ENST00000592514 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.14■■■■■ 4.02
MRPL4-211ENST00000592514 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.14■■■■■ 4.02
MRPL4-211ENST00000592514 NUP160Q12769 1436 aa40.05■■■■■ 4
MRPL4-211ENST00000592514 CEP170Q5SW79 1584 aa40.05■■■■■ 4
MRPL4-211ENST00000592514 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.97■■■■□ 3.99
MRPL4-211ENST00000592514 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.88■■■■□ 3.97
MRPL4-211ENST00000592514 SHROOM2Q13796 1616 aa39.83■■■■□ 3.97
MRPL4-211ENST00000592514 KIF27Q86VH2 1401 aa39.78■■■■□ 3.96
MRPL4-211ENST00000592514 IGF1RP08069 1367 aa39.69■■■■□ 3.94
MRPL4-211ENST00000592514 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.66■■■■□ 3.94
MRPL4-211ENST00000592514 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.65■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 154 ms