RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394450.6

PRELID2-202, Transcript of PRELI domain containing 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRELID2, Length 1,102 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID2-202ENST00000394450 NISCHQ9Y2I1 1504 aa72,84■■■■■ 9,25
PRELID2-202ENST00000394450 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa65,12■■■■■ 8,02
PRELID2-202ENST00000394450 ABCC9O60706 1549 aa64,69■■■■■ 7,95
PRELID2-202ENST00000394450 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa61,82■■■■■ 7,49
PRELID2-202ENST00000394450 NACADO15069 1562 aa61,51■■■■■ 7,44
PRELID2-202ENST00000394450 DCAF8L2P0C7V8 631 aa61,47■■■■■ 7,43
PRELID2-202ENST00000394450 MYO15BQ96JP2 1530 aa60,8■■■■■ 7,32
PRELID2-202ENST00000394450 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP60,45■■■■■ 7,27
PRELID2-202ENST00000394450 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP60,35■■■■■ 7,25
PRELID2-202ENST00000394450 UNC13AQ9UPW8 1703 aa60,25■■■■■ 7,24
PRELID2-202ENST00000394450 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa60,2■■■■■ 7,23
PRELID2-202ENST00000394450 DNAJC5BQ9UF47 199 aa60,16■■■■■ 7,22
PRELID2-202ENST00000394450 BICRAQ9NZM4 1560 aa59,86■■■■■ 7,17
PRELID2-202ENST00000394450 SCRIBQ14160 1630 aa59,4■■■■■ 7,1
PRELID2-202ENST00000394450 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa59,25■■■■■ 7,07
PRELID2-202ENST00000394450 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP58,43■■■■■ 6,94
PRELID2-202ENST00000394450 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa58,42■■■■■ 6,94
PRELID2-202ENST00000394450 CECR2Q9BXF3 1484 aa58,24■■■■■ 6,91
PRELID2-202ENST00000394450 NCAPD3P42695 1498 aa56,77■■■■■ 6,68
PRELID2-202ENST00000394450 SMARCA4P51532 1647 aa56,69■■■■■ 6,67
PRELID2-202ENST00000394450 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa56,65■■■■■ 6,66
PRELID2-202ENST00000394450 SMARCA2P51531 1590 aa56,57■■■■■ 6,65
PRELID2-202ENST00000394450 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP56,55■■■■■ 6,64
PRELID2-202ENST00000394450 HMGXB3Q12766 1538 aa56,37■■■■■ 6,61
PRELID2-202ENST00000394450 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP56,19■■■■■ 6,59
PRELID2-202ENST00000394450 PEG3Q9GZU2 1588 aa56,12■■■■■ 6,57
PRELID2-202ENST00000394450 MROH2BQ7Z745 1585 aa56,1■■■■■ 6,57
PRELID2-202ENST00000394450 ERCC6Q03468 1493 aa55,91■■■■■ 6,54
PRELID2-202ENST00000394450 NESP48681 1621 aa55,66■■■■■ 6,5
PRELID2-202ENST00000394450 CUX2O14529 1486 aa55,57■■■■■ 6,49
PRELID2-202ENST00000394450 WIZO95785 1651 aa55,45■■■■■ 6,47
PRELID2-202ENST00000394450 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa55,42■■■■■ 6,46
PRELID2-202ENST00000394450 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP55,16■■■■■ 6,42
PRELID2-202ENST00000394450 PDS5BQ9NTI5 1447 aa55,16■■■■■ 6,42
PRELID2-202ENST00000394450 CADPSQ9ULU8 1353 aa55,11■■■■■ 6,41
PRELID2-202ENST00000394450 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa54,99■■■■■ 6,39
PRELID2-202ENST00000394450 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP54,96■■■■■ 6,39
PRELID2-202ENST00000394450 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa54,93■■■■■ 6,38
PRELID2-202ENST00000394450 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP54,82■■■■■ 6,37
PRELID2-202ENST00000394450 MRC2Q9UBG0 1479 aa54,59■■■■■ 6,33
PRELID2-202ENST00000394450 CFTRP13569 1480 aa54,54■■■■■ 6,32
PRELID2-202ENST00000394450 CEP164Q9UPV0 1460 aa54,49■■■■■ 6,31
PRELID2-202ENST00000394450 FANCD2Q9BXW9 1451 aa54,47■■■■■ 6,31
PRELID2-202ENST00000394450 WDR62O43379 1518 aa54,39■■■■■ 6,3
PRELID2-202ENST00000394450 CCDC88BA6NC98 1476 aa54,21■■■■■ 6,27
PRELID2-202ENST00000394450 PRDM2Q13029 1718 aa53,96■■■■■ 6,23
PRELID2-202ENST00000394450 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP53,92■■■■■ 6,22
PRELID2-202ENST00000394450 ABCC8Q09428 1581 aa53,48■■■■■ 6,15
PRELID2-202ENST00000394450 TOPBP1Q92547 1522 aa53,46■■■■■ 6,15
PRELID2-202ENST00000394450 IFT140Q96RY7 1462 aa53,39■■■■■ 6,14
PRELID2-202ENST00000394450 DNMBPQ6XZF7 1577 aa53,31■■■■■ 6,12
PRELID2-202ENST00000394450 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP53,24■■■■■ 6,11
PRELID2-202ENST00000394450 OSCARQ8IYS5 282 aa53,22■■■■■ 6,11
PRELID2-202ENST00000394450 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP53,17■■■■■ 6,1
PRELID2-202ENST00000394450 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP52,94■■■■■ 6,06
PRELID2-202ENST00000394450 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP52,9■■■■■ 6,06
PRELID2-202ENST00000394450 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP52,88■■■■■ 6,06
PRELID2-202ENST00000394450 TRIM41Q8WV44 630 aa52,86■■■■■ 6,05
PRELID2-202ENST00000394450 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP52,8■■■■■ 6,04
PRELID2-202ENST00000394450 SOGA1O94964 1423 aa52,78■■■■■ 6,04
PRELID2-202ENST00000394450 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa52,74■■■■■ 6,03
PRELID2-202ENST00000394450 FGD5Q6ZNL6 1462 aa52,69■■■■■ 6,03
PRELID2-202ENST00000394450 CUX1P39880 1505 aa52,68■■■■■ 6,02
PRELID2-202ENST00000394450 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP52,59■■■■■ 6,01
PRELID2-202ENST00000394450 FBLN2P98095 1184 aa52,51■■■■■ 6
PRELID2-202ENST00000394450 WDR97A6NE52 1622 aa52,47■■■■■ 5,99
PRELID2-202ENST00000394450 CHD1O14646 1710 aa52,4■■■■■ 5,98
PRELID2-202ENST00000394450 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa52,31■■■■■ 5,96
PRELID2-202ENST00000394450 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa52,31■■■■■ 5,96
PRELID2-202ENST00000394450 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa52,31■■■■■ 5,96
PRELID2-202ENST00000394450 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa52,29■■■■■ 5,96
PRELID2-202ENST00000394450 GRIN2BQ13224 1484 aa52,25■■■■■ 5,96
PRELID2-202ENST00000394450 ARHGEF11O15085 1522 aa52,23■■■■■ 5,95
PRELID2-202ENST00000394450 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP52,19■■■■■ 5,95
PRELID2-202ENST00000394450 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP52,19■■■■■ 5,95
PRELID2-202ENST00000394450 GAPVD1Q14C86 1478 aa52,13■■■■■ 5,94
PRELID2-202ENST00000394450 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa52,13■■■■■ 5,94
PRELID2-202ENST00000394450 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP52,09■■■■■ 5,93
PRELID2-202ENST00000394450 SYNJ2O15056 1496 aa52,01■■■■■ 5,92
PRELID2-202ENST00000394450 TOP2BQ02880 1626 aa52■■■■■ 5,91
PRELID2-202ENST00000394450 PBRM1Q86U86 1689 aa51,99■■■■■ 5,91
PRELID2-202ENST00000394450 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa51,97■■■■■ 5,91
PRELID2-202ENST00000394450 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa51,94■■■■■ 5,91
PRELID2-202ENST00000394450 SYNJ1O43426 1573 aa51,93■■■■■ 5,9
PRELID2-202ENST00000394450 CYB5RLQ6IPT4 315 aa51,92■■■■■ 5,9
PRELID2-202ENST00000394450 CLASP1Q7Z460 1538 aa51,82■■■■■ 5,89
PRELID2-202ENST00000394450 ARAP1Q96P48 1450 aa51,73■■■■■ 5,87
PRELID2-202ENST00000394450 GRIN2AQ12879 1464 aa51,55■■■■■ 5,84
PRELID2-202ENST00000394450 ADAMTS12P58397 1594 aa51,54■■■■■ 5,84
PRELID2-202ENST00000394450 FHAD1B1AJZ9 1412 aa51,51■■■■■ 5,84
PRELID2-202ENST00000394450 ERICH3Q5RHP9 1530 aa51,5■■■■■ 5,84
PRELID2-202ENST00000394450 NUP160Q12769 1436 aa51,33■■■■■ 5,81
PRELID2-202ENST00000394450 CEP170Q5SW79 1584 aa51,28■■■■■ 5,8
PRELID2-202ENST00000394450 TRHP20396 242 aaPredicted RBP51,26■■■■■ 5,8
PRELID2-202ENST00000394450 KIF27Q86VH2 1401 aa51,12■■■■■ 5,77
PRELID2-202ENST00000394450 ERCC6L2Q5T890 1561 aa51,01■■■■■ 5,76
PRELID2-202ENST00000394450 SHROOM2Q13796 1616 aa51■■■■■ 5,75
PRELID2-202ENST00000394450 IGF1RP08069 1367 aa50,96■■■■■ 5,75
PRELID2-202ENST00000394450 JPH4Q96JJ6 628 aa50,92■■■■■ 5,74
PRELID2-202ENST00000394450 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP50,86■■■■■ 5,73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9,2 ms