Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 PPP6R3-206ENST00000524904 4292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.013e-6■■■■■ 47.4
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.94e-6■■■■■ 47.3
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.724e-6■■■■■ 47.3
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.684e-6■■■■■ 47.3
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-204ENST00000391973 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.294e-6■■■■■ 47.3
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-201ENST00000360051 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.384e-6■■■■■ 47.3
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-206ENST00000402092 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.614e-6■■■■■ 47.3
UTP3Q9NQZ2 SRP72-205ENST00000510663 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.085e-9■■■■■ 47.3
UTP3Q9NQZ2 SRP72-201ENST00000342756 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.455e-9■■■■■ 47.3
UTP3Q9NQZ2 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 47.3
UTP3Q9NQZ2 UBE3A-222ENST00000630907 889 ntTSL 527.92■■■□□ 2.066e-8■■■■■ 47.3
UTP3Q9NQZ2 UBE3A-219ENST00000629886 436 ntTSL 34.73□□□□□ -1.656e-8■■■■■ 47.3
UTP3Q9NQZ2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.051e-6■■■■■ 47.3
UTP3Q9NQZ2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.851e-6■■■■■ 47.3
UTP3Q9NQZ2 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.031e-6■■■■■ 47.3
UTP3Q9NQZ2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.088e-7■■■■■ 47.3
UTP3Q9NQZ2 ALKBH6-217ENST00000497999 725 ntTSL 522.31■■□□□ 1.163e-6■■■■■ 47.3
UTP3Q9NQZ2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.963e-6■■■■■ 47.3
UTP3Q9NQZ2 GIPR-203ENST00000585889 1414 ntTSL 1 (best)20.65■□□□□ 0.93e-6■■■■■ 47.3
UTP3Q9NQZ2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.673e-6■■■■■ 47.3
UTP3Q9NQZ2 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 47.3
UTP3Q9NQZ2 ZMYM2-205ENST00000382883 5445 ntTSL 54.43□□□□□ -1.73e-6■■■■■ 47.3
UTP3Q9NQZ2 ZMYM2-201ENST00000382870 3456 ntTSL 1 (best)2.74□□□□□ -1.973e-6■■■■■ 47.3
UTP3Q9NQZ2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.586e-7■■■■■ 47.3
UTP3Q9NQZ2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.326e-7■■■■■ 47.3
UTP3Q9NQZ2 RNPEP-210ENST00000481780 847 ntTSL 511.57□□□□□ -0.566e-7■■■■■ 47.3
UTP3Q9NQZ2 RNPEP-211ENST00000487116 851 ntTSL 310.1□□□□□ -0.796e-7■■■■■ 47.3
UTP3Q9NQZ2 ITSN2-205ENST00000412011 2066 ntTSL 1 (best)22.31■■□□□ 1.166e-7■■■■■ 47.3
UTP3Q9NQZ2 ITSN2-204ENST00000407704 597 ntTSL 421.32■■□□□ 16e-7■■■■■ 47.3
UTP3Q9NQZ2 ITSN2-208ENST00000443927 902 ntTSL 320.64■□□□□ 0.896e-7■■■■■ 47.3
UTP3Q9NQZ2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.866e-7■■■■■ 47.3
UTP3Q9NQZ2 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.356e-7■■■■■ 47.3
UTP3Q9NQZ2 ITSN2-202ENST00000361999 5814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.656e-7■■■■■ 47.3
UTP3Q9NQZ2 COPG1-203ENST00000504547 586 ntTSL 27.86□□□□□ -1.151e-6■■■■■ 47.3
UTP3Q9NQZ2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.521e-6■■■■■ 47.3
UTP3Q9NQZ2 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 47.3
UTP3Q9NQZ2 ARF1-207ENST00000477451 789 ntTSL 518.43■□□□□ 0.541e-6■■■■■ 47.2
UTP3Q9NQZ2 RHOT2-221ENST00000569358 1273 ntTSL 521.09■□□□□ 0.971e-6■■■■■ 47.1
UTP3Q9NQZ2 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.363e-6■■■■■ 47.1
UTP3Q9NQZ2 FLOT1-202ENST00000413165 856 ntTSL 521.3■■□□□ 14e-8■■■■■ 47.1
UTP3Q9NQZ2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.733e-7■■■■■ 47.1
UTP3Q9NQZ2 RAVER1-204ENST00000592208 4693 ntTSL 1 (best)17.13■□□□□ 0.333e-7■■■■■ 47.1
UTP3Q9NQZ2 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.013e-7■■■■■ 47.1
UTP3Q9NQZ2 RAVER1-201ENST00000293677 3595 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.213e-7■■■■■ 47.1
UTP3Q9NQZ2 RAVER1-208ENST00000617231 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.413e-7■■■■■ 47.1
UTP3Q9NQZ2 NAP1L1-222ENST00000551992 1074 ntTSL 525.88■■□□□ 1.731e-36■■■■■ 47.1
UTP3Q9NQZ2 NAP1L1-214ENST00000548273 818 ntTSL 313.69□□□□□ -0.221e-36■■■■■ 47.1
UTP3Q9NQZ2 NAP1L1-209ENST00000547704 760 ntTSL 510.34□□□□□ -0.751e-36■■■■■ 47.1
UTP3Q9NQZ2 NAP1L1-221ENST00000551600 786 ntTSL 510.34□□□□□ -0.751e-36■■■■■ 47.1
UTP3Q9NQZ2 NAP1L1-218ENST00000550934 851 ntTSL 58.5□□□□□ -1.051e-36■■■■■ 47.1
UTP3Q9NQZ2 EIF4G1-214ENST00000427141 730 ntTSL 512.74□□□□□ -0.373e-7■■■■■ 47.1
UTP3Q9NQZ2 EIF4G1-220ENST00000440448 578 ntTSL 411.89□□□□□ -0.513e-7■■■■■ 47.1
UTP3Q9NQZ2 EIF4G1-223ENST00000444134 558 ntTSL 511.78□□□□□ -0.523e-7■■■■■ 47.1
UTP3Q9NQZ2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.672e-6■■■■■ 47.1
UTP3Q9NQZ2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.172e-6■■■■■ 47.1
UTP3Q9NQZ2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.132e-6■■■■■ 47.1
UTP3Q9NQZ2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.112e-6■■■■■ 47.1
UTP3Q9NQZ2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.092e-6■■■■■ 47.1
UTP3Q9NQZ2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.832e-6■■■■■ 47.1
UTP3Q9NQZ2 RTFDC1-207ENST00000477573 2193 ntTSL 1 (best)14.67□□□□□ -0.064e-6■■■■■ 47
UTP3Q9NQZ2 FAM209A-202ENST00000481560 666 ntTSL 58.27□□□□□ -1.094e-6■■■■■ 47
UTP3Q9NQZ2 ACIN1-208ENST00000553721 610 ntTSL 39.8□□□□□ -0.842e-6■■■■■ 47
UTP3Q9NQZ2 STK11-206ENST00000586358 770 ntTSL 516.01■□□□□ 0.153e-7■■■■■ 47
UTP3Q9NQZ2 STK11-204ENST00000585851 505 ntTSL 314.21□□□□□ -0.133e-7■■■■■ 47
UTP3Q9NQZ2 LBR-201ENST00000272163 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.992e-7■■■■■ 47
UTP3Q9NQZ2 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.712e-7■■■■■ 47
UTP3Q9NQZ2 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.229e-7■■■■■ 47
UTP3Q9NQZ2 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.19e-7■■■■■ 47
UTP3Q9NQZ2 MSH5-206ENST00000423982 2706 ntTSL 515.45■□□□□ 0.069e-7■■■■■ 47
UTP3Q9NQZ2 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 09e-7■■■■■ 47
UTP3Q9NQZ2 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.239e-7■■■■■ 47
UTP3Q9NQZ2 MSH5-211ENST00000463144 2296 ntTSL 511.02□□□□□ -0.649e-7■■■■■ 47
UTP3Q9NQZ2 PPP2R5C-212ENST00000554442 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.652e-6■■■■■ 47
UTP3Q9NQZ2 PPP2R5C-215ENST00000556068 3363 ntTSL 27.43□□□□□ -1.222e-6■■■■■ 47
UTP3Q9NQZ2 WDR45B-204ENST00000571835 869 ntTSL 59.32□□□□□ -0.921e-6■■■■■ 47
UTP3Q9NQZ2 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.417e-9■■■■■ 47
UTP3Q9NQZ2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.514e-7■■■■■ 46.9
UTP3Q9NQZ2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.644e-7■■■■■ 46.9
UTP3Q9NQZ2 UFD1-205ENST00000459854 5038 ntTSL 1 (best)11.27□□□□□ -0.614e-7■■■■■ 46.9
UTP3Q9NQZ2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.514e-6■■■■■ 46.9
UTP3Q9NQZ2 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.24e-6■■■■■ 46.9
UTP3Q9NQZ2 TRIM11-206ENST00000602582 682 ntTSL 316.23■□□□□ 0.194e-6■■■■■ 46.9
UTP3Q9NQZ2 RNF10-219ENST00000543675 583 ntTSL 317.57■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 46.9
UTP3Q9NQZ2 RNF10-216ENST00000542438 562 ntTSL 414.5□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 46.9
UTP3Q9NQZ2 RNF10-215ENST00000542207 548 ntTSL 49.84□□□□□ -0.832e-6■■■■■ 46.9
UTP3Q9NQZ2 EIF3I-201ENST00000355082 564 ntTSL 315.76■□□□□ 0.113e-10■■■■■ 46.9
UTP3Q9NQZ2 EIF3I-203ENST00000471486 825 ntTSL 211.62□□□□□ -0.553e-10■■■■■ 46.9
UTP3Q9NQZ2 EIF3I-206ENST00000489353 527 ntTSL 311.3□□□□□ -0.63e-10■■■■■ 46.9
UTP3Q9NQZ2 UBE3A-213ENST00000626793 733 ntTSL 523.77■■□□□ 1.47e-8■■■■■ 46.9
UTP3Q9NQZ2 UBE3A-216ENST00000628733 706 ntTSL 55.81□□□□□ -1.487e-8■■■■■ 46.9
UTP3Q9NQZ2 LTBP4-211ENST00000594537 657 ntTSL 524.71■■□□□ 1.559e-7■■■■■ 46.9
UTP3Q9NQZ2 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.179e-7■■■■■ 46.9
UTP3Q9NQZ2 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.039e-7■■■■■ 46.9
UTP3Q9NQZ2 PHTF2-203ENST00000307305 4793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.379e-7■■■■■ 46.9
UTP3Q9NQZ2 PHTF2-205ENST00000416283 5198 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.649e-7■■■■■ 46.9
UTP3Q9NQZ2 CEP85-203ENST00000453146 2821 ntTSL 1 (best)10.52□□□□□ -0.739e-7■■■■■ 46.9
UTP3Q9NQZ2 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.269e-7■■■■■ 46.9
UTP3Q9NQZ2 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.379e-7■■■■■ 46.9
UTP3Q9NQZ2 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.749e-7■■■■■ 46.9
UTP3Q9NQZ2 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.889e-7■■■■■ 46.9
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 370.3 ms