Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
PKD2Q13563 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
PKD2Q13563 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC40.77■■■■■ 4.12
PKD2Q13563 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
PKD2Q13563 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.11
PKD2Q13563 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
PKD2Q13563 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC40.75■■■■■ 4.11
PKD2Q13563 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
PKD2Q13563 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
PKD2Q13563 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
PKD2Q13563 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
PKD2Q13563 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
PKD2Q13563 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
PKD2Q13563 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
PKD2Q13563 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
PKD2Q13563 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
PKD2Q13563 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
PKD2Q13563 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
PKD2Q13563 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.09
PKD2Q13563 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
PKD2Q13563 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC40.62■■■■■ 4.09
PKD2Q13563 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC40.62■■■■■ 4.09
PKD2Q13563 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
PKD2Q13563 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
PKD2Q13563 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
PKD2Q13563 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
PKD2Q13563 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
PKD2Q13563 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
PKD2Q13563 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
PKD2Q13563 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
PKD2Q13563 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
PKD2Q13563 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
PKD2Q13563 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
PKD2Q13563 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
PKD2Q13563 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
PKD2Q13563 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
PKD2Q13563 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC40.52■■■■■ 4.08
PKD2Q13563 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
PKD2Q13563 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
PKD2Q13563 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
PKD2Q13563 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
PKD2Q13563 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
PKD2Q13563 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
PKD2Q13563 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
PKD2Q13563 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
PKD2Q13563 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC40.4■■■■■ 4.06
PKD2Q13563 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
PKD2Q13563 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
PKD2Q13563 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
PKD2Q13563 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
PKD2Q13563 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
PKD2Q13563 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
PKD2Q13563 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
PKD2Q13563 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
PKD2Q13563 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
PKD2Q13563 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
PKD2Q13563 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
PKD2Q13563 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
PKD2Q13563 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
PKD2Q13563 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
PKD2Q13563 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
PKD2Q13563 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
PKD2Q13563 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
PKD2Q13563 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
PKD2Q13563 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
PKD2Q13563 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
PKD2Q13563 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
PKD2Q13563 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
PKD2Q13563 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
PKD2Q13563 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
PKD2Q13563 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
PKD2Q13563 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
PKD2Q13563 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
PKD2Q13563 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC40.19■■■■■ 4.02
PKD2Q13563 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
PKD2Q13563 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC40.18■■■■■ 4.02
PKD2Q13563 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
PKD2Q13563 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC40.17■■■■■ 4.02
PKD2Q13563 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
PKD2Q13563 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
PKD2Q13563 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
PKD2Q13563 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
PKD2Q13563 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
PKD2Q13563 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
PKD2Q13563 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
PKD2Q13563 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
PKD2Q13563 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
PKD2Q13563 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
PKD2Q13563 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
PKD2Q13563 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
PKD2Q13563 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
PKD2Q13563 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
PKD2Q13563 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
PKD2Q13563 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC40.06■■■■■ 4
PKD2Q13563 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
PKD2Q13563 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
PKD2Q13563 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
PKD2Q13563 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC40.01■■■■□ 3.99
PKD2Q13563 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
PKD2Q13563 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
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