RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367067.8

CD55-205, Transcript of CD55 molecule (Cromer blood group), human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CD55, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CD55-205	ENST00000367067	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		48.84	■■■■■ 5.41
CD55-205	ENST00000367067	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		42.87	■■■■■ 4.45
CD55-205	ENST00000367067	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	40.94	■■■■■ 4.14
CD55-205	ENST00000367067	ABCC9	O60706	1549 aa		40.92	■■■■■ 4.14
CD55-205	ENST00000367067	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		40.42	■■■■■ 4.06
CD55-205	ENST00000367067	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		40.4	■■■■■ 4.06
CD55-205	ENST00000367067	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		40.11	■■■■■ 4.01
CD55-205	ENST00000367067	NACAD	O15069	1562 aa		39.98	■■■■□ 3.99
CD55-205	ENST00000367067	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		39.75	■■■■□ 3.95
CD55-205	ENST00000367067	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		39.46	■■■■□ 3.91
CD55-205	ENST00000367067	SCRIB	Q14160	1630 aa		39.29	■■■■□ 3.88
CD55-205	ENST00000367067	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		38.98	■■■■□ 3.83
CD55-205	ENST00000367067	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		38.59	■■■■□ 3.77
CD55-205	ENST00000367067	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	38.47	■■■■□ 3.75
CD55-205	ENST00000367067	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		37.94	■■■■□ 3.66
CD55-205	ENST00000367067	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	37.77	■■■■□ 3.64
CD55-205	ENST00000367067	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	37.76	■■■■□ 3.64
CD55-205	ENST00000367067	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		37.69	■■■■□ 3.62
CD55-205	ENST00000367067	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	37.69	■■■■□ 3.62
CD55-205	ENST00000367067	SMARCA4	P51532	1647 aa		37.66	■■■■□ 3.62
CD55-205	ENST00000367067	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	37.45	■■■■□ 3.58
CD55-205	ENST00000367067	WIZ	O95785	1651 aa		37.39	■■■■□ 3.58
CD55-205	ENST00000367067	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		37.23	■■■■□ 3.55
CD55-205	ENST00000367067	SMARCA2	P51531	1590 aa		37.12	■■■■□ 3.53
CD55-205	ENST00000367067	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		37.11	■■■■□ 3.53
CD55-205	ENST00000367067	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		37.03	■■■■□ 3.52
CD55-205	ENST00000367067	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	37	■■■■□ 3.51
CD55-205	ENST00000367067	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	36.89	■■■■□ 3.5
CD55-205	ENST00000367067	NCAPD3	P42695	1498 aa		36.87	■■■■□ 3.49
CD55-205	ENST00000367067	HMGXB3	Q12766	1538 aa		36.82	■■■■□ 3.49
CD55-205	ENST00000367067	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		36.7	■■■■□ 3.47
CD55-205	ENST00000367067	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		36.58	■■■■□ 3.45
CD55-205	ENST00000367067	CFTR	P13569	1480 aa		35.94	■■■■□ 3.34
CD55-205	ENST00000367067	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		35.93	■■■■□ 3.34
CD55-205	ENST00000367067	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		35.89	■■■■□ 3.34
CD55-205	ENST00000367067	PRDM2	Q13029	1718 aa		35.84	■■■■□ 3.33
CD55-205	ENST00000367067	NES	P48681	1621 aa		35.77	■■■■□ 3.32
CD55-205	ENST00000367067	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		35.73	■■■■□ 3.31
CD55-205	ENST00000367067	ABCC8	Q09428	1581 aa		35.68	■■■■□ 3.3
CD55-205	ENST00000367067	TRIM41	Q8WV44	630 aa		35.56	■■■■□ 3.28
CD55-205	ENST00000367067	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	35.51	■■■■□ 3.28
CD55-205	ENST00000367067	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		35.5	■■■■□ 3.27
CD55-205	ENST00000367067	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		35.44	■■■■□ 3.26
CD55-205	ENST00000367067	SYNJ1	O43426	1573 aa		35.39	■■■■□ 3.26
CD55-205	ENST00000367067	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		35.33	■■■■□ 3.25
CD55-205	ENST00000367067	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		35.33	■■■■□ 3.25
CD55-205	ENST00000367067	TOP2B	Q02880	1626 aa		35.31	■■■■□ 3.24
CD55-205	ENST00000367067	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		35.29	■■■■□ 3.24
CD55-205	ENST00000367067	CUX1	P39880	1505 aa		35.28	■■■■□ 3.24
CD55-205	ENST00000367067	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		35.13	■■■■□ 3.21
CD55-205	ENST00000367067	ERCC6	Q03468	1493 aa		35.1	■■■■□ 3.21
CD55-205	ENST00000367067	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	35.09	■■■■□ 3.21
CD55-205	ENST00000367067	TOPBP1	Q92547	1522 aa		35.07	■■■■□ 3.2
CD55-205	ENST00000367067	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		35.01	■■■■□ 3.2
CD55-205	ENST00000367067	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		34.97	■■■■□ 3.19
CD55-205	ENST00000367067	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	34.92	■■■■□ 3.18
CD55-205	ENST00000367067	SOGA1	O94964	1423 aa		34.89	■■■■□ 3.18
CD55-205	ENST00000367067	WDR62	O43379	1518 aa		34.88	■■■■□ 3.17
CD55-205	ENST00000367067	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	34.86	■■■■□ 3.17
CD55-205	ENST00000367067	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	34.86	■■■■□ 3.17
CD55-205	ENST00000367067	EEA1	Q15075	1411 aa		34.8	■■■■□ 3.16
CD55-205	ENST00000367067	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		34.78	■■■■□ 3.16
CD55-205	ENST00000367067	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		34.72	■■■■□ 3.15
CD55-205	ENST00000367067	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		34.66	■■■■□ 3.14
CD55-205	ENST00000367067	KIF27	Q86VH2	1401 aa		34.66	■■■■□ 3.14
CD55-205	ENST00000367067	CUX2	O14529	1486 aa		34.65	■■■■□ 3.14
CD55-205	ENST00000367067	WDR97	A6NE52	1622 aa		34.63	■■■■□ 3.13
CD55-205	ENST00000367067	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	34.61	■■■■□ 3.13
CD55-205	ENST00000367067	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		34.6	■■■■□ 3.13
CD55-205	ENST00000367067	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		34.51	■■■■□ 3.12
CD55-205	ENST00000367067	IFT140	Q96RY7	1462 aa		34.51	■■■■□ 3.11
CD55-205	ENST00000367067	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		34.44	■■■■□ 3.1
CD55-205	ENST00000367067	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	34.42	■■■■□ 3.1
CD55-205	ENST00000367067	KIF21B	O75037	1637 aa		34.38	■■■■□ 3.09
CD55-205	ENST00000367067	IGF1R	P08069	1367 aa		34.37	■■■■□ 3.09
CD55-205	ENST00000367067	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	34.36	■■■■□ 3.09
CD55-205	ENST00000367067	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		34.36	■■■■□ 3.09
CD55-205	ENST00000367067	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		34.35	■■■■□ 3.09
CD55-205	ENST00000367067	PRX	Q9BXM0	1461 aa		34.31	■■■■□ 3.08
CD55-205	ENST00000367067	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	34.28	■■■■□ 3.08	3e-7	■■■■□ 25.8
CD55-205	ENST00000367067	GOLGA3	Q08378	1498 aa		34.28	■■■■□ 3.08
CD55-205	ENST00000367067	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		34.27	■■■■□ 3.08
CD55-205	ENST00000367067	PBRM1	Q86U86	1689 aa		34.25	■■■■□ 3.07
CD55-205	ENST00000367067	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	34.23	■■■■□ 3.07
CD55-205	ENST00000367067	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		34.22	■■■■□ 3.07
CD55-205	ENST00000367067	CUL7	Q14999	1698 aa		34.22	■■■■□ 3.07
CD55-205	ENST00000367067	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		34.19	■■■■□ 3.06
CD55-205	ENST00000367067	GRIN2B	Q13224	1484 aa		34.16	■■■■□ 3.06
CD55-205	ENST00000367067	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	34.12	■■■■□ 3.05
CD55-205	ENST00000367067	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		34.08	■■■■□ 3.05
CD55-205	ENST00000367067	ADAMTS12	P58397	1594 aa		34.01	■■■■□ 3.03
CD55-205	ENST00000367067	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		33.98	■■■■□ 3.03
CD55-205	ENST00000367067	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		33.97	■■■■□ 3.03
CD55-205	ENST00000367067	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	33.94	■■■■□ 3.02
CD55-205	ENST00000367067	CEP162	Q5TB80	1403 aa		33.86	■■■■□ 3.01
CD55-205	ENST00000367067	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		33.8	■■■■□ 3
CD55-205	ENST00000367067	SYNJ2	O15056	1496 aa		33.8	■■■■□ 3
CD55-205	ENST00000367067	GRIN2A	Q12879	1464 aa		33.75	■■■□□ 2.99
CD55-205	ENST00000367067	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	33.71	■■■□□ 2.99
CD55-205	ENST00000367067	CLIP1	P30622	1438 aa		33.7	■■■□□ 2.99

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