Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5D8

NANOGNB, NANOG neighbor homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGNBQ7Z5D8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NANOGNBQ7Z5D8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NANOGNBQ7Z5D8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NANOGNBQ7Z5D8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NANOGNBQ7Z5D8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NANOGNBQ7Z5D8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NANOGNBQ7Z5D8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NANOGNBQ7Z5D8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NANOGNBQ7Z5D8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NANOGNBQ7Z5D8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NANOGNBQ7Z5D8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NANOGNBQ7Z5D8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NANOGNBQ7Z5D8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NANOGNBQ7Z5D8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NANOGNBQ7Z5D8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NANOGNBQ7Z5D8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NANOGNBQ7Z5D8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NANOGNBQ7Z5D8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NANOGNBQ7Z5D8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NANOGNBQ7Z5D8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NANOGNBQ7Z5D8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NANOGNBQ7Z5D8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NANOGNBQ7Z5D8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NANOGNBQ7Z5D8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NANOGNBQ7Z5D8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NANOGNBQ7Z5D8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NANOGNBQ7Z5D8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NANOGNBQ7Z5D8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NANOGNBQ7Z5D8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NANOGNBQ7Z5D8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NANOGNBQ7Z5D8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NANOGNBQ7Z5D8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NANOGNBQ7Z5D8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NANOGNBQ7Z5D8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NANOGNBQ7Z5D8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NANOGNBQ7Z5D8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NANOGNBQ7Z5D8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NANOGNBQ7Z5D8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NANOGNBQ7Z5D8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NANOGNBQ7Z5D8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NANOGNBQ7Z5D8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NANOGNBQ7Z5D8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NANOGNBQ7Z5D8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NANOGNBQ7Z5D8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NANOGNBQ7Z5D8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NANOGNBQ7Z5D8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NANOGNBQ7Z5D8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NANOGNBQ7Z5D8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NANOGNBQ7Z5D8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NANOGNBQ7Z5D8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NANOGNBQ7Z5D8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NANOGNBQ7Z5D8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NANOGNBQ7Z5D8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NANOGNBQ7Z5D8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NANOGNBQ7Z5D8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NANOGNBQ7Z5D8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NANOGNBQ7Z5D8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NANOGNBQ7Z5D8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NANOGNBQ7Z5D8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NANOGNBQ7Z5D8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NANOGNBQ7Z5D8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NANOGNBQ7Z5D8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NANOGNBQ7Z5D8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NANOGNBQ7Z5D8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NANOGNBQ7Z5D8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NANOGNBQ7Z5D8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NANOGNBQ7Z5D8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NANOGNBQ7Z5D8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NANOGNBQ7Z5D8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NANOGNBQ7Z5D8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NANOGNBQ7Z5D8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NANOGNBQ7Z5D8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NANOGNBQ7Z5D8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NANOGNBQ7Z5D8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NANOGNBQ7Z5D8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NANOGNBQ7Z5D8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NANOGNBQ7Z5D8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NANOGNBQ7Z5D8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NANOGNBQ7Z5D8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NANOGNBQ7Z5D8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NANOGNBQ7Z5D8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NANOGNBQ7Z5D8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NANOGNBQ7Z5D8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NANOGNBQ7Z5D8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NANOGNBQ7Z5D8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NANOGNBQ7Z5D8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NANOGNBQ7Z5D8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NANOGNBQ7Z5D8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NANOGNBQ7Z5D8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NANOGNBQ7Z5D8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NANOGNBQ7Z5D8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NANOGNBQ7Z5D8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NANOGNBQ7Z5D8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NANOGNBQ7Z5D8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NANOGNBQ7Z5D8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NANOGNBQ7Z5D8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NANOGNBQ7Z5D8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NANOGNBQ7Z5D8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NANOGNBQ7Z5D8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NANOGNBQ7Z5D8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms