RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467987.1

ESRRA-204, Transcript of estrogen related receptor alpha, humanhuman

TSL 3

Gene ESRRA, Length 610 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRA-204ENST00000467987 NISCHQ9Y2I1 1504 aa67.6■■■■■ 8.41
ESRRA-204ENST00000467987 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa60.45■■■■■ 7.27
ESRRA-204ENST00000467987 ABCC9O60706 1549 aa60■■■■■ 7.19
ESRRA-204ENST00000467987 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa57.32■■■■■ 6.77
ESRRA-204ENST00000467987 NACADO15069 1562 aa57.05■■■■■ 6.72
ESRRA-204ENST00000467987 DCAF8L2P0C7V8 631 aa56.91■■■■■ 6.7
ESRRA-204ENST00000467987 MYO15BQ96JP2 1530 aa56.41■■■■■ 6.62
ESRRA-204ENST00000467987 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP56.11■■■■■ 6.57
ESRRA-204ENST00000467987 UNC13AQ9UPW8 1703 aa56.04■■■■■ 6.56
ESRRA-204ENST00000467987 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP55.96■■■■■ 6.55
ESRRA-204ENST00000467987 DNAJC5BQ9UF47 199 aa55.87■■■■■ 6.53
ESRRA-204ENST00000467987 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa55.87■■■■■ 6.53
ESRRA-204ENST00000467987 BICRAQ9NZM4 1560 aa55.61■■■■■ 6.49
ESRRA-204ENST00000467987 SCRIBQ14160 1630 aa55.12■■■■■ 6.41
ESRRA-204ENST00000467987 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.92■■■■■ 6.38
ESRRA-204ENST00000467987 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa54.22■■■■■ 6.27
ESRRA-204ENST00000467987 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP54.22■■■■■ 6.27
ESRRA-204ENST00000467987 CECR2Q9BXF3 1484 aa54■■■■■ 6.23
ESRRA-204ENST00000467987 NCAPD3P42695 1498 aa52.66■■■■■ 6.02
ESRRA-204ENST00000467987 SMARCA4P51532 1647 aa52.62■■■■■ 6.01
ESRRA-204ENST00000467987 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa52.56■■■■■ 6.01
ESRRA-204ENST00000467987 SMARCA2P51531 1590 aa52.45■■■■■ 5.99
ESRRA-204ENST00000467987 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP52.45■■■■■ 5.99
ESRRA-204ENST00000467987 HMGXB3Q12766 1538 aa52.3■■■■■ 5.96
ESRRA-204ENST00000467987 PEG3Q9GZU2 1588 aa52.11■■■■■ 5.93
ESRRA-204ENST00000467987 MROH2BQ7Z745 1585 aa52.09■■■■■ 5.93
ESRRA-204ENST00000467987 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP52.09■■■■■ 5.93
ESRRA-204ENST00000467987 ERCC6Q03468 1493 aa51.78■■■■■ 5.88
ESRRA-204ENST00000467987 NESP48681 1621 aa51.67■■■■■ 5.86
ESRRA-204ENST00000467987 CUX2O14529 1486 aa51.51■■■■■ 5.84
ESRRA-204ENST00000467987 WIZO95785 1651 aa51.5■■■■■ 5.84
ESRRA-204ENST00000467987 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa51.4■■■■■ 5.82
ESRRA-204ENST00000467987 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP51.19■■■■■ 5.78
ESRRA-204ENST00000467987 PDS5BQ9NTI5 1447 aa51.1■■■■■ 5.77
ESRRA-204ENST00000467987 CADPSQ9ULU8 1353 aa51.09■■■■■ 5.77
ESRRA-204ENST00000467987 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP51.04■■■■■ 5.76
ESRRA-204ENST00000467987 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa51.04■■■■■ 5.76
ESRRA-204ENST00000467987 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa50.97■■■■■ 5.75
ESRRA-204ENST00000467987 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP50.87■■■■■ 5.73
ESRRA-204ENST00000467987 MRC2Q9UBG0 1479 aa50.61■■■■■ 5.69
ESRRA-204ENST00000467987 CFTRP13569 1480 aa50.59■■■■■ 5.69
ESRRA-204ENST00000467987 CEP164Q9UPV0 1460 aa50.51■■■■■ 5.68
ESRRA-204ENST00000467987 FANCD2Q9BXW9 1451 aa50.5■■■■■ 5.67
ESRRA-204ENST00000467987 WDR62O43379 1518 aa50.46■■■■■ 5.67
ESRRA-204ENST00000467987 CCDC88BA6NC98 1476 aa50.31■■■■■ 5.64
ESRRA-204ENST00000467987 PRDM2Q13029 1718 aa50.15■■■■■ 5.62
ESRRA-204ENST00000467987 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP50.05■■■■■ 5.6
ESRRA-204ENST00000467987 TOPBP1Q92547 1522 aa49.6■■■■■ 5.53
ESRRA-204ENST00000467987 ABCC8Q09428 1581 aa49.55■■■■■ 5.52
ESRRA-204ENST00000467987 IFT140Q96RY7 1462 aa49.49■■■■■ 5.51
ESRRA-204ENST00000467987 DNMBPQ6XZF7 1577 aa49.45■■■■■ 5.51
ESRRA-204ENST00000467987 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP49.35■■■■■ 5.49
ESRRA-204ENST00000467987 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.32■■■■■ 5.49
ESRRA-204ENST00000467987 OSCARQ8IYS5 282 aa49.29■■■■■ 5.48
ESRRA-204ENST00000467987 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP49.12■■■■■ 5.45
ESRRA-204ENST00000467987 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP49.12■■■■■ 5.45
ESRRA-204ENST00000467987 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP49.1■■■■■ 5.45
ESRRA-204ENST00000467987 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP48.99■■■■■ 5.437e-7■■■■□ 24.7
ESRRA-204ENST00000467987 TRIM41Q8WV44 630 aa48.94■■■■■ 5.43
ESRRA-204ENST00000467987 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.93■■■■■ 5.42
ESRRA-204ENST00000467987 SOGA1O94964 1423 aa48.93■■■■■ 5.42
ESRRA-204ENST00000467987 CUX1P39880 1505 aa48.91■■■■■ 5.42
ESRRA-204ENST00000467987 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.88■■■■■ 5.42
ESRRA-204ENST00000467987 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP48.77■■■■■ 5.4
ESRRA-204ENST00000467987 CHD1O14646 1710 aa48.67■■■■■ 5.38
ESRRA-204ENST00000467987 WDR97A6NE52 1622 aa48.66■■■■■ 5.38
ESRRA-204ENST00000467987 FBLN2P98095 1184 aa48.6■■■■■ 5.37
ESRRA-204ENST00000467987 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa48.55■■■■■ 5.36
ESRRA-204ENST00000467987 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa48.55■■■■■ 5.36
ESRRA-204ENST00000467987 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa48.55■■■■■ 5.36
ESRRA-204ENST00000467987 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa48.48■■■■■ 5.35
ESRRA-204ENST00000467987 ARHGEF11O15085 1522 aa48.44■■■■■ 5.35
ESRRA-204ENST00000467987 GRIN2BQ13224 1484 aa48.43■■■■■ 5.34
ESRRA-204ENST00000467987 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP48.38■■■■■ 5.34
ESRRA-204ENST00000467987 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa48.36■■■■■ 5.33
ESRRA-204ENST00000467987 GAPVD1Q14C86 1478 aa48.33■■■■■ 5.33
ESRRA-204ENST00000467987 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP48.32■■■■■ 5.33
ESRRA-204ENST00000467987 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.29■■■■■ 5.32
ESRRA-204ENST00000467987 PBRM1Q86U86 1689 aa48.28■■■■■ 5.32
ESRRA-204ENST00000467987 TOP2BQ02880 1626 aa48.26■■■■■ 5.32
ESRRA-204ENST00000467987 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa48.26■■■■■ 5.32
ESRRA-204ENST00000467987 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa48.23■■■■■ 5.31
ESRRA-204ENST00000467987 SYNJ2O15056 1496 aa48.22■■■■■ 5.31
ESRRA-204ENST00000467987 SYNJ1O43426 1573 aa48.22■■■■■ 5.31
ESRRA-204ENST00000467987 CYB5RLQ6IPT4 315 aa48.1■■■■■ 5.29
ESRRA-204ENST00000467987 CLASP1Q7Z460 1538 aa48.1■■■■■ 5.29
ESRRA-204ENST00000467987 ARAP1Q96P48 1450 aa47.99■■■■■ 5.27
ESRRA-204ENST00000467987 ADAMTS12P58397 1594 aa47.83■■■■■ 5.25
ESRRA-204ENST00000467987 GRIN2AQ12879 1464 aa47.8■■■■■ 5.24
ESRRA-204ENST00000467987 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.76■■■■■ 5.24
ESRRA-204ENST00000467987 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.74■■■■■ 5.23
ESRRA-204ENST00000467987 NUP160Q12769 1436 aa47.63■■■■■ 5.21
ESRRA-204ENST00000467987 CEP170Q5SW79 1584 aa47.61■■■■■ 5.21
ESRRA-204ENST00000467987 TRHP20396 242 aaPredicted RBP47.42■■■■■ 5.18
ESRRA-204ENST00000467987 ERCC6L2Q5T890 1561 aa47.39■■■■■ 5.18
ESRRA-204ENST00000467987 SHROOM2Q13796 1616 aa47.36■■■■■ 5.17
ESRRA-204ENST00000467987 KIF27Q86VH2 1401 aa47.35■■■■■ 5.17
ESRRA-204ENST00000467987 IGF1RP08069 1367 aa47.28■■■■■ 5.16
ESRRA-204ENST00000467987 JPH4Q96JJ6 628 aa47.19■■■■■ 5.14
ESRRA-204ENST00000467987 CUL7Q14999 1698 aa47.16■■■■■ 5.14
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