Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 MTRR-205ENST00000503550 556 ntTSL 58.14□□□□□ -1.117e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MRPS36-203ENST00000507022 298 ntTSL 38.14□□□□□ -1.117e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 FGFR1OP-202ENST00000366847 14166 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.117e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MTRF1-209ENST00000497679 863 ntTSL 38.05□□□□□ -1.127e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 CPSF7-224ENST00000544990 646 ntTSL 38.03□□□□□ -1.127e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 CPSF7-216ENST00000536548 598 ntTSL 48.01□□□□□ -1.137e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 CPSF7-203ENST00000413184 571 ntTSL 47.92□□□□□ -1.147e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 ZNF587B-201ENST00000442832 3339 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.177e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 DNA2-202ENST00000399179 3207 ntTSL 27.68□□□□□ -1.187e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.187e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 PRKAA1-201ENST00000296800 1134 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.187e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 SF3B3-209ENST00000567635 630 ntTSL 57.57□□□□□ -1.27e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 R3HDM1-210ENST00000443537 710 ntTSL 37.54□□□□□ -1.27e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.217e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 ACTR6-204ENST00000548180 1747 ntTSL 27.46□□□□□ -1.227e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 CPSF7-215ENST00000536145 546 ntTSL 47.25□□□□□ -1.257e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.267e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MTRF1-201ENST00000239852 1561 ntTSL 1 (best)7.14□□□□□ -1.277e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MTRR-225ENST00000514369 779 ntTSL 56.91□□□□□ -1.37e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 FUBP1-210ENST00000488814 612 ntTSL 36.82□□□□□ -1.327e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 CPSF7-219ENST00000539952 953 ntTSL 56.58□□□□□ -1.367e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 CPSF7-222ENST00000544585 722 ntTSL 26.58□□□□□ -1.367e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.377e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.397e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MTRR-218ENST00000510525 3091 ntTSL 56.14□□□□□ -1.437e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 PPP1R8-205ENST00000486634 459 ntTSL 36.13□□□□□ -1.437e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 ACTR6-205ENST00000549977 549 ntTSL 26.13□□□□□ -1.437e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 KIF15-206ENST00000481166 2240 ntTSL 55.94□□□□□ -1.467e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 ANAPC7-210ENST00000548234 1293 ntTSL 25.88□□□□□ -1.477e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 RBM5-204ENST00000417905 427 ntTSL 55.82□□□□□ -1.487e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.497e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.497e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MTRR-219ENST00000511461 3076 ntTSL 55.69□□□□□ -1.57e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MTRR-214ENST00000508890 346 ntTSL 25.67□□□□□ -1.57e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 SF3B3-214ENST00000572365 575 ntTSL 45.62□□□□□ -1.517e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 ACTR6-208ENST00000551517 568 ntTSL 35.57□□□□□ -1.527e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 ATP13A3-202ENST00000429136 3729 ntTSL 1 (best)5.53□□□□□ -1.527e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.537e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.557e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.557e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.567e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 CAPN7-202ENST00000415565 742 ntTSL 55.14□□□□□ -1.597e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 PRKAA1-207ENST00000509874 692 ntTSL 45.05□□□□□ -1.67e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 ACTR6-211ENST00000552064 780 ntTSL 34.76□□□□□ -1.657e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 DDX46-203ENST00000503946 4078 ntTSL 24.74□□□□□ -1.657e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 LUC7L3-221ENST00000513025 594 ntTSL 34.64□□□□□ -1.677e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 G2E3-203ENST00000544007 1003 ntTSL 24.57□□□□□ -1.681e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.691e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.77e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MTRF1-205ENST00000452359 820 ntTSL 34.12□□□□□ -1.757e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 LUC7L3-211ENST00000507503 561 ntTSL 23.68□□□□□ -1.827e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MED23-206ENST00000479213 3173 ntTSL 23.35□□□□□ -1.877e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.97e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 IST1-209ENST00000536027 823 ntTSL 33.16□□□□□ -1.97e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 HLTF-209ENST00000497427 570 ntTSL 53.05□□□□□ -1.927e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 TAX1BP1-212ENST00000494033 770 ntTSL 32.98□□□□□ -1.937e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.957e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 LUC7L3-210ENST00000507200 510 ntTSL 42.84□□□□□ -1.967e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 HOOK3-203ENST00000526882 598 ntTSL 32.79□□□□□ -1.967e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 GFPT1-203ENST00000493759 524 ntTSL 52.77□□□□□ -1.977e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.047e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 HLTF-204ENST00000467858 1276 ntTSL 52.31□□□□□ -2.047e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 HOOK3-206ENST00000533539 485 ntTSL 32.31□□□□□ -2.047e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 SNRNP27-205ENST00000488986 336 ntTSL 32.25□□□□□ -2.057e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 PIAS1-204ENST00000563996 1168 ntTSL 52.17□□□□□ -2.067e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 MARCH7-206ENST00000461582 292 ntTSL 32.12□□□□□ -2.077e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.097e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 CCDC186-204ENST00000428953 1576 ntTSL 21.98□□□□□ -2.097e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 ATF6-202ENST00000476437 778 ntTSL 51.87□□□□□ -2.117e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.227e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.222e-8■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 RIT1-203ENST00000461050 803 ntTSL 514.48□□□□□ -0.092e-8■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 RIT1-202ENST00000368323 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.652e-8■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 RIT1-201ENST00000368322 855 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.942e-8■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 RIT1-206ENST00000609492 574 ntTSL 1 (best)8.11□□□□□ -1.112e-8■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 TNRC6A-209ENST00000562829 277 ntTSL 218.49■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 RPL17-201ENST00000578528 481 ntTSL 325.12■■□□□ 1.612e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 RPL17-206ENST00000579495 914 ntTSL 221.6■■□□□ 1.052e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 RPL17-211ENST00000581305 593 ntTSL 510.52□□□□□ -0.732e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 RPL17-215ENST00000582782 562 ntTSL 33.96□□□□□ -1.772e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 RPL17-203ENST00000578966 563 ntTSL 1 (best)2.58□□□□□ -22e-6■■■■■ 28.7
SF3B1O75533 FDPS-208ENST00000470171 746 ntTSL 216.92■□□□□ 0.35e-7■■■■■ 28.6
SF3B1O75533 FDPS-213ENST00000489003 976 ntTSL 216.39■□□□□ 0.215e-7■■■■■ 28.6
SF3B1O75533 FDPS-216ENST00000491013 912 ntTSL 516.03■□□□□ 0.165e-7■■■■■ 28.6
SF3B1O75533 FDPS-219ENST00000495308 808 ntTSL 214.73□□□□□ -0.055e-7■■■■■ 28.6
SF3B1O75533 FDPS-204ENST00000461507 1022 ntTSL 213.9□□□□□ -0.185e-7■■■■■ 28.6
SF3B1O75533 FDPS-211ENST00000477057 741 ntTSL 213.78□□□□□ -0.25e-7■■■■■ 28.6
SF3B1O75533 FDPS-209ENST00000471117 630 ntTSL 38.78□□□□□ -15e-7■■■■■ 28.6
SF3B1O75533 CHD9-216ENST00000565803 3625 ntTSL 52.94□□□□□ -1.942e-6■■■■■ 28.6
SF3B1O75533 GGA2-207ENST00000566651 332 ntTSL 38.39□□□□□ -1.075e-6■■■■■ 28.6
SF3B1O75533 PICALM-210ENST00000528411 586 ntTSL 516.41■□□□□ 0.223e-6■■■■■ 28.6
SF3B1O75533 SRRM2-218ENST00000574331 1759 ntTSL 218.39■□□□□ 0.537e-9■■■■■ 28.6
SF3B1O75533 XPO1-220ENST00000481214 720 ntTSL 21.79□□□□□ -2.122e-6■■■■■ 28.6
SF3B1O75533 CSDE1-215ENST00000533818 552 ntTSL 411.86□□□□□ -0.511e-6■■■■■ 28.6
SF3B1O75533 CSDE1-217ENST00000534699 2667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.581e-6■■■■■ 28.6
SF3B1O75533 CSDE1-214ENST00000530886 3459 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.051e-6■■■■■ 28.6
SF3B1O75533 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21e-6■■■■■ 28.6
SF3B1O75533 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.211e-6■■■■■ 28.6
SF3B1O75533 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.271e-6■■■■■ 28.6
SF3B1O75533 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.341e-6■■■■■ 28.6
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