RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.17■■■■■ 6.42
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HOXD13-201ENST00000392539 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.33■■■■■ 4.85
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HOXD13-201ENST00000392539 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.31■■■■■ 4.68
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HOXD13-201ENST00000392539 SCRIBQ14160 1630 aa43.9■■■■■ 4.62
HOXD13-201ENST00000392539 NACADO15069 1562 aa43.54■■■■■ 4.56
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HOXD13-201ENST00000392539 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.05■■■■■ 4.48
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HOXD13-201ENST00000392539 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.87■■■■■ 4.45
HOXD13-201ENST00000392539 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.79■■■■■ 4.44
HOXD13-201ENST00000392539 TRIM41Q8WV44 630 aa42.7■■■■■ 4.43
HOXD13-201ENST00000392539 WIZO95785 1651 aa42.6■■■■■ 4.41
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HOXD13-201ENST00000392539 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.2■■■■■ 4.35
HOXD13-201ENST00000392539 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.15■■■■■ 4.34
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HOXD13-201ENST00000392539 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.56■■■■■ 4.24
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HOXD13-201ENST00000392539 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.36■■■■■ 4.21
HOXD13-201ENST00000392539 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.29■■■■■ 4.2
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HOXD13-201ENST00000392539 SOGA1O94964 1423 aa41.09■■■■■ 4.17
HOXD13-201ENST00000392539 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.03■■■■■ 4.16
HOXD13-201ENST00000392539 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.98■■■■■ 4.15
HOXD13-201ENST00000392539 CEP162Q5TB80 1403 aa40.96■■■■■ 4.15
HOXD13-201ENST00000392539 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.92■■■■■ 4.14
HOXD13-201ENST00000392539 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.92■■■■■ 4.14
HOXD13-201ENST00000392539 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.87■■■■■ 4.13
HOXD13-201ENST00000392539 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.83■■■■■ 4.13
HOXD13-201ENST00000392539 GOLGA3Q08378 1498 aa40.78■■■■■ 4.12
HOXD13-201ENST00000392539 SYNJ1O43426 1573 aa40.74■■■■■ 4.11
HOXD13-201ENST00000392539 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.66■■■■■ 4.1
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HOXD13-201ENST00000392539 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.57■■■■■ 4.09
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HOXD13-201ENST00000392539 TOP2BQ02880 1626 aa40.36■■■■■ 4.05
HOXD13-201ENST00000392539 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.31■■■■■ 4.04
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HOXD13-201ENST00000392539 PRXQ9BXM0 1461 aa39.87■■■■□ 3.97
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HOXD13-201ENST00000392539 APLP2Q06481 763 aa39.84■■■■□ 3.97
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HOXD13-201ENST00000392539 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.98■■■■□ 3.83
HOXD13-201ENST00000392539 CCNB3Q8WWL7 1395 aa38.95■■■■□ 3.83
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HOXD13-201ENST00000392539 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.77■■■■□ 3.8
HOXD13-201ENST00000392539 MIER1Q8N108 512 aa38.77■■■■□ 3.8
HOXD13-201ENST00000392539 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa38.76■■■■□ 3.8
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HOXD13-201ENST00000392539 CFAP43Q8NDM7 1665 aa38.73■■■■□ 3.79
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