RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320316.7

PHF23-201, Transcript of PHD finger protein 23, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PHF23, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF23-201ENST00000320316 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.28■■■■■ 6.92
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PHF23-201ENST00000320316 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.97■■■■■ 5.27
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PHF23-201ENST00000320316 SMARCA2P51531 1590 aa43.98■■■■■ 4.63
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PHF23-201ENST00000320316 PCGF6Q9BYE7 350 aa43.49■■■■■ 4.55
PHF23-201ENST00000320316 ABCC8Q09428 1581 aa43.48■■■■■ 4.55
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PHF23-201ENST00000320316 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP43.1■■■■■ 4.49
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PHF23-201ENST00000320316 SOGA1O94964 1423 aa42.92■■■■■ 4.46
PHF23-201ENST00000320316 NCAPD3P42695 1498 aa42.92■■■■■ 4.46
PHF23-201ENST00000320316 SYNJ1O43426 1573 aa42.79■■■■■ 4.44
PHF23-201ENST00000320316 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.7■■■■■ 4.43
PHF23-201ENST00000320316 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.68■■■■■ 4.42
PHF23-201ENST00000320316 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.56■■■■■ 4.4
PHF23-201ENST00000320316 CEP162Q5TB80 1403 aa42.47■■■■■ 4.39
PHF23-201ENST00000320316 TOP2BQ02880 1626 aa42.46■■■■■ 4.39
PHF23-201ENST00000320316 GOLGA3Q08378 1498 aa42.45■■■■■ 4.39
PHF23-201ENST00000320316 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.37■■■■■ 4.37
PHF23-201ENST00000320316 KIF21BO75037 1637 aa42.33■■■■■ 4.37
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PHF23-201ENST00000320316 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.32■■■■■ 4.36
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PHF23-201ENST00000320316 PRXQ9BXM0 1461 aa41.8■■■■■ 4.28
PHF23-201ENST00000320316 KIF27Q86VH2 1401 aa41.78■■■■■ 4.28
PHF23-201ENST00000320316 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.63■■■■■ 4.26
PHF23-201ENST00000320316 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.58■■■■■ 4.25
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PHF23-201ENST00000320316 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.47■■■■■ 4.23
PHF23-201ENST00000320316 CUX2O14529 1486 aa41.45■■■■■ 4.23
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PHF23-201ENST00000320316 NESP48681 1621 aa41.29■■■■■ 4.2
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PHF23-201ENST00000320316 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.24■■■■■ 4.19
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PHF23-201ENST00000320316 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.06■■■■■ 4.16
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PHF23-201ENST00000320316 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP40.77■■■■■ 4.12
PHF23-201ENST00000320316 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.72■■■■■ 4.11
PHF23-201ENST00000320316 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.64■■■■■ 4.1
PHF23-201ENST00000320316 MAP3K1Q13233 1512 aa40.62■■■■■ 4.09
PHF23-201ENST00000320316 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP40.58■■■■■ 4.09
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PHF23-201ENST00000320316 TIAM1Q13009 1591 aa40.55■■■■■ 4.08
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PHF23-201ENST00000320316 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.54■■■■■ 4.08
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