Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 ITM2A-202ENST00000434584 1698 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.173e-11■■■■■ 28.7
RPS3P23396 LYZ-202ENST00000548839 558 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.283e-55■■■■■ 28.7
RPS3P23396 TMEM132A-210ENST00000540112 2013 ntTSL 221■□□□□ 0.954e-10■■■■■ 28.6
RPS3P23396 TMEM132A-204ENST00000535480 692 ntTSL 314.79□□□□□ -0.044e-10■■■■■ 28.6
RPS3P23396 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.62□□□□□ -0.074e-10■■■■■ 28.6
RPS3P23396 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 28.6
RPS3P23396 CEMIP-205ENST00000559966 488 ntTSL 213.81□□□□□ -0.24e-10■■■■■ 28.6
RPS3P23396 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.234e-10■■■■■ 28.6
RPS3P23396 CHST15-202ENST00000435907 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.524e-10■■■■■ 28.6
RPS3P23396 CPN1-202ENST00000441382 669 ntTSL 210.81□□□□□ -0.682e-6■■■■■ 28.6
RPS3P23396 CHST15-203ENST00000462406 826 ntTSL 26.98□□□□□ -1.294e-10■■■■■ 28.6
RPS3P23396 SERPINE2-209ENST00000478966 680 ntTSL 26.45□□□□□ -1.384e-10■■■■■ 28.6
RPS3P23396 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.144e-10■■■■■ 28.6
RPS3P23396 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.194e-10■■■■■ 28.6
RPS3P23396 PSMB7-203ENST00000466951 462 ntTSL 316.7■□□□□ 0.263e-7■■■■■ 28.6
RPS3P23396 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.053e-9■■■■■ 28.6
RPS3P23396 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.043e-9■■■■■ 28.6
RPS3P23396 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.073e-9■■■■■ 28.6
RPS3P23396 CKB-203ENST00000553610 542 ntTSL 316.98■□□□□ 0.312e-8■■■■■ 28.6
RPS3P23396 CKB-210ENST00000554989 625 ntTSL 215.48■□□□□ 0.072e-8■■■■■ 28.6
RPS3P23396 ATP5A1-218ENST00000592364 576 ntTSL 510.6□□□□□ -0.719e-8■■■■■ 28.6
RPS3P23396 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.225e-10■■■■■ 28.6
RPS3P23396 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.281e-6■■■■■ 28.6
RPS3P23396 PFAS-205ENST00000580356 4242 ntTSL 212.34□□□□□ -0.431e-6■■■■■ 28.6
RPS3P23396 COX4I1-205ENST00000563774 566 ntTSL 419.94■□□□□ 0.783e-9■■■■■ 28.6
RPS3P23396 COX4I1-214ENST00000567266 546 ntTSL 419.5■□□□□ 0.713e-9■■■■■ 28.6
RPS3P23396 COX4I1-213ENST00000567241 561 ntTSL 418.06■□□□□ 0.483e-9■■■■■ 28.6
RPS3P23396 COX4I1-210ENST00000566115 471 ntTSL 315.14■□□□□ 0.013e-9■■■■■ 28.6
RPS3P23396 COX4I1-218ENST00000570123 551 ntTSL 512.9□□□□□ -0.343e-9■■■■■ 28.6
RPS3P23396 MYL4-204ENST00000570671 740 ntTSL 29.77□□□□□ -0.853e-7■■■■■ 28.6
RPS3P23396 MYL6-217ENST00000550639 419 ntTSL 59.31□□□□□ -0.922e-8■■■■■ 28.6
RPS3P23396 MRPL49-204ENST00000526319 1906 ntTSL 217.78■□□□□ 0.448e-7■■■■■ 28.6
RPS3P23396 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.298e-7■■■■■ 28.6
RPS3P23396 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.18e-7■■■■■ 28.6
RPS3P23396 MRPL49-208ENST00000533943 688 ntTSL 315.65■□□□□ 0.18e-7■■■■■ 28.6
RPS3P23396 MRPL49-205ENST00000528529 752 ntTSL 315.01□□□□□ -0.018e-7■■■■■ 28.6
RPS3P23396 MRPL49-202ENST00000524482 2065 ntTSL 213.48□□□□□ -0.258e-7■■■■■ 28.6
RPS3P23396 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.458e-7■■■■■ 28.6
RPS3P23396 EFTUD2-206ENST00000586654 585 ntTSL 29.6□□□□□ -0.872e-8■■■■■ 28.6
RPS3P23396 EFTUD2-204ENST00000585794 578 ntTSL 28.35□□□□□ -1.072e-8■■■■■ 28.6
RPS3P23396 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.175e-8■■■■■ 28.5
RPS3P23396 GJB1-202ENST00000374022 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.385e-8■■■■■ 28.5
RPS3P23396 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 28.5
RPS3P23396 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 28.5
RPS3P23396 RBM10-203ENST00000377604 3747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.622e-6■■■■■ 28.5
RPS3P23396 SELENOF-206ENST00000497861 266 ntTSL 31.01□□□□□ -2.253e-7■■■■■ 28.5
RPS3P23396 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.464e-9■■■■■ 28.5
RPS3P23396 BAMBI-202ENST00000497699 1884 ntTSL 220.52■□□□□ 0.874e-9■■■■■ 28.5
RPS3P23396 PLBD2-204ENST00000548997 465 ntTSL 313.75□□□□□ -0.211e-9■■■■■ 28.5
RPS3P23396 G3BP2-219ENST00000515457 560 ntTSL 414.05□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 28.5
RPS3P23396 G3BP2-216ENST00000511146 577 ntTSL 37.92□□□□□ -1.142e-6■■■■■ 28.5
RPS3P23396 G3BP2-213ENST00000509100 514 ntTSL 53.49□□□□□ -1.852e-6■■■■■ 28.5
RPS3P23396 IDH1-201ENST00000345146 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.621e-7■■■■■ 28.5
RPS3P23396 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.164e-7■■■■■ 28.5
RPS3P23396 LDHB-205ENST00000470280 710 ntTSL 210.2□□□□□ -0.787e-7■■■■■ 28.5
RPS3P23396 PSMD13-208ENST00000528906 858 ntTSL 512.96□□□□□ -0.332e-9■■■■■ 28.4
RPS3P23396 GYPA-207ENST00000510771 709 ntTSL 3-0.93□□□□□ -2.564e-7■■■■■ 28.4
RPS3P23396 LGALS3BP-214ENST00000589527 818 ntTSL 314.06□□□□□ -0.162e-25■■■■■ 28.4
RPS3P23396 UROD-220ENST00000496439 800 ntTSL 210.97□□□□□ -0.656e-10■■■■■ 28.4
RPS3P23396 SPON2-211ENST00000507466 525 ntTSL 222.12■■□□□ 1.133e-7■■■■■ 28.4
RPS3P23396 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.65■□□□□ 0.743e-8■■■■■ 28.4
RPS3P23396 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.09■□□□□ 0.493e-8■■■■■ 28.4
RPS3P23396 PHGDH-232ENST00000641947 1774 nt17.43■□□□□ 0.383e-8■■■■■ 28.4
RPS3P23396 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.343e-8■■■■■ 28.4
RPS3P23396 PHGDH-211ENST00000641213 2053 nt16.87■□□□□ 0.293e-8■■■■■ 28.4
RPS3P23396 PHGDH-229ENST00000641891 2175 nt16.74■□□□□ 0.273e-8■■■■■ 28.4
RPS3P23396 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.263e-8■■■■■ 28.4
RPS3P23396 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.223e-8■■■■■ 28.4
RPS3P23396 PHGDH-216ENST00000641375 2196 nt16.33■□□□□ 0.23e-8■■■■■ 28.4
RPS3P23396 PHGDH-233ENST00000642021 2794 nt13.49□□□□□ -0.253e-8■■■■■ 28.4
RPS3P23396 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.913e-7■■■■■ 28.4
RPS3P23396 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.013e-7■■■■■ 28.4
RPS3P23396 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.033e-7■■■■■ 28.4
RPS3P23396 SURF4-205ENST00000467910 693 ntTSL 512.65□□□□□ -0.386e-10■■■■■ 28.4
RPS3P23396 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.112e-7■■■■■ 28.4
RPS3P23396 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 03e-6■■■■■ 28.4
RPS3P23396 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.073e-6■■■■■ 28.4
RPS3P23396 CCAR2-206ENST00000520861 3560 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.523e-6■■■■■ 28.4
RPS3P23396 MT2A-205ENST00000567300 416 ntTSL 212.41□□□□□ -0.422e-11■■■■■ 28.4
RPS3P23396 ILF2-203ENST00000368684 476 ntTSL 56.44□□□□□ -1.388e-8■■■■■ 28.4
RPS3P23396 CRIM1-203ENST00000426856 667 ntTSL 314.48□□□□□ -0.093e-7■■■■■ 28.4
RPS3P23396 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.22e-6■■■■■ 28.4
RPS3P23396 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 28.4
RPS3P23396 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 28.4
RPS3P23396 HACD3-210ENST00000568793 1824 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 28.4
RPS3P23396 HACD3-201ENST00000261875 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 28.4
RPS3P23396 MYL6-208ENST00000547703 675 ntTSL 511.98□□□□□ -0.491e-8■■■■■ 28.3
RPS3P23396 MYL6-212ENST00000548725 582 ntTSL 211.57□□□□□ -0.561e-8■■■■■ 28.3
RPS3P23396 MYL6-214ENST00000549392 411 ntTSL 59.23□□□□□ -0.931e-8■■■■■ 28.3
RPS3P23396 MYL6-221ENST00000552297 454 ntTSL 35.92□□□□□ -1.461e-8■■■■■ 28.3
RPS3P23396 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.323e-8■■■■■ 28.3
RPS3P23396 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.173e-8■■■■■ 28.3
RPS3P23396 SDHD-201ENST00000375549 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.473e-8■■■■■ 28.3
RPS3P23396 SDHD-212ENST00000531744 566 ntTSL 212.02□□□□□ -0.493e-8■■■■■ 28.3
RPS3P23396 SDHD-211ENST00000525987 968 ntTSL 412.02□□□□□ -0.493e-8■■■■■ 28.3
RPS3P23396 SDHD-213ENST00000532699 571 ntTSL 312.02□□□□□ -0.493e-8■■■■■ 28.3
RPS3P23396 SDHD-204ENST00000528021 1071 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.523e-8■■■■■ 28.3
RPS3P23396 SDHD-205ENST00000528048 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.523e-8■■■■■ 28.3
RPS3P23396 SDHD-203ENST00000526592 861 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.023e-8■■■■■ 28.3
RPS3P23396 SDHD-207ENST00000530923 717 ntTSL 57.05□□□□□ -1.283e-8■■■■■ 28.3
Retrieved 100 of 24,271 protein–RNA pairs in 175.6 ms