Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4B5

PRR18, Proline-rich protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR18Q8N4B5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRR18Q8N4B5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRR18Q8N4B5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRR18Q8N4B5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PRR18Q8N4B5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRR18Q8N4B5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRR18Q8N4B5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRR18Q8N4B5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRR18Q8N4B5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRR18Q8N4B5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRR18Q8N4B5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRR18Q8N4B5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRR18Q8N4B5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRR18Q8N4B5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRR18Q8N4B5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRR18Q8N4B5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRR18Q8N4B5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRR18Q8N4B5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRR18Q8N4B5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRR18Q8N4B5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRR18Q8N4B5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRR18Q8N4B5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRR18Q8N4B5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRR18Q8N4B5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRR18Q8N4B5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRR18Q8N4B5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRR18Q8N4B5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRR18Q8N4B5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRR18Q8N4B5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRR18Q8N4B5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRR18Q8N4B5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRR18Q8N4B5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRR18Q8N4B5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRR18Q8N4B5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRR18Q8N4B5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRR18Q8N4B5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRR18Q8N4B5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRR18Q8N4B5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRR18Q8N4B5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRR18Q8N4B5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRR18Q8N4B5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRR18Q8N4B5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRR18Q8N4B5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRR18Q8N4B5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRR18Q8N4B5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRR18Q8N4B5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRR18Q8N4B5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRR18Q8N4B5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRR18Q8N4B5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRR18Q8N4B5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRR18Q8N4B5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRR18Q8N4B5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRR18Q8N4B5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRR18Q8N4B5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRR18Q8N4B5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRR18Q8N4B5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRR18Q8N4B5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRR18Q8N4B5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRR18Q8N4B5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRR18Q8N4B5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRR18Q8N4B5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRR18Q8N4B5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRR18Q8N4B5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRR18Q8N4B5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRR18Q8N4B5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRR18Q8N4B5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRR18Q8N4B5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRR18Q8N4B5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRR18Q8N4B5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRR18Q8N4B5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRR18Q8N4B5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRR18Q8N4B5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRR18Q8N4B5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRR18Q8N4B5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRR18Q8N4B5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRR18Q8N4B5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRR18Q8N4B5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRR18Q8N4B5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRR18Q8N4B5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRR18Q8N4B5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRR18Q8N4B5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRR18Q8N4B5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRR18Q8N4B5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRR18Q8N4B5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRR18Q8N4B5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRR18Q8N4B5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRR18Q8N4B5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRR18Q8N4B5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRR18Q8N4B5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRR18Q8N4B5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRR18Q8N4B5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRR18Q8N4B5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRR18Q8N4B5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PRR18Q8N4B5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PRR18Q8N4B5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRR18Q8N4B5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRR18Q8N4B5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRR18Q8N4B5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRR18Q8N4B5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRR18Q8N4B5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms