Protein–RNA interactions for Protein: P49588

AARS, Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AARSP49588 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.73e-6■■■■□ 25.5
AARSP49588 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.023e-6■■■■□ 25.4
AARSP49588 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.91e-6■■■■□ 25.3
AARSP49588 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.641e-6■■■■□ 25.3
AARSP49588 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.063e-6■■■■□ 25.3
AARSP49588 CTBP2-207ENST00000467395 410 ntTSL 326.69■■□□□ 1.865e-6■■■■□ 25.2
AARSP49588 PPIL2-208ENST00000484439 863 ntTSL 58.21□□□□□ -1.12e-6■■■■□ 25.1
AARSP49588 PPIL2-206ENST00000458567 557 ntTSL 44.38□□□□□ -1.712e-6■■■■□ 25.1
AARSP49588 CTBP2-213ENST00000530930 425 ntTSL 512.32□□□□□ -0.444e-6■■■■□ 25.1
AARSP49588 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.487e-7■■■■□ 25.1
AARSP49588 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.527e-7■■■■□ 25.1
AARSP49588 TMEM242-202ENST00000400788 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.817e-7■■■■□ 25
AARSP49588 MICALL2-208ENST00000472100 5248 ntTSL 219.05■□□□□ 0.641e-6■■■■□ 25
AARSP49588 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.551e-6■■■■□ 25
AARSP49588 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.214e-6■■■■□ 24.9
AARSP49588 SMYD3-207ENST00000462422 971 ntTSL 514.01□□□□□ -0.174e-6■■■■□ 24.9
AARSP49588 SMYD3-203ENST00000391836 732 ntTSL 512.38□□□□□ -0.434e-6■■■■□ 24.9
AARSP49588 SMYD3-216ENST00000492487 634 ntTSL 38.87□□□□□ -0.994e-6■■■■□ 24.9
AARSP49588 SMYD3-218ENST00000630181 1458 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.074e-6■■■■□ 24.9
AARSP49588 SMYD3-205ENST00000453676 562 ntTSL 44.58□□□□□ -1.684e-6■■■■□ 24.9
AARSP49588 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.035e-7■■■■□ 24.8
AARSP49588 RANBP1-210ENST00000435265 1879 ntTSL 220.81■□□□□ 0.925e-7■■■■□ 24.8
AARSP49588 RANBP1-207ENST00000423859 832 ntTSL 319.95■□□□□ 0.785e-7■■■■□ 24.8
AARSP49588 RANBP1-205ENST00000418705 932 ntTSL 317.98■□□□□ 0.475e-7■■■■□ 24.8
AARSP49588 RANBP1-203ENST00000411892 584 ntTSL 216.09■□□□□ 0.175e-7■■■■□ 24.8
AARSP49588 RANBP1-211ENST00000448394 688 ntTSL 215.67■□□□□ 0.15e-7■■■■□ 24.8
AARSP49588 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.095e-7■■■■□ 24.8
AARSP49588 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.035e-7■■■■□ 24.8
AARSP49588 HSPG2-203ENST00000374695 14327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.973e-6■■■■□ 24.8
AARSP49588 TMEM14B-203ENST00000460341 565 ntTSL 417.31■□□□□ 0.369e-10■■■■□ 24.7
AARSP49588 TMEM14B-206ENST00000463448 1589 ntTSL 1 (best)16.2■□□□□ 0.189e-10■■■■□ 24.7
AARSP49588 TMEM14B-209ENST00000473166 752 ntTSL 315.94■□□□□ 0.149e-10■■■■□ 24.7
AARSP49588 TMEM14B-213ENST00000478732 344 ntTSL 513.42□□□□□ -0.269e-10■■■■□ 24.7
AARSP49588 TMEM14B-211ENST00000473807 559 ntTSL 413.4□□□□□ -0.269e-10■■■■□ 24.7
AARSP49588 TMEM14B-205ENST00000463100 502 ntTSL 411.54□□□□□ -0.569e-10■■■■□ 24.7
AARSP49588 TMEM14B-207ENST00000467229 483 ntTSL 36.92□□□□□ -1.39e-10■■■■□ 24.7
AARSP49588 TMEM14B-217ENST00000489137 374 ntTSL 34.74□□□□□ -1.659e-10■■■■□ 24.7
AARSP49588 CXXC5-209ENST00000507139 472 ntTSL 423.6■■□□□ 1.375e-6■■■■□ 24.7
AARSP49588 CXXC5-206ENST00000504844 777 ntTSL 222.89■■□□□ 1.255e-6■■■■□ 24.7
AARSP49588 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.165e-6■■■■□ 24.7
AARSP49588 CXXC5-203ENST00000502336 581 ntTSL 421.37■■□□□ 1.015e-6■■■■□ 24.7
AARSP49588 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.665e-6■■■■□ 24.7
AARSP49588 CXXC5-214ENST00000512816 558 ntTSL 318■□□□□ 0.475e-6■■■■□ 24.7
AARSP49588 CXXC5-202ENST00000502295 503 ntTSL 417.77■□□□□ 0.445e-6■■■■□ 24.7
AARSP49588 CXXC5-216ENST00000520967 878 ntTSL 317.17■□□□□ 0.345e-6■■■■□ 24.7
AARSP49588 CXXC5-207ENST00000504944 568 ntTSL 315.36■□□□□ 0.055e-6■■■■□ 24.7
AARSP49588 CA8-201ENST00000317995 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.572e-6■■■■□ 24.7
AARSP49588 GGA2-215ENST00000569189 586 ntTSL 526.38■■□□□ 1.815e-7■■■■□ 24.5
AARSP49588 GGA2-203ENST00000562944 388 ntTSL 525.39■■□□□ 1.665e-7■■■■□ 24.5
AARSP49588 GGA2-206ENST00000566547 603 ntTSL 224.21■■□□□ 1.475e-7■■■■□ 24.5
AARSP49588 GGA2-204ENST00000563047 366 ntTSL 523.06■■□□□ 1.285e-7■■■■□ 24.5
AARSP49588 GGA2-205ENST00000563494 553 ntTSL 522.93■■□□□ 1.265e-7■■■■□ 24.5
AARSP49588 GGA2-212ENST00000568799 1403 ntTSL 522.86■■□□□ 1.255e-7■■■■□ 24.5
AARSP49588 GGA2-202ENST00000562117 387 ntTSL 514.11□□□□□ -0.155e-7■■■■□ 24.5
AARSP49588 GGA2-217ENST00000570111 563 ntTSL 58.85□□□□□ -0.995e-7■■■■□ 24.5
AARSP49588 GGA2-216ENST00000569300 572 ntTSL 46.21□□□□□ -1.425e-7■■■■□ 24.5
AARSP49588 EEF2-201ENST00000309311 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.41e-10■■■■□ 24.4
AARSP49588 GSE1-204ENST00000411612 872 ntTSL 523.68■■□□□ 1.381e-6■■■■□ 24.4
AARSP49588 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.241e-6■■■■□ 24.3
AARSP49588 GGA2-201ENST00000309859 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.511e-6■■■■□ 24.3
AARSP49588 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.262e-6■■■■□ 24.2
AARSP49588 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.32e-6■■■■□ 24.2
AARSP49588 ATP11A-212ENST00000487903 8858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.62e-6■■■■□ 24.2
AARSP49588 ATP11A-209ENST00000466946 431 ntTSL 57.91□□□□□ -1.142e-6■■■■□ 24.2
AARSP49588 PNN-201ENST00000216832 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.081e-6■■■■□ 24.1
AARSP49588 PNN-206ENST00000557680 912 ntTSL 34.97□□□□□ -1.611e-6■■■■□ 24.1
AARSP49588 ARIH1-206ENST00000564062 612 ntTSL 334.26■■■■□ 3.084e-6■■■■□ 24
AARSP49588 ARIH1-210ENST00000570085 807 ntTSL 332.06■■■□□ 2.724e-6■■■■□ 24
AARSP49588 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.714e-6■■■■□ 24
AARSP49588 ESRRA-206ENST00000539594 747 ntTSL 330.37■■■□□ 2.454e-6■■■■□ 24
AARSP49588 ESRRA-204ENST00000467987 610 ntTSL 329.62■■■□□ 2.334e-6■■■■□ 24
AARSP49588 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.34e-6■■■■□ 24
AARSP49588 PRELID2-209ENST00000515475 582 ntTSL 429.2■■■□□ 2.264e-6■■■■□ 24
AARSP49588 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.194e-6■■■■□ 24
AARSP49588 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.144e-6■■■■□ 24
AARSP49588 TAOK3-216ENST00000542532 641 ntTSL 228.4■■■□□ 2.144e-6■■■■□ 24
AARSP49588 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.114e-6■■■■□ 24
AARSP49588 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.034e-6■■■■□ 24
AARSP49588 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 24e-6■■■■□ 24
AARSP49588 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.934e-6■■■■□ 24
AARSP49588 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.874e-6■■■■□ 24
AARSP49588 TAOK3-217ENST00000542692 588 ntTSL 326.12■■□□□ 1.774e-6■■■■□ 24
AARSP49588 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.774e-6■■■■□ 24
AARSP49588 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.649e-7■■■■□ 24
AARSP49588 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.554e-6■■■■□ 24
AARSP49588 SKP1-206ENST00000519321 692 ntTSL 324.4■■□□□ 1.54e-6■■■■□ 24
AARSP49588 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.454e-6■■■■□ 24
AARSP49588 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.429e-7■■■■□ 24
AARSP49588 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.314e-6■■■■□ 24
AARSP49588 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.34e-6■■■■□ 24
AARSP49588 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.264e-6■■■■□ 24
AARSP49588 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.254e-6■■■■□ 24
AARSP49588 SH2D3A-204ENST00000595681 1750 ntTSL 522.51■■□□□ 1.199e-7■■■■□ 24
AARSP49588 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.194e-6■■■■□ 24
AARSP49588 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.134e-6■■■■□ 24
AARSP49588 XPO4-204ENST00000490513 914 ntTSL 422.03■■□□□ 1.124e-6■■■■□ 24
AARSP49588 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.094e-6■■■■□ 24
AARSP49588 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.084e-6■■■■□ 24
AARSP49588 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.074e-6■■■■□ 24
AARSP49588 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.054e-6■■■■□ 24
Retrieved 100 of 8,200 protein–RNA pairs in 102.6 ms