Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC50.85■■■■■ 5.73
PKD2Q13563 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC50.75■■■■■ 5.71
PKD2Q13563 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC50.18■■■■■ 5.62
PKD2Q13563 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.38■■■■■ 5.5
PKD2Q13563 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.36■■■■■ 5.49
PKD2Q13563 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.16■■■■■ 5.46
PKD2Q13563 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.14■■■■■ 5.46
PKD2Q13563 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC48.97■■■■■ 5.43
PKD2Q13563 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.61■■■■■ 5.37
PKD2Q13563 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.43■■■■■ 5.34
PKD2Q13563 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC48.36■■■■■ 5.33
PKD2Q13563 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC48.3■■■■■ 5.32
PKD2Q13563 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.29■■■■■ 5.32
PKD2Q13563 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC47.74■■■■■ 5.23
PKD2Q13563 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
PKD2Q13563 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
PKD2Q13563 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC47.67■■■■■ 5.22
PKD2Q13563 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC47.62■■■■■ 5.21
PKD2Q13563 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.4■■■■■ 5.18
PKD2Q13563 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.39■■■■■ 5.18
PKD2Q13563 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC47.34■■■■■ 5.17
PKD2Q13563 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
PKD2Q13563 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
PKD2Q13563 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC46.97■■■■■ 5.11
PKD2Q13563 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.92■■■■■ 5.1
PKD2Q13563 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.09
PKD2Q13563 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.84■■■■■ 5.09
PKD2Q13563 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC46.84■■■■■ 5.09
PKD2Q13563 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC46.83■■■■■ 5.09
PKD2Q13563 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC46.63■■■■■ 5.06
PKD2Q13563 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.61■■■■■ 5.05
PKD2Q13563 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
PKD2Q13563 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC46.53■■■■■ 5.04
PKD2Q13563 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC46.45■■■■■ 5.03
PKD2Q13563 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC46.23■■■■■ 4.99
PKD2Q13563 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC46.22■■■■■ 4.99
PKD2Q13563 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
PKD2Q13563 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
PKD2Q13563 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC45.84■■■■■ 4.93
PKD2Q13563 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
PKD2Q13563 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC45.68■■■■■ 4.9
PKD2Q13563 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
PKD2Q13563 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
PKD2Q13563 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC45.4■■■■■ 4.86
PKD2Q13563 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.37■■■■■ 4.85
PKD2Q13563 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC45.34■■■■■ 4.85
PKD2Q13563 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
PKD2Q13563 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
PKD2Q13563 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
PKD2Q13563 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC45.02■■■■■ 4.8
PKD2Q13563 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
PKD2Q13563 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
PKD2Q13563 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC44.97■■■■■ 4.79
PKD2Q13563 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
PKD2Q13563 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
PKD2Q13563 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
PKD2Q13563 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
PKD2Q13563 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC44.73■■■■■ 4.75
PKD2Q13563 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC44.66■■■■■ 4.74
PKD2Q13563 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.65■■■■■ 4.74
PKD2Q13563 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC44.64■■■■■ 4.74
PKD2Q13563 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.6■■■■■ 4.73
PKD2Q13563 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.6■■■■■ 4.73
PKD2Q13563 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC44.59■■■■■ 4.73
PKD2Q13563 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
PKD2Q13563 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
PKD2Q13563 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.48■■■■■ 4.71
PKD2Q13563 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC44.46■■■■■ 4.71
PKD2Q13563 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC44.42■■■■■ 4.7
PKD2Q13563 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC44.4■■■■■ 4.7
PKD2Q13563 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.39■■■■■ 4.7
PKD2Q13563 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
PKD2Q13563 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC44.28■■■■■ 4.68
PKD2Q13563 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
PKD2Q13563 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.24■■■■■ 4.67
PKD2Q13563 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC44.21■■■■■ 4.67
PKD2Q13563 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
PKD2Q13563 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.16■■■■■ 4.66
PKD2Q13563 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
PKD2Q13563 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
PKD2Q13563 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC44.1■■■■■ 4.65
PKD2Q13563 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
PKD2Q13563 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
PKD2Q13563 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC44.03■■■■■ 4.64
PKD2Q13563 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC44■■■■■ 4.63
PKD2Q13563 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
PKD2Q13563 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC43.94■■■■■ 4.62
PKD2Q13563 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
PKD2Q13563 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
PKD2Q13563 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC43.84■■■■■ 4.61
PKD2Q13563 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
PKD2Q13563 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
PKD2Q13563 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
PKD2Q13563 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC43.79■■■■■ 4.6
PKD2Q13563 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
PKD2Q13563 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC43.74■■■■■ 4.59
PKD2Q13563 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC43.73■■■■■ 4.59
PKD2Q13563 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
PKD2Q13563 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC43.7■■■■■ 4.59
PKD2Q13563 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC43.69■■■■■ 4.58
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