Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC17Q8N6Y2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC17Q8N6Y2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC17Q8N6Y2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC17Q8N6Y2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC17Q8N6Y2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC17Q8N6Y2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC17Q8N6Y2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC17Q8N6Y2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC17Q8N6Y2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC17Q8N6Y2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC17Q8N6Y2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC17Q8N6Y2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC17Q8N6Y2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC17Q8N6Y2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC17Q8N6Y2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC17Q8N6Y2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC17Q8N6Y2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC17Q8N6Y2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC17Q8N6Y2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC17Q8N6Y2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC17Q8N6Y2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC17Q8N6Y2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC17Q8N6Y2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC17Q8N6Y2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC17Q8N6Y2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC17Q8N6Y2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC17Q8N6Y2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC17Q8N6Y2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC17Q8N6Y2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC17Q8N6Y2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC17Q8N6Y2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC17Q8N6Y2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC17Q8N6Y2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC17Q8N6Y2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC17Q8N6Y2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC17Q8N6Y2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC17Q8N6Y2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC17Q8N6Y2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC17Q8N6Y2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC17Q8N6Y2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC17Q8N6Y2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC17Q8N6Y2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC17Q8N6Y2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC17Q8N6Y2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC17Q8N6Y2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC17Q8N6Y2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC17Q8N6Y2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC17Q8N6Y2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC17Q8N6Y2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC17Q8N6Y2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC17Q8N6Y2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC17Q8N6Y2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC17Q8N6Y2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC17Q8N6Y2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC17Q8N6Y2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC17Q8N6Y2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC17Q8N6Y2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC17Q8N6Y2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC17Q8N6Y2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC17Q8N6Y2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC17Q8N6Y2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC17Q8N6Y2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC17Q8N6Y2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC17Q8N6Y2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC17Q8N6Y2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC17Q8N6Y2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC17Q8N6Y2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC17Q8N6Y2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC17Q8N6Y2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRC17Q8N6Y2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC17Q8N6Y2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC17Q8N6Y2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC17Q8N6Y2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC17Q8N6Y2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC17Q8N6Y2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC17Q8N6Y2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC17Q8N6Y2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC17Q8N6Y2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC17Q8N6Y2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC17Q8N6Y2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC17Q8N6Y2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC17Q8N6Y2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC17Q8N6Y2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC17Q8N6Y2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC17Q8N6Y2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC17Q8N6Y2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC17Q8N6Y2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC17Q8N6Y2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC17Q8N6Y2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC17Q8N6Y2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC17Q8N6Y2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC17Q8N6Y2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC17Q8N6Y2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC17Q8N6Y2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC17Q8N6Y2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC17Q8N6Y2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC17Q8N6Y2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC17Q8N6Y2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC17Q8N6Y2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms