RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570085.5

ARIH1-210, Transcript of ariadne RBR E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 3

Gene ARIH1, Length 807 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARIH1-210ENST00000570085 NISCHQ9Y2I1 1504 aa71.9■■■■■ 9.1
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ARIH1-210ENST00000570085 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa60.03■■■■■ 7.2
ARIH1-210ENST00000570085 NACADO15069 1562 aa60.02■■■■■ 7.2
ARIH1-210ENST00000570085 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP59.93■■■■■ 7.18
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ARIH1-210ENST00000570085 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa59.56■■■■■ 7.13
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ARIH1-210ENST00000570085 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa56.39■■■■■ 6.62
ARIH1-210ENST00000570085 CECR2Q9BXF3 1484 aa55.97■■■■■ 6.55
ARIH1-210ENST00000570085 SMARCA4P51532 1647 aa55.76■■■■■ 6.52
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ARIH1-210ENST00000570085 NCAPD3P42695 1498 aa55.39■■■■■ 6.46
ARIH1-210ENST00000570085 SMARCA2P51531 1590 aa55.36■■■■■ 6.45
ARIH1-210ENST00000570085 PEG3Q9GZU2 1588 aa55.27■■■■■ 6.44
ARIH1-210ENST00000570085 HMGXB3Q12766 1538 aa55.13■■■■■ 6.42
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ARIH1-210ENST00000570085 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa53.9■■■■■ 6.22
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ARIH1-210ENST00000570085 ERCC6Q03468 1493 aa53.62■■■■■ 6.17
ARIH1-210ENST00000570085 CCDC88BA6NC98 1476 aa53.59■■■■■ 6.17
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ARIH1-210ENST00000570085 PDS5BQ9NTI5 1447 aa53.48■■■■■ 6.15
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ARIH1-210ENST00000570085 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa53.36■■■■■ 6.13
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ARIH1-210ENST00000570085 FANCD2Q9BXW9 1451 aa53.1■■■■■ 6.09
ARIH1-210ENST00000570085 CEP164Q9UPV0 1460 aa53.01■■■■■ 6.08
ARIH1-210ENST00000570085 MRC2Q9UBG0 1479 aa52.93■■■■■ 6.06
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ARIH1-210ENST00000570085 IFT140Q96RY7 1462 aa51.92■■■■■ 5.9
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ARIH1-210ENST00000570085 FGD5Q6ZNL6 1462 aa51.73■■■■■ 5.87
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ARIH1-210ENST00000570085 TOP2BQ02880 1626 aa51.57■■■■■ 5.85
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ARIH1-210ENST00000570085 WDR97A6NE52 1622 aa51.38■■■■■ 5.82
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ARIH1-210ENST00000570085 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa51.08■■■■■ 5.77
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ARIH1-210ENST00000570085 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa50.9■■■■■ 5.74
ARIH1-210ENST00000570085 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP50.89■■■■■ 5.74
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ARIH1-210ENST00000570085 ERICH3Q5RHP9 1530 aa50.67■■■■■ 5.7
ARIH1-210ENST00000570085 FBLN2P98095 1184 aa50.63■■■■■ 5.7
ARIH1-210ENST00000570085 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP50.57■■■■■ 5.69
ARIH1-210ENST00000570085 ADAMTS12P58397 1594 aa50.55■■■■■ 5.68
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ARIH1-210ENST00000570085 FHAD1B1AJZ9 1412 aa50.46■■■■■ 5.67
ARIH1-210ENST00000570085 TRIM41Q8WV44 630 aa50.45■■■■■ 5.67
ARIH1-210ENST00000570085 IGF1RP08069 1367 aa50.37■■■■■ 5.65
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ARIH1-210ENST00000570085 CLASP1Q7Z460 1538 aa50.3■■■■■ 5.64
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ARIH1-210ENST00000570085 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa50.09■■■■■ 5.61
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ARIH1-210ENST00000570085 ARHGEF11O15085 1522 aa50.08■■■■■ 5.61
ARIH1-210ENST00000570085 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa50.04■■■■■ 5.6
ARIH1-210ENST00000570085 CHIC1Q5VXU3 224 aa50■■■■■ 5.59
ARIH1-210ENST00000570085 SHROOM2Q13796 1616 aa49.81■■■■■ 5.56
ARIH1-210ENST00000570085 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa49.76■■■■■ 5.56
ARIH1-210ENST00000570085 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa49.71■■■■■ 5.55
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