Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4B5

PRR18, Proline-rich protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR18Q8N4B5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRR18Q8N4B5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRR18Q8N4B5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRR18Q8N4B5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRR18Q8N4B5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRR18Q8N4B5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRR18Q8N4B5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRR18Q8N4B5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRR18Q8N4B5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRR18Q8N4B5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRR18Q8N4B5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRR18Q8N4B5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRR18Q8N4B5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRR18Q8N4B5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRR18Q8N4B5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRR18Q8N4B5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRR18Q8N4B5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRR18Q8N4B5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRR18Q8N4B5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRR18Q8N4B5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRR18Q8N4B5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRR18Q8N4B5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRR18Q8N4B5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRR18Q8N4B5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRR18Q8N4B5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRR18Q8N4B5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRR18Q8N4B5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRR18Q8N4B5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRR18Q8N4B5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRR18Q8N4B5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRR18Q8N4B5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRR18Q8N4B5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRR18Q8N4B5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRR18Q8N4B5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRR18Q8N4B5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRR18Q8N4B5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRR18Q8N4B5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRR18Q8N4B5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRR18Q8N4B5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRR18Q8N4B5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRR18Q8N4B5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRR18Q8N4B5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRR18Q8N4B5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRR18Q8N4B5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRR18Q8N4B5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRR18Q8N4B5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRR18Q8N4B5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRR18Q8N4B5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRR18Q8N4B5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRR18Q8N4B5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRR18Q8N4B5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRR18Q8N4B5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR18Q8N4B5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR18Q8N4B5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR18Q8N4B5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR18Q8N4B5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR18Q8N4B5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR18Q8N4B5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR18Q8N4B5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR18Q8N4B5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR18Q8N4B5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRR18Q8N4B5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR18Q8N4B5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR18Q8N4B5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRR18Q8N4B5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR18Q8N4B5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR18Q8N4B5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR18Q8N4B5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRR18Q8N4B5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR18Q8N4B5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR18Q8N4B5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR18Q8N4B5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR18Q8N4B5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR18Q8N4B5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRR18Q8N4B5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRR18Q8N4B5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRR18Q8N4B5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRR18Q8N4B5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRR18Q8N4B5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRR18Q8N4B5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRR18Q8N4B5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRR18Q8N4B5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRR18Q8N4B5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRR18Q8N4B5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRR18Q8N4B5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRR18Q8N4B5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRR18Q8N4B5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRR18Q8N4B5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRR18Q8N4B5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRR18Q8N4B5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRR18Q8N4B5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRR18Q8N4B5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRR18Q8N4B5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRR18Q8N4B5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRR18Q8N4B5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRR18Q8N4B5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRR18Q8N4B5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRR18Q8N4B5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRR18Q8N4B5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRR18Q8N4B5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms